Classification of Mouse Transcription Factors - Draft September 22, 2014 - |
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This classification is the working version that comprises only murine transcription factors (TFs) that have human orthologs, with few exceptions. In particular many mouse-specific TFs are still missing in Class 2.3 (C2H2 zinc finger factors). As for the classification of the human TFs, it may be subject to occasional changes, suggested for discussion.
Symbols / links: : TRANSFAC® class descriptions; : new class descriptions; : additional information about the class and its members (see below); : Link to reviewed mouse entries UniProt; : Link to unreviewed mouse entries UniProt; : Link to reviewed human UniProt entries; /: Link to reviewed/unreviewed rat UniProt entries, resp. "Txxxxx": TRANSFAC accession numbers, mostly linked to BIOBASE Knowledge Library (BKL); "T" only provides a link to a BKL entry that has no TRANSFAC accession yet. : Link to PDB; preferably to a complex of the corresponding DNA-binding domain (DBD) with DNA, provisionally the DBD alone, referring to the human or a mammalian ortholog; for a few excpetions, illustrative structures of fungal homologs are linked. Additional information: The question mark in the Class title line links to the class description, the sequences of the manually adjusted DNA-binding domains of this respective class and their alignments, logo plots and, whenever relevant, further information like dimerization matrices etc. DNA sequence patterns: The DNA sequences assigned to many families or subfamilies represent typical or proven individual binding sequences for (some of) the domains in the respective taxon. They should not be taken as a consensus, and they are not suitable for predicting potential TF binding sites. The logo plots after many TF genera have been derived from the profile library published by the group of J. Taipale at Karolinska Institute (Jolma et al., Cell 152, 327-339 (2013); PubMed 23332764) and were kindly provided by P. Stegmaier (geneXplain GmbH). Each of these plots is linked to an htm file with all matrices for this factor, human and mouse, that were given by Jolma et al., one of them being selected for the logo plot. The individual matrices are given a unique ID, comprising the gene symbol of the factor and an alphanumeric specification of the respective matrix, which may be either a consecutive number, or may have an additional "m" to indicate monomeric factor binding mode, "d" for dimers, or "dd" for dimers of dimers bound to the respective sequence patterns. For further explanation of the information provided with each matrix, kindly refer to the original publication. Citation: Wingender, E., Schoeps, T. and Dönitz, J.: TFClass: An expandable hierarchical classification of human transcription factors. Nucleic Acids Res. 41, D165-D170 (2013). doi: 10.1093/nar/gks1123 (Link) |
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1 | Superclass: Basic domains | ||||||||||||
1.1 | Class: Basic leucine zipper factors (bZIP) | ||||||||||||
1.1.1 | Family: Jun-related factors | TGAGTCA | |||||||||||
1.1.1.1 | Subfamily: Jun factors | TGAGTCA | |||||||||||
1.1.1.1.1 | c-Jun | T00131 | |||||||||||
1.1.1.1.2 | JunB | T00436 | |||||||||||
1.1.1.1.3 | JunD | T00437 | |||||||||||
1.1.1.2 | Subfamily: NF-E2-like factors | GCTGAGTCA | |||||||||||
1.1.1.2.1 | NF-E2 p45 | T01441 | |||||||||||
1.1.1.2.2 | NF-E2L1 (NRF1) | T02203 | |||||||||||
1.1.1.2.2.1 | NF-E2L1, isoform 1 (Nrf1a) | T09558 | |||||||||||
1.1.1.2.2.2 | NF-E2L1, isoform 2 (Nrf1b) | T28874 | |||||||||||
1.1.1.2.2.3 | NF-E2L1, isoform 3 (short) | T13800 | |||||||||||
1.1.1.2.3 | NF-E2L2 (NRF2) | T04938 | |||||||||||
1.1.1.2.4 | NF-E2L3 (NRF3) | T05710 | |||||||||||
1.1.1.2.5 | BACH1 | T04793 | |||||||||||
1.1.1.2.6 | BACH2 | T04792 | |||||||||||
1.1.1.3 | Subfamily: ATF-2-like factors | TGACGTCA | |||||||||||
1.1.1.3.1 | ATF-2 | T10238 | |||||||||||
1.1.1.3.1.1 | ATF-2, isoform 1 | T02056 | |||||||||||
1.1.1.3.1.2 | ATF-2, isoform 2 | T01017 | |||||||||||
1.1.1.3.1.3 | ATF-2, isoform 3 | T02036 | |||||||||||
1.1.1.3.2 | ATF-7 | T19847 | |||||||||||
1.1.1.3.3 | CREB-5 (CRE-BPa) | T18881 | |||||||||||
1.1.1.3.3.1 | CREB-5, isoform 1 | T18880 | |||||||||||
1.1.1.3.3.2 | CREB-5, isoform 2 | T18882 | |||||||||||
1.1.2 | Family: Fos-related factors | (TGAGTCA) | |||||||||||
1.1.2.1 | Subfamily: Fos factors | (TGAGTCA) | |||||||||||
1.1.2.1.1 | c-Fos | T00122 | |||||||||||
1.1.2.1.2 | FosB | T10574 | |||||||||||
1.1.2.1.3 | Fra-1 | T00292 | |||||||||||
1.1.2.1.4 | Fra-2 | T02199 | |||||||||||
1.1.2.1.4.1 | Fra-2, isoform 1 | T08535 | |||||||||||
1.1.2.1.4.2 | Fra-2, isoform 2 | T26121 | |||||||||||
1.1.2.2 | Subfamily: ATF-3-like factors | TGACGTCA | |||||||||||
1.1.2.2.1 | ATF-3 | T08977 | |||||||||||
1.1.2.2.1.1 | ATF-3, isoform 1 | T04850 | |||||||||||
1.1.2.2.1.2 | ATF-3, isoform 2 (ATF-3b) | T08976 | |||||||||||
1.1.2.2.2 | JDP-2 | T19034 | |||||||||||
1.1.3 | Family: Maf-related factors | TGCTGACTCAGCA | |||||||||||
1.1.3.1 | Subfamily: Large Maf factors | TGCTGACTCAGCA | |||||||||||
1.1.3.1.1 | c-Maf | T01432 | |||||||||||
1.1.3.1.1.1 | c-Maf, isoform 1 | T09212 | |||||||||||
1.1.3.1.1.2 | c-Maf, isoform 2 | T26181 | |||||||||||
1.1.3.1.1.3 | c-Maf, isoform 3 | T26182 | |||||||||||
1.1.3.1.2 | MafA | T08226 | |||||||||||
1.1.3.1.3 | MafB | T01439 | |||||||||||
1.1.3.1.4 | Nrl | T01438 | |||||||||||
1.1.3.2 | Subfamily: Small Maf factors | TGCTGACTCAGCA | |||||||||||
1.1.3.2.1 | MafF | T05751 | |||||||||||
1.1.3.2.2 | MafG | T05750 | |||||||||||
1.1.3.2.3 | MafK | T01435 | |||||||||||
1.1.4 | Family: B-ATF-related factors | TGAGTCA | |||||||||||
1.1.4.0.1 | B-ATF | T19854 | |||||||||||
1.1.4.0.2 | B-ATF-2 | T | |||||||||||
1.1.4.0.2.1 | B-ATF-2, isoform 1 | T | |||||||||||
1.1.4.0.2.2 | B-ATF-2, isoform 2 | T | |||||||||||
1.1.4.0.3 | B-ATF-3 | T18807 | |||||||||||
1.1.5 | Family: XBP-1-related factors | GGATGACGTGTACA | |||||||||||
1.1.5.0.1 | XBP-1 | T08152 | |||||||||||
1.1.5.0.1.1 | XBP-1U | T19362 | |||||||||||
1.1.5.0.1.2 | XBP-1S | T11222 | |||||||||||
1.1.6 | Family: ATF-4-related factors | TGACGTCA | |||||||||||
1.1.6.0.1 | ATF-4 | T08444 | |||||||||||
1.1.6.0.2 | ATF-5 | T16632 | |||||||||||
1.1.7 | Family: CREB-related factors | TGACGTCA | |||||||||||
1.1.7.1 | Subfamily: CREB-like factors | TGACGTCA | |||||||||||
1.1.7.1.1 | CREB (CREB-1) | T02280 | |||||||||||
1.1.7.1.1.1 | CREB, isoform 1 (CREBα) | T00989 | |||||||||||
1.1.7.1.1.2 | CREB, isoform 2 (CREBΔ) | T01311 | |||||||||||
1.1.7.1.1.3 | CREB, isoform 3 (CREBβ) | T02361 | |||||||||||
1.1.7.1.1.4 | CREB, isoform 4 (CREBω) | T01312 | |||||||||||
1.1.7.1.2 | ATF-1 | T01304 | |||||||||||
1.1.7.1.3 | CREM | T10306 | |||||||||||
1.1.7.1.3.1 | CREM-τ, isoform 1 (CREM-BCEFGγHIβ) | T01320 | |||||||||||
1.1.7.1.3.2 | CREM-α, isoform 2 | T01314 | |||||||||||
1.1.7.1.3.3 | CREM-β, isoform 3 | T01315 | |||||||||||
1.1.7.1.3.4 | CREM-γ, isoform 4 | T01316 | |||||||||||
1.1.7.1.3.5 | CREM-ταγ, isoform 5 | T26061 | |||||||||||
1.1.7.1.3.6 | CREM-τ2α, isoform 6 | T26062 | |||||||||||
1.1.7.1.3.7 | CREM-τ1α, isoform 7 | T26063 | |||||||||||
1.1.7.1.3.8 | CREM-τ1αγ, isoform 8 | T26064 | |||||||||||
1.1.7.1.3.9 | CREM-τ1γ, isoform 9 | T26065 | |||||||||||
1.1.7.1.3.10 | CREM-αγ, isoform 10 | T26376 | |||||||||||
1.1.7.2 | Subfamily: CREB-3-like factors | TGACGTCA | |||||||||||
1.1.7.2.1 | CREB-3 (Luman, LZIP) | T18876 | F | ||||||||||
1.1.7.2.1.1 | CREB-3, isoform 1 (LZIP-1) | T18875 | |||||||||||
1.1.7.2.1.2 | LZIP, isoform 2 (LZIP-2) | T18874 | |||||||||||
1.1.7.2.2 | CREB-3L1 (OASIS) | T18855 | |||||||||||
1.1.7.2.2.1 | CREB-3L1, isoform 1 | T18854 | |||||||||||
1.1.7.2.2.2 | CREB-3L1, isoform 2 | T18853 | |||||||||||
1.1.7.2.3 | CREB-3L2 | T15600 | |||||||||||
1.1.7.2.4 | CREB-3L3 (CREB-H) | T18861 | |||||||||||
1.1.7.2.5 | CREB-3L4 (AIBZIP) | T18868 | |||||||||||
1.1.7.2.5.1 | CREB-3L4, isoform 1 (Tisp40β) | T18866 | |||||||||||
1.1.7.2.5.2 | CREB-3L4, isoform 2 (Tisp40α) | T18867 | |||||||||||
1.1.7.3 | Subfamily: ATF-6 factors | TGACGTGG | |||||||||||
1.1.7.3.1 | ATF-6α | T26785 | |||||||||||
1.1.7.3.2 | ATF-6β | T18795 | |||||||||||
1.1.7.4 | Subfamily: CREBZF-like factors | TGACGTCA | |||||||||||
1.1.7.4.1 | CREBZF (Zhangfei, ZF) | T | |||||||||||
1.1.7.5 | Subfamily: CREBL2-like factors | TGACGTCA | |||||||||||
1.1.7.5.1 | CREBL2 | T19897 | |||||||||||
1.1.8 | Family: C/EBP-related | ATTGCGCAAT | |||||||||||
1.1.8.1 | Subfamily: C/EBP | ATTGCGCAAT | |||||||||||
1.1.8.1.1 | C/EBPα | T08464 | |||||||||||
1.1.8.1.2 | C/EBPβ (NF-IL6-1) | T09409 | |||||||||||
1.1.8.1.2.1 | C/EBPβ, isoform 1 (C/EBPβ-FL) | T00017 | |||||||||||
1.1.8.1.2.2 | C/EBPβ, isoform 2 (C/EBPβ-LAP) | ||||||||||||
1.1.8.1.2.3 | C/EBPβ, isoform 3 (C/EBPβ-LIP) | T02360 | |||||||||||
1.1.8.1.3 | C/EBPγ | T00216 | |||||||||||
1.1.8.1.4 | C/EBPδ | T01114 | |||||||||||
1.1.8.1.5 | C/EBPε | T16653 | |||||||||||
1.1.8.1.6 | DDIT3 (CHOP-10) | T00127 | |||||||||||
1.1.8.2 | Subfamily: PAR factors | TTATGCAA | |||||||||||
1.1.8.2.1 | DBP | T05865 | |||||||||||
1.1.8.2.2 | HLF | T19989 | |||||||||||
1.1.8.2.3 | TEF | T10579 | |||||||||||
1.1.8.2.3.1 | TEF-α | T10575 | |||||||||||
1.1.8.2.3.2 | TEF-β | T10576 | |||||||||||
1.1.8.2.3.3 | TEF, isoform 2 | T10577 | |||||||||||
1.1.8.2.4 | NF-IL3 (E4BP4) | T16464 | |||||||||||
1.1.0 | Family: ZIP only | ||||||||||||
1.1.0.1 | Subfamily: TSC22 | ||||||||||||
1.1.0.1.1 | TSC22D1 (TSC-22, Cerebral protein 2) | T27854 | |||||||||||
1.1.0.1.1.1 | TSC22D1, isoform 1 | T27936 | |||||||||||
1.1.0.1.1.2 | TSC22D1, isoform 2 | T27360 | |||||||||||
1.1.0.1.1.3 | TSC22D1, isoform 3 | T27937 | |||||||||||
1.1.0.1.2 | TSC22D2 (TILZ4) | T | |||||||||||
1.1.0.1.3 | TSC22D3 (DSIPI, GILZ) | T22155 | |||||||||||
1.1.0.1.3.1 | TSC22D3, isoform 1 (Tilz3b) | T25737 | |||||||||||
1.1.0.1.3.2 | TSC22D3, isoform 2 (Tilz3a) | T25738 | |||||||||||
1.1.0.1.3.3 | TSC22D3, isoform 3 (Tilz3c) | T25739 | |||||||||||
1.1.0.1.4 | TSC22D4 (TILZ2) | T | |||||||||||
1.1.0.2 | Subfamily: UTF | ||||||||||||
1.1.0.2.1 | UTF1 | T09523 | |||||||||||
1.1.0.2.1.1 | UTF1, isoform 1 | T08886 | |||||||||||
1.1.0.2.1.2 | UTF1, isoform 2 | T26349 | |||||||||||
1.2 | Class: Basic helix-loop-helix factors (bHLH) | ||||||||||||
1.2.1 | Family: E2A-related factors | CAGGTG | |||||||||||
1.2.1.0.1 | E2A (TCF-3, ITF-1) | T10541 | |||||||||||
1.2.1.0.1.1 | E12 (PAN-2) | T01786 | |||||||||||
1.2.1.0.1.2 | E47 (PAN-1) | T01788 | |||||||||||
1.2.1.0.2 | SEF2 (E2-2, TCF-4, ITF-2, MITF) | T19028 | |||||||||||
1.2.1.0.2.1 | SEF2, isoform 1 (MITF-2A) | T19025 | |||||||||||
1.2.1.0.2.2 | SEF2, isoform 2 (MITF-2B) | T19027 | |||||||||||
1.2.1.0.2.3 | SEF2, isoform 3 (MITF-2BΔ) | T19026 | |||||||||||
1.2.1.0.3 | HTF-4 (TCF-12, HEB) | T09513 | |||||||||||
1.2.1.0.3.1 | HTF-4a, isoform 1 (ME1A; α) | T01496 | |||||||||||
1.2.1.0.3.2 | HTF-4b, isoform 2 (ME1B; γ) | T01497 | |||||||||||
1.2.2 | Family: MyoD / ASC-related factors | CAGGTG | |||||||||||
1.2.2.1 | Subfamily: Myogenic transcription factors | ||||||||||||
1.2.2.1.1 | MyoD (Myod1) | T00506 | |||||||||||
1.2.2.1.2 | Myogenin (Myog, Myf-4) | T00528 | |||||||||||
1.2.2.1.3 | Myf-5 | T01534 | |||||||||||
1.2.2.1.4 | Myf-6 (MRF4) | T16555 | |||||||||||
1.2.2.2 | Subfamily: Achaete-Scute-like factors | ||||||||||||
1.2.2.2.1 | ASH-1 (ASCL1) | T01619 | |||||||||||
1.2.2.2.2 | ASH-2 (ASCL2) | T16775 | |||||||||||
1.2.2.2.3 | ASH-3 (ASCL3) | T19843 | |||||||||||
1.2.2.2.4 | ASH-4 (ASCL4) | T | |||||||||||
1.2.2.2.5 | ASH-5 (ASCL5) | T | |||||||||||
1.2.3 | Family: Tal-related factors | CAGCTG | |||||||||||
1.2.3.1 | Subfamily: Tal / HEN-like factors | CAGCTG | |||||||||||
1.2.3.1.1 | Tal-1 (SCL, TCL-5) | T16151 | |||||||||||
1.2.3.1.2 | Tal-2 | T01631 | |||||||||||
1.2.3.1.3 | Lyl-1 | T | |||||||||||
1.2.3.1.4 | HEN1 (NSCL-1, NHLH1) | T01655 | |||||||||||
1.2.3.1.5 | HEN2 (NSCL-2, NHLH2) | T01657 | |||||||||||
1.2.3.2 | Subfamily: Twist-like factors | CGTCTG | |||||||||||
1.2.3.2.1 | Twist-1 (H-Twist, M-Twist) | T01635 | |||||||||||
1.2.3.2.2 | Twist-2 (Dermo-1) | T02404 | |||||||||||
1.2.3.2.3 | HAND-1 (eHAND, Th1) | T01569 | |||||||||||
1.2.3.2.4 | HAND-2 (dHAND) | T04370 | |||||||||||
1.2.3.2.5 | bHLH-EC2 (TCF-15) | T01613 | |||||||||||
1.2.3.2.6 | Scx | T19232 | |||||||||||
1.2.3.2.7 | PTF-1a | T01227 | |||||||||||
1.2.3.2.8 | FIGα | T15614 | |||||||||||
1.2.3.3 | Subfamily: Mesp-like factors | ||||||||||||
1.2.3.3.1 | Mesp-1 | T20013 | |||||||||||
1.2.3.3.2 | Mesp-2 | T06095 | |||||||||||
1.2.3.3.3 | TCF-23 | T | |||||||||||
1.2.3.3.4 | ABF-1 (Musculin, MyoR, MSC) | T05193 | |||||||||||
1.2.3.3.5 | Pod-1 (TCF-21) | T19300 | |||||||||||
1.2.3.3.6 | Mesogenin-1 (MSGN1) | T20026 | |||||||||||
1.2.3.4 | Subfamily: Neurogenin / Atonal-like factors | CAGCTG | |||||||||||
1.2.3.4.1 | NeuroD1 | T01626 | |||||||||||
1.2.3.4.2 | NeuroD2 | T17539 | |||||||||||
1.2.3.4.3 | NeuroD4 (ATH-3) | T20046 | |||||||||||
1.2.3.4.4 | NeuroD6 (ATH-2) | T01629 | |||||||||||
1.2.3.4.5 | NGN-1 (NeuroD3) | T08093 | |||||||||||
1.2.3.4.6 | NGN-2 (Atoh4, NeuroG2) | T08094 | |||||||||||
1.2.3.4.7 | NGN-3 (Atoh5, NeuroG3) | T06058 | |||||||||||
1.2.3.4.8 | ATH-1 (ATOH-1) | T01668 | |||||||||||
1.2.3.4.9 | ATH-5 (ATOH-7) | T18802 | |||||||||||
1.2.3.4.10 | ATH-6 (ATOH-8) | T19852 | |||||||||||
1.2.3.4.11 | bHLHe22 (Beta3) | T | |||||||||||
1.2.3.4.12 | bHLHe23 | T | |||||||||||
1.2.3.4.13 | OLIGO1 | T05853 | |||||||||||
1.2.3.4.14 | OLIGO2 | T05852 | |||||||||||
1.2.3.4.15 | OLIGO3 | T20054 | |||||||||||
1.2.3.4.16 | MIST1 (bHLHa15) | T | |||||||||||
1.2.3.4.17 | Fer3L (Ferd3L) | T19925 | |||||||||||
1.2.3.5 | Subfamily: bHLHa9-like factors | ||||||||||||
1.2.3.5.1 | bHLHa9 | T | |||||||||||
1.2.4 | Family: Hairy-related factors | CACGAG | |||||||||||
1.2.4.1 | Subfamily: Hairy-like factors | CACGAG | |||||||||||
1.2.4.1.1 | HES-1 | T09896 | |||||||||||
1.2.4.1.2 | HES-2 | T | |||||||||||
1.2.4.1.3 | HES-3 | T05081 | |||||||||||
1.2.4.1.5 | HES-5 | T18965 | |||||||||||
1.2.4.1.6 | HES-6 | T27825 | |||||||||||
1.2.4.1.7 | HES-7 | T19984 | |||||||||||
1.2.4.1.8 | HEY-1 | T05077 | |||||||||||
1.2.4.1.9 | HEY-2 | T05083 | |||||||||||
1.2.4.1.10 | HEYL (HRT3) | T05082 | |||||||||||
1.2.4.1.11 | HELT | T16559 | |||||||||||
1.2.4.1.12 | DEC1 (STRA-13, bHLHb2) | T02327 | |||||||||||
1.2.4.1.13 | DEC2 (bHLHb3) | T05845 | |||||||||||
1.2.5 | Family: PAS domain factors | CACGC | |||||||||||
1.2.5.1 | Subfamily: Ahr-like factors | CACGC | |||||||||||
1.2.5.1.1 | AhR | T00194 | |||||||||||
1.2.5.1.2 | AhRR | T18746 | |||||||||||
1.2.5.1.2.1 | AhRR, isoform 1 | T05429 | |||||||||||
1.2.5.1.2.2 | AhRR, isoform 2 | T26012 | |||||||||||
1.2.5.1.2.3 | AhRR, isoform 3 | T26013 | |||||||||||
1.2.5.1.3 | SIM1 | T20110 | |||||||||||
1.2.5.1.4 | SIM2 | T19235 | |||||||||||
1.2.5.1.5 | HIF-1α | T04666 | |||||||||||
1.2.5.1.5.1 | HIF-1α, isoform 1 | T18977 | |||||||||||
1.2.5.1.5.2 | HIF-1α, isoform 2 | T26140 | |||||||||||
1.2.5.1.6 | HIF-3α | T18986 | |||||||||||
1.2.5.1.6.1 | HIF-3α, isoform 1 | T18988 | |||||||||||
1.2.5.1.6.2 | HIF-3α, isoform 2 | T18987 | |||||||||||
1.2.5.1.7 | EPAS-1 | T02719 | |||||||||||
1.2.5.1.8 | NPAS-1 | T05876 | |||||||||||
1.2.5.1.9 | NPAS-3 | T05878 | F | ||||||||||
1.2.5.2 | Subfamily: Arnt-like factors | CACGTG | |||||||||||
1.2.5.2.1 | Arnt (HIF-1β) | T01797 | |||||||||||
1.2.5.2.1.1 | Arnt long, isoform 1 | T10458 | |||||||||||
1.2.5.2.1.2 | Arnt short, isoform 2 | T18790 | |||||||||||
1.2.5.2.2 | Arnt-2 | T18787 | |||||||||||
1.2.5.2.2.1 | Arnt-2, isoform 1 | T18785 | |||||||||||
1.2.5.2.2.2 | Arnt-2, isoform 2 | T18786 | |||||||||||
1.2.5.2.3 | ArntL (Bmal1) | T05869 | |||||||||||
1.2.5.2.3.1 | ArntL, isoform 1 (b') | T10228 | |||||||||||
1.2.5.2.3.2 | ArntL, isoform 2 (b) | T18818 | |||||||||||
1.2.5.2.3.3 | ArntL, isoform 3 | T18819 | |||||||||||
1.2.5.2.3.4 | ArntL, isoform 4 | T18820 | |||||||||||
1.2.5.2.3.5 | ArntL, isoform 5 (g') | T18821 | |||||||||||
1.2.5.2.4 | ArntL2 (Bmal2) | T05874 | |||||||||||
1.2.5.2.4.1 | ArntL2, isoform 1 (Bmal2a) | T11140 | |||||||||||
1.2.5.2.4.2 | ArntL2, isoform 2 (Bmal2b) | T26045 | |||||||||||
1.2.5.2.5 | CLOCK | T05868 | |||||||||||
1.2.5.2.5.1 | CLOCK, isoform Long | T10259 | |||||||||||
1.2.5.2.5.2 | CLOCK, isoform Short | T18843 | |||||||||||
1.2.5.2.6 | NPAS-2 | T05877 | |||||||||||
1.2.5.3 | Subfamily: NCoA factors | ||||||||||||
1.2.5.3.1 | NCoA-1 (SRC-1) | T04639 | |||||||||||
1.2.5.3.1.1 | NCoA-1, isoform 1 (SRC-1A) | T25725 | |||||||||||
1.2.5.3.1.2 | NCoA-1, isoform 2 (SRC-1E) | T09181 | |||||||||||
1.2.5.3.1.3 | NCoA-1, isoform 3 | T26206 | |||||||||||
1.2.5.3.1.4 | NCoA-1, isoform 4 | T26207 | |||||||||||
1.2.5.3.2 | NCoA-2 | T02482 | |||||||||||
1.2.5.3.3 | NCoA-3 | T04638 | |||||||||||
1.2.5.4 | Subfamily: NPAS-4 | CACGA | |||||||||||
1.2.5.4.1 | NPAS-4 | T | |||||||||||
1.2.5.5 | Subfamily: SOHLH-like factors | ||||||||||||
1.2.5.5.1 | SOHLH1 (TEB2) | T20117 | |||||||||||
1.2.5.5.2 | SOHLH2 (TEB1) | T19246 | |||||||||||
1.2.5.5.3 | TCFL5 (Cha, E2BP-1) | T17742 | F | ||||||||||
1.2.6 | Family: bHLH-ZIP factors | CACATG | |||||||||||
1.2.6.1 | Subfamily: TFE3-like factors | CACATG | |||||||||||
1.2.6.1.1 | TFE3 (TFEA) | T09192 | |||||||||||
1.2.6.1.1.1 | TFE3, isoform 1 | T19333 | |||||||||||
1.2.6.1.1.2 | TFE3, isoform 2 | T26336 | |||||||||||
1.2.6.1.1.3 | TFE3, isoform 3 | T26337 | |||||||||||
1.2.6.1.1.4 | TFE3, isoform 4 | T26338 | |||||||||||
1.2.6.1.2 | TFEB | T06082 | |||||||||||
1.2.6.1.3 | TFEC | T14666 | |||||||||||
1.2.6.1.4 | MiTF | T01554 | |||||||||||
1.2.6.1.4.1 | MiTF, isoform A | T19067 | |||||||||||
1.2.6.1.4.2 | MiTF, isoform A1 | T19068 | |||||||||||
1.2.6.1.4.3 | MiTF, isoform A2 | T19066 | |||||||||||
1.2.6.1.4.4 | MiTF, isoform H | T19065 | |||||||||||
1.2.6.1.4.5 | MiTF, isoform H1 | T19069 | |||||||||||
1.2.6.1.4.6 | MiTF, isoform H2 | T19070 | |||||||||||
1.2.6.1.4.7 | MiTF, isoform H3 | T19071 | |||||||||||
1.2.6.1.4.8 | MiTF, isoform M | T09287 | |||||||||||
1.2.6.1.4.9 | MiTF, isoform M1 | T19072 | |||||||||||
1.2.6.2 | Subfamily: USF factors | CACGTG | |||||||||||
1.2.6.2.1 | USF-1 | T00877 | |||||||||||
1.2.6.2.2 | USF-2 | T01555 | |||||||||||
1.2.6.2.2.1 | USF-2A | T08315 | |||||||||||
1.2.6.2.2.2 | USF-2B | T11000 | |||||||||||
1.2.6.3 | Subfamily: SREBP factors | ATCACCCCAC | |||||||||||
1.2.6.3.1 | SREBP-1 (SREBF1) | T10488 | |||||||||||
1.2.6.3.1.1 | SREBP-1A | T15263 | |||||||||||
1.2.6.3.1.2 | SREBP-1A-W42 | T26305 | |||||||||||
1.2.6.3.1.3 | SREBP-1C | T08890 | |||||||||||
1.2.6.3.1.4 | SREBP-1C-W42 | T26306 | |||||||||||
1.2.6.3.2 | SREBP-2 (SREBF2) | T15631 | |||||||||||
1.2.6.3.2.1 | SREBP-2, isoform 1 | T19272 | |||||||||||
1.2.6.3.2.2 | SREBP-2, isoform 2 | T26307 | |||||||||||
1.2.6.4 | Subfamily: AP-4 | CAGCTG | |||||||||||
1.2.6.4.1 | AP-4 | T16526 | |||||||||||
1.2.6.5 | Subfamily: Myc / Max factors | CACGTG | |||||||||||
1.2.6.5.1 | c-Myc | T00143 | |||||||||||
1.2.6.5.2 | N-Myc | T01445 | |||||||||||
1.2.6.5.3 | L-Myc-1 | T02387 | |||||||||||
1.2.6.5.5 | Max | T16608 | |||||||||||
1.2.6.5.6 | B-Myc | T10695 | |||||||||||
1.2.6.6 | Subfamily: Mondo-like factors | CACGTG | |||||||||||
1.2.6.6.1 | Mlx (Tcfl4) | T05123 | |||||||||||
1.2.6.6.1.1 | Mlxα | T19092 | |||||||||||
1.2.6.6.1.2 | Mlxβ | T08952 | |||||||||||
1.2.6.6.1.3 | Mlxγ | T19093 | |||||||||||
1.2.6.6.2 | MondoA (Mlx-IP) | T05125 | |||||||||||
1.2.6.6.2.1 | Mlx-IP, isoform 1 | T18651 | |||||||||||
1.2.6.6.2.2 | Mlx-IP, isoform 2 | T18652 | |||||||||||
1.2.6.6.3 | MondoB (Mlx-IPL, WS-bHLH) | T05122 | |||||||||||
1.2.6.6.3.1 | Mlx-IPL, isoform 1 (ζ) | T14593 | |||||||||||
1.2.6.6.3.2 | Mlx-IPL, isoform 2 (ϑ) | T26195 | |||||||||||
1.2.6.6.3.3 | Mlx-IPL, isoform 3 (ι) | T26196 | |||||||||||
1.2.6.6.3.4 | Mlx-IPL, isoform 4 (κ) | T26197 | |||||||||||
1.2.6.6.3.5 | Mlx-IPL, isoform 5 (η) | T26198 | |||||||||||
1.2.6.7 | Subfamily: Mad-like factors | CACGTG | |||||||||||
1.2.6.7.1 | Mad1 (MXD1) | T02390 | |||||||||||
1.2.6.7.2 | Mad3 (MXD3) | T02391 | |||||||||||
1.2.6.7.3 | Mad4 (MXD4) | T02392 | |||||||||||
1.2.6.7.4 | Mad5 (MGA) = 6.5.5.0.2 | T03940 | |||||||||||
1.2.6.7.4.1 | Mad5, isoform 1 | T14744 | |||||||||||
1.2.6.7.4.2 | Mad5, isoform 2 | T26191 | |||||||||||
1.2.6.7.4.3 | Mad5, isoform 3 | T26192 | |||||||||||
1.2.6.7.4.4 | Mad5, isoform 4 | T26193 | |||||||||||
1.2.6.7.5 | Mxi-1 | T09074 | |||||||||||
1.2.6.7.5.1 | Mxi-1, isoform 1 (long) | T09075 | |||||||||||
1.2.6.7.5.2 | Mxi-1, isoform 2 (short) | T09076 | |||||||||||
1.2.6.7.6 | Mnt | T03269 | F | ||||||||||
1.2.8 | Family: HLH domain only | ||||||||||||
1.2.8.0.1 | Id1 | T00403 | |||||||||||
1.2.8.0.1.1 | Id1, isoform Long | T25726 | |||||||||||
1.2.8.0.1.2 | Id1, isoform Short | T09185 | |||||||||||
1.2.8.0.2 | Id2 | T00404 | |||||||||||
1.2.8.0.3 | Id3 | T00367 | |||||||||||
1.2.8.0.4 | Id4 | T01658 | |||||||||||
1.3 | Class: Basic helix-span-helix factors (bHSH) | ||||||||||||
1.3.1 | Family: AP-2 | GCCTGAGGC | |||||||||||
1.3.1.0.1 | AP-2α | T10025 | |||||||||||
1.3.1.0.1.1 | AP-2α, isoform 1 | T00033 | |||||||||||
1.3.1.0.1.2 | AP-2α, isoform 2 | T02488 | |||||||||||
1.3.1.0.1.3 | AP-2α, isoform 3 | T02489 | |||||||||||
1.3.1.0.1.4 | AP-2α, isoform 4 | T02490 | |||||||||||
1.3.1.0.2 | AP-2β | T02469 | |||||||||||
1.3.1.0.3 | AP-2γ | T02470 | |||||||||||
1.3.1.0.4 | AP-2δ | T06431 | |||||||||||
1.3.1.0.5 | AP-2ε | T16752 | |||||||||||
2 | Superclass: Zinc-coordinating DNA-binding domains | ||||||||||||
2.1 | Class: Nuclear receptors with C4 zinc fingers | ||||||||||||
2.1.1 | Family: Steroid hormone receptors (NR3) | ||||||||||||
2.1.1.1 | Subfamily: GR-like receptors (NR3C) | AGAACATGATGTTCT | |||||||||||
2.1.1.1.1 | Glucocorticoid receptor (GR) (NR3C1) | T00335 | |||||||||||
2.1.1.1.1.1 | GR, isoform 1 (A, 1-A) | T08555 | |||||||||||
2.1.1.1.1.2 | GR, isoform 2 (B, 2-A) | T18951 | |||||||||||
2.1.1.1.1.3 | GR, isoform 1-B | ||||||||||||
2.1.1.1.1.4 | GR, isoform 2-B | ||||||||||||
2.1.1.1.2 | Mineralocorticoid receptor (MR) (NR3C2) | T17766 | |||||||||||
2.1.1.1.3 | Progesterone receptor (PR) (NR3C3) | T04680 | |||||||||||
2.1.1.1.4 | Androgen receptor (AR) (NR3C4) | T00041 | |||||||||||
2.1.1.2 | Subfamily: ER-like receptors (NR3A&B) | AGGTCACAGTGACCT | |||||||||||
2.1.1.2.1 | Estrogen receptor α (ERα) (ESR1, NR3A1) | T00259 | |||||||||||
2.1.1.2.2 | Estrogen receptor β (ERβ) (NR3A2) | T17427 | |||||||||||
2.1.1.2.2.1 | ERβ1, isoform 1 | T18909 | |||||||||||
2.1.1.2.2.2 | ERβ2, isoform 2 | T18910 | |||||||||||
2.1.1.2.2.3 | ERβ2A, isoform 3 (5A) | T18912 | |||||||||||
2.1.1.2.2.4 | ERβ3, isoform 4 | T26417 | |||||||||||
2.1.1.2.2.5 | ERβ4, isoform 5 | T26418 | |||||||||||
2.1.1.2.3 | ERR1 (ERRα, ESRRA) (NR3B1) | T04849 | |||||||||||
2.1.1.2.4 | ERR2 (ERRβ, ESRRB) (NR3B2) | T06175 | |||||||||||
2.1.1.2.5 | ERR3 (ERRγ, ESRRG) (NR3B3) | T14585 | |||||||||||
2.1.1.2.5.1 | ERR3, isoform 1 | T04644 | |||||||||||
2.1.1.2.5.2 | ERR3, isoform 2 | T04647 | |||||||||||
2.1.2 | Family: Thyroid hormone receptor-related factors (NR1) | ||||||||||||
2.1.2.1 | Subfamily: Retinoic acid receptors (NR1B) | TGACCTTTGACCT | |||||||||||
2.1.2.1.1 | RAR-α (NR1B1) | T01327 | |||||||||||
2.1.2.1.1.1 | RAR-α1 | T01335 | |||||||||||
2.1.2.1.1.2 | RAR-α2 | T01336 | |||||||||||
2.1.2.1.2 | RAR-β (NR1B2) | T01328 | |||||||||||
2.1.2.1.2.1 | RAR-β1 | T01337 | |||||||||||
2.1.2.1.2.2 | RAR-β2 | T01338 | |||||||||||
2.1.2.1.2.3 | RAR-β3 | T01339 | |||||||||||
2.1.2.1.2.4 | RAR-β4 | T01361 | |||||||||||
2.1.2.1.3 | RAR-γ (NR1B3) | T01329 | |||||||||||
2.1.2.1.3.1 | RAR-γ, isoform 1 (A) | T01340 | |||||||||||
2.1.2.1.3.2 | RAR-γ, isoform 2 (B) | T26259 | |||||||||||
2.1.2.1.3.3 | RAR-γ, isoform 3 | T26260 | |||||||||||
2.1.2.2 | Subfamily: Thyroid hormone receptors (NR1A) | TGACCTGAAATGACCT | |||||||||||
2.1.2.2.1 | T3R-α (THRA) (NR1A1) | T08894 | |||||||||||
2.1.2.2.1.1 | T3R-α1 | T00836 | |||||||||||
2.1.2.2.1.2 | T3R-α2 | T01173 | |||||||||||
2.1.2.2.1.3 | T3R-α3 | T17546 | |||||||||||
2.1.2.2.1.4 | T3R-αΔE6 | T26340 | |||||||||||
2.1.2.2.2 | T3R-β (NR1A2) | T08896 | |||||||||||
2.1.2.2.2.1 | T3R-β1 | T04722 | |||||||||||
2.1.2.2.2.2 | T3R-β2 | T04723 | |||||||||||
2.1.2.3 | Subfamily: Rev-ErbA (NR1D) | TGACCTAGTGACCT | |||||||||||
2.1.2.3.1 | Rev-ErbAα (NR1D1) | T06117 | |||||||||||
2.1.2.3.2 | Rev-ErbAβ (NR1D2) | T04896 | |||||||||||
2.1.2.4 | Subfamily: Vitamin D receptor (NR1I) | TGACCTTCGTGACCT | |||||||||||
2.1.2.4.1 | VDR (NR1I1) | T00883 | |||||||||||
2.1.2.4.2 | PXR (NR1I2) | T08235 | |||||||||||
2.1.2.4.2.1 | PXR, isoform 1 (PXR.1) | T04618 | |||||||||||
2.1.2.4.2.2 | PXR, isoform 2 (PXR.2) | T04619 | |||||||||||
2.1.2.4.3 | CAR (NR1I3) | T05687 | |||||||||||
2.1.2.4.3.1 | CAR1 | T08261 | |||||||||||
2.1.2.4.3.2 | CAR2 | T02755 | |||||||||||
2.1.2.5 | Subfamily: PPAR (NR1C) | TGACCTTTGACCT | |||||||||||
2.1.2.5.1 | PPARα (NR1C1) | T00694 | |||||||||||
2.1.2.5.2 | PPARβ (PPARδ) (NR1C2) | T04781 | |||||||||||
2.1.2.5.3 | PPARγ (NR1C3) | T05347 | |||||||||||
2.1.2.5.3.1 | PPARγ1, isoform 1 | T02529 | |||||||||||
2.1.2.5.3.2 | PPARγ2, isoform 2 | T05332 | |||||||||||
2.1.2.6 | Subfamily: ROR (NR1F) | TGACCTACTTAT | |||||||||||
2.1.2.6.1 | RORα (NR1F1) | T06119 | F | ||||||||||
2.1.2.6.1.1 | RORα1 | T09284 | |||||||||||
2.1.2.6.1.2 | RORα2 | ||||||||||||
2.1.2.6.1.3 | RORα3 | ||||||||||||
2.1.2.6.1.4 | RORα4 | T15650 | |||||||||||
2.1.2.6.2 | RORβ (NR1F2) | T17581 | |||||||||||
2.1.2.6.2.1 | RORβ, isoform 1 | T19213 | |||||||||||
2.1.2.6.2.2 | RORβ, isoform 2 | T17683 | |||||||||||
2.1.2.6.3 | RORγ (NR1F3) | T10351 | |||||||||||
2.1.2.6.3.1 | RORγ, isoform 1 | T06118 | |||||||||||
2.1.2.6.3.2 | RORγ, isoform 2 (RORgT) | T10350 | |||||||||||
2.1.2.7 | Subfamily: LXR (NR1H) | TGACCTCTACTGACCT | |||||||||||
2.1.2.7.1 | LXRα (NR1H3) | T04430 | |||||||||||
2.1.2.7.2 | LXRβ (NR1H2) | T04467 | |||||||||||
2.1.2.7.3 | FXR (NR1H4) | T02753 | |||||||||||
2.1.2.7.3.1 | FXR, isoform 1 | T09890 | |||||||||||
2.1.2.7.3.2 | FXR, isoform 2 | T09299 | |||||||||||
2.1.3 | Family: RXR-related receptors (NR2) | (TGACCT) | |||||||||||
2.1.3.1 | Subfamily: Retinoid X receptors (NR2B) | (TGACCT) | |||||||||||
2.1.3.1.1 | RXRα (NR2B1) | T01331 | |||||||||||
2.1.3.1.2 | RXRβ (NR2B2) | T01332 | F | ||||||||||
2.1.3.1.2.1 | RXRβ1, isoform long | T02779 | |||||||||||
2.1.3.1.2.2 | RXRβ2, isoform short | T01366 | |||||||||||
2.1.3.1.3 | RXRγ (NR2B3) | T01333 | |||||||||||
2.1.3.2 | Subfamily: HNF-4 (NR2A) | AGTCCAAAGTTCA | |||||||||||
2.1.3.2.1 | HNF-4α (NR2A1) | T01181 | |||||||||||
2.1.3.2.1.1 | HNF-4α, isoform long | T28928 | |||||||||||
2.1.3.2.1.2 | HNF-4α, isoform short | T26145 | |||||||||||
2.1.3.2.2 | HNF-4γ (NR2A2) | T06235 | |||||||||||
2.1.3.3 | Subfamily: Tailless-like receptors (NR2E) | TGACCTTTGACCT | |||||||||||
2.1.3.3.1 | Tlx (NR2E1) | T02357 | |||||||||||
2.1.3.3.2 | PNR (NR2E3) | T04861 | |||||||||||
2.1.3.4 | Subfamily: Testicular receptors (NR2C) | TGACCTCTGACCT | |||||||||||
2.1.3.4.1 | TR2 (NR2C1) | T04847 | |||||||||||
2.1.3.4.1.1 | TR2-11, isoform 1 | T11074 | |||||||||||
2.1.3.4.1.2 | TR2-9, isoform 2 (TR2-11-t) | T11075 | |||||||||||
2.1.3.4.2 | TR4 (NR2C2) | T16549 | |||||||||||
2.1.3.5 | Subfamily: COUP-like receptors (NR2F) | TGACCTTTGACCT | |||||||||||
2.1.3.5.1 | COUP-TFI (NR2F1) | T00994 | |||||||||||
2.1.3.5.2 | COUP-TFII (NR2F2) | T06154 | |||||||||||
2.1.3.5.3 | EAR2 (NR2F6) | T06163 | |||||||||||
2.1.4 | Family: NGFI-B-related receptors (NR4) | TGACCTTT | |||||||||||
2.1.4.0.1 | NGFI-B (Nur77, NR4A1) | T01348 | |||||||||||
2.1.4.0.2 | NURR1 (NR4A2) | T10226 | |||||||||||
2.1.4.0.2.1 | NURR1, isoform 1 | T04312 | |||||||||||
2.1.4.0.2.2 | NURR1, isoform 2 (NURR1A) | T10247 | |||||||||||
2.1.4.0.3 | NOR1 (NR4A3, TEC) | T15963 | |||||||||||
2.1.4.0.3.1 | NOR1, isoform α (long) | T19145 | |||||||||||
2.1.4.0.3.2 | NOR1, isoform β (short, TECΔC) | T19146 | |||||||||||
2.1.5 | Family: FTZ-F1-related receptors (NR5) | TGACCTTG | |||||||||||
2.1.5.0.1 | FTZ-F1 (SF-1) (NR5A1) | T08551 | |||||||||||
2.1.5.0.1.1 | FTZ-F1, isoform 1 | T09519 | |||||||||||
2.1.5.0.1.2 | FTZ-F1, isoform 2 | T25132 | |||||||||||
2.1.5.0.2 | LRH-1 (NR5A2) | T04754 | |||||||||||
2.1.6 | Family: GCNF-related receptors (NR6) | TGAACTTGACTTGA | |||||||||||
2.1.6.0.1 | GCNF (NR6A1) | T15701 | F | ||||||||||
2.1.6.0.1.1 | GCNF, isoform 1 | T02772 | |||||||||||
2.1.6.0.1.2 | GCNF, isoform 2 | T26225 | |||||||||||
2.1.6.0.1.3 | GCNF, isoform 3 | T26226 | |||||||||||
2.1.7 | Family: DAX-related receptors (NR0) | TGACCTT | |||||||||||
2.1.7.0.1 | DAX1 (NR0B1) | T04677 | |||||||||||
2.1.7.0.2 | SHP (NR0B2) | T05321 | |||||||||||
2.2 | Class: Other C4 zinc finger-type factors | ||||||||||||
2.2.1 | Family: GATA-type zinc fingers | ||||||||||||
2.2.1.1 | Subfamily: Two zinc-finger GATA factors | AGATAA | |||||||||||
2.2.1.1.1 | GATA-1 (GF-1, EryF1, NF-E1) | T00305 | |||||||||||
2.2.1.1.1.1 | GATA-1, isoform 1 | T08291 | |||||||||||
2.2.1.1.1.2 | GATA-1, isoform 2 (GATA-1s) | T26130 | |||||||||||
2.2.1.1.2 | GATA-2 | T01302 | |||||||||||
2.2.1.1.3 | GATA-3 | T00310 | |||||||||||
2.2.1.1.4 | GATA-4 | T02532 | |||||||||||
2.2.1.1.5 | GATA-5 | T02685 | |||||||||||
2.2.1.1.6 | GATA-6 | T02686 | |||||||||||
2.2.1.1.6.1 | GATA-6, isoform 1 | T10208 | |||||||||||
2.2.1.1.6.2 | GATA-6, isoform 2 | T26132 | |||||||||||
2.2.1.2 | Subfamily: Single GATA-type zinc-finger | AGATAA | |||||||||||
2.2.1.2.1 | GATAD1 (ODAG) | T | |||||||||||
2.2.1.2.1.1 | GATAD1, isoform 1 | T | |||||||||||
2.2.1.2.1.2 | GATAD1, isoform 2 | T | |||||||||||
2.2.1.2.2 | p66-α (GATAD2A) | T | |||||||||||
2.2.1.2.3 | p66-β (GATAD2B) | T | |||||||||||
2.2.1.2.3.1 | p66-β, isoform 1 | T | |||||||||||
2.2.1.2.3.2 | p66-β, isoform 2 | T | |||||||||||
2.2.1.2.4 | RERE (ARG, ARP, ATN1L) = 3.5.1.3.7 | T | |||||||||||
2.2.1.2.5 | MTA1 = 3.5.1.3.4 | T27821 | |||||||||||
2.2.1.2.6 | MTA2 (MTA1L1, PID) = 3.5.1.3.5 | T | |||||||||||
2.2.1.2.7 | MTA3 = 3.5.1.3.6 | T27832 | F | ||||||||||
2.2.1.2.7.1 | MTA3, isoform 1 | T27227 | |||||||||||
2.2.1.2.7.2 | MTA3, isoform 2 | T27228 | |||||||||||
2.2.1.2.8 | ZGLP1 (GLP-1) | T | |||||||||||
2.2.1.2.9 | DNMT3A | T27827 | |||||||||||
2.2.1.2.9.1 | DNMT3A, isoform 1 | T27196 | |||||||||||
2.2.1.2.9.2 | DNMT3A, isoform 2 | T27868 | |||||||||||
2.2.1.2.10 | DNMT3B | T | |||||||||||
2.2.1.2.10.1 | DNMT3B, isoform 1 | T | |||||||||||
2.2.1.2.10.2 | DNMT3B, isoform 2 | T | |||||||||||
2.2.1.2.10.3 | DNMT3B, isoform 3 | T | |||||||||||
2.2.1.2.10.4 | DNMT3B, isoform 4 | T | |||||||||||
2.2.1.2.11 | DNMT3L | T | |||||||||||
2.2.1.2.12 | ATRX (RAD54L, XH2) | T | |||||||||||
2.2.1.2.13 | TRPS1 (GC79) = 2.3.4.0.20 | T19349 | |||||||||||
2.3 | Class: C2H2 zinc finger factors | ||||||||||||
2.3.1 | Family: Three-zinc finger Krüppel-related factors | ||||||||||||
2.3.1.1 | Subfamily: Sp1-like factors | GGGGCGGGG | |||||||||||
2.3.1.1.1 | Sp1 | T00752 | |||||||||||
2.3.1.1.1.1 | Sp1, isoform 1 | T09118 | |||||||||||
2.3.1.1.1.2 | Sp1, isoform 2 (Sp1-S) | T11472 | |||||||||||
2.3.1.1.2 | Sp2 | T06543 | |||||||||||
2.3.1.1.2.1 | Sp2, isoform 1 | T10134 | |||||||||||
2.3.1.1.2.2 | Sp2, isoform 2 | T10135 | |||||||||||
2.3.1.1.3 | Sp3 | T05840 | F | ||||||||||
2.3.1.1.3.1 | Sp3, isoform 1 (L-Sp3) | T19262 | |||||||||||
2.3.1.1.3.2 | Sp3, isoform 2 | T19261 | |||||||||||
2.3.1.1.3.3 | Sp3, isoform 3 (M1-Sp3) | T26303 | |||||||||||
2.3.1.1.4 | Sp4 | T02414 | |||||||||||
2.3.1.1.5 | Sp5 | T19265 | |||||||||||
2.3.1.1.6 | Sp6 | T05074 | |||||||||||
2.3.1.1.7 | Sp7 | T20132 | |||||||||||
2.3.1.1.8 | Sp8 | T27853 | |||||||||||
2.3.1.1.9 | Sp9 | T | |||||||||||
2.3.1.1.9.1 | Sp9, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.1.1.9.2 | Sp9, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.1.2 | Subfamily: Krüppel-like factors | CCACACCCT | |||||||||||
2.3.1.2.1 | KLF1 (EKLF) | T01676 | |||||||||||
2.3.1.2.2 | KLF2 (LKLF) | T01677 | |||||||||||
2.3.1.2.3 | KLF3 (BKLF) | T10980 | |||||||||||
2.3.1.2.4 | KLF4 (GKLF) | T02450 | |||||||||||
2.3.1.2.5 | KLF5 (CKLF, IKLF, BTEB2) | T05054 | |||||||||||
2.3.1.2.6 | KLF6 (CPBP, BCD1) | T19036 | |||||||||||
2.3.1.2.7 | KLF7 (UKLF) | T26756 | F | ||||||||||
2.3.1.2.8 | KLF8 (BKLF) | T20006 | |||||||||||
2.3.1.2.9 | KLF9 (BTEB1) | T04700 | |||||||||||
2.3.1.2.10 | KLF10 (TIEG1) | T15844 | |||||||||||
2.3.1.2.11 | KLF11 (FKLF, TIEG2) | T17849 | |||||||||||
2.3.1.2.12 | KLF12 (AP-2rep) | T04701 | |||||||||||
2.3.1.2.13 | KLF13 (BTEB3, NSLP1) | T05052 | |||||||||||
2.3.1.2.14 | KLF14 (BTEB5) | T20000 | |||||||||||
2.3.1.2.15 | KLF15 (KKLF) | T20002 | |||||||||||
2.3.1.2.16 | KLF16 (BTEB4, NSLP2) | T05053 | |||||||||||
2.3.1.2.17 | KLF17 | T20004 | |||||||||||
2.3.1.3 | Subfamily: EGR factors | GCGTGGGCG | |||||||||||
2.3.1.3.1 | EGR1 (Krox-24, Zif268) | T10013 | |||||||||||
2.3.1.3.2 | EGR2 (Krox-20) | T00454 | |||||||||||
2.3.1.3.2.1 | EGR2, isoform long | T25981 | |||||||||||
2.3.1.3.2.2 | EGR2, isoform short | T08340 | |||||||||||
2.3.1.3.3 | EGR3 (PILOT) | T05539 | |||||||||||
2.3.1.3.4 | EGR4 | T19919 | |||||||||||
2.3.2 | Family: Other factors with up to three adjacent zinc fingers | ||||||||||||
2.3.2.1 | Subfamily: Factors with 2-3 adjacent zinc fingers and a BTB/POZ domain |
TCCTGCTA | |||||||||||
2.3.2.1.1 | ZBTB5 [2] | T19397 | |||||||||||
2.3.2.1.2 | ZBTB8B [2] | T | |||||||||||
2.3.2.1.6 | ZBTB22 (ZNF297, BING1) [3] | T19377 | |||||||||||
2.3.2.1.7 | ZBTB32 (ZNF538, FAZF) [3] | T15957 | |||||||||||
2.3.2.1.7.1 | ZBTB32, isoform 1 | T15956 | |||||||||||
2.3.2.1.7.2 | ZBTB32, isoform 2 | T15958 | |||||||||||
2.3.2.1.8 | ZBTB34 [3] | T | |||||||||||
2.3.2.1.9 | ZBTB37 [3] | T | |||||||||||
2.3.2.1.10 | ZBTB43 (ZBTB22B, ZNF297B) [3] | T19385 | |||||||||||
2.3.2.1.11 | ZBTB46 (BTBD4, ZNF340) [2] | T | |||||||||||
2.3.2.1.11.1 | ZBTB46, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.2.1.11.2 | ZBTB46, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.2.1.12 | ZBTB33 (KAISO, ZNF348) [3] | T08299 | |||||||||||
2.3.2.2 | Subfamily: Factors with 2-3 adjacent zinc fingers and a KRAB domain |
||||||||||||
2.3.2.3 | Subfamily: Factors with 2-3 adjacent zinc fingers and a SCAN domain |
||||||||||||
2.3.2.4 | Subfamily: Other three adjacent zinc finger factors | ||||||||||||
2.3.2.4.1 | ZNF414 (Zfp414) [3] | T20584 | |||||||||||
2.3.2.4.1.1 | ZNF414, isoform 1 | T20583 | |||||||||||
2.3.2.4.1.2 | ZNF414, isoform 2 | T20585 | |||||||||||
2.3.2.4.2 | ZNF511 (Zfp511) [3] | T | |||||||||||
2.3.2.4.2.1 | ZNF511, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.2.4.2.2 | ZNF511, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.2.4.3 | ZNF580 (Zfp580) [3] | T19527 | |||||||||||
2.3.2.4.5 | ZNF740 (ZFP740) [3] | T16895 | |||||||||||
2.3.2.4.5.1 | ZNF740, isoform 1 | T16894 | |||||||||||
2.3.2.4.5.2 | ZNF740, isoform 2 | T16897 | |||||||||||
2.3.2.4.5.3 | ZNF740, isoform 3 | T16898 | |||||||||||
2.3.2.4.6 | ZFPM2 (ZNF89B, FOG2) = 2.7.2.0.2 [3] | T18922 | F | ||||||||||
2.3.2.4.6.1 | ZFPM2, isoform 1 | T18923 | |||||||||||
2.3.2.4.6.2 | ZFPM2, isoform 2 | T18924 | |||||||||||
2.3.2.4.6.3 | ZFPM2, isoform 3 | T18925 | |||||||||||
2.3.2.4.7 | OSR1 (ODD) [3] | T16932 | |||||||||||
2.3.2.4.8 | OVOL3 (OVL2L) [4] | T | F, ? | ||||||||||
2.3.2.4.9 | AEBP2 [2] | T18741 | |||||||||||
2.3.2.4.9.1 | AEBP2, isoform 1 | T18740 | |||||||||||
2.3.2.4.9.2 | AEBP2, isoform 2 | T18736 | |||||||||||
2.3.2.4.9.3 | AEBP2, isoform 3 | T18737 | |||||||||||
2.3.2.4.9.4 | AEBP2, isoform 4 | T18738 | |||||||||||
2.3.2.4.9.5 | AEBP2, isoform 5 | T18739 | |||||||||||
2.3.3 | Family: More than 3 adjacent zinc finger factors | ||||||||||||
2.3.3.1 | Subfamily: GLI-like factors | TGGGTGGTC | |||||||||||
2.3.3.1.1 | GLI1 [5] | T06385 | |||||||||||
2.3.3.1.2 | GLI2 [5] | T06386 | |||||||||||
2.3.3.1.3 | GLI3 [5] | T06387 | |||||||||||
2.3.3.1.4 | GLIS1 [5] | T06390 | |||||||||||
2.3.3.1.4.1 | GLIS1, isoform 1 | T11184 | |||||||||||
2.3.3.1.4.2 | GLIS1, isoform 2 | T26134 | |||||||||||
2.3.3.1.5 | GLIS2 (NKL) [5] | T | |||||||||||
2.3.3.1.6 | GLIS3 (ZNF515) [5] | T17410 | |||||||||||
2.3.3.1.6.1 | GLIS3, isoform 1 | T18954 | |||||||||||
2.3.3.1.6.2 | GLIS3, isoform 2 | T15909 | |||||||||||
2.3.3.1.7 | ZIC1 (ZNF201) [5] | T04669 | |||||||||||
2.3.3.1.8 | ZIC2 [5] | T04670 | |||||||||||
2.3.3.1.9 | ZIC3 (ZNF203) [5] | T04671 | |||||||||||
2.3.3.1.9.1 | ZIC3, isoform 1 (ZIC3A) | T14517 | |||||||||||
2.3.3.1.9.2 | ZIC3, isoform 2 (ZIC3B) | T26531 | |||||||||||
2.3.3.1.10 | ZIC4 [5] | T | F | ||||||||||
2.3.3.1.11 | ZIC5 [4] | T | |||||||||||
2.3.3.2 | Subfamily: Snail-like factors | CACCTG | |||||||||||
2.3.3.2.1 | SNAI1 [4] | T02333 | |||||||||||
2.3.3.2.2 | SNAI2 (SLUG) [5] | T19238 | |||||||||||
2.3.3.2.3 | SNAI3 (ZNF293) [5] | T10589 | |||||||||||
2.3.3.2.4 | SCRT1 [5] | T20104 | |||||||||||
2.3.3.2.5 | SCRT2 [5] | T20108 | |||||||||||
2.3.3.3 | Subfamily: ZFP91-like factors | ||||||||||||
2.3.3.3.1 | ZFP91 (ZNF757) [5] | T19408 | |||||||||||
2.3.3.3.1.1 | ZFP91, isoform 1 | T19407 | |||||||||||
2.3.3.3.1.2 | ZFP91, isoform 2 | T26362 | |||||||||||
2.3.3.3.2 | ZNF692 [5] | T19554 | |||||||||||
2.3.3.3.3 | ZNF276 (ZFP276, ZNF477) [5] | T20488 | |||||||||||
2.3.3.3.3.1 | ZNF276, isoform 1 | T20487 | |||||||||||
2.3.3.3.3.2 | ZNF276, isoform 2 | T20489 | |||||||||||
2.3.3.3.4 | ZNF653 (ZIP67) [5] | T20934 | |||||||||||
2.3.3.3.4.1 | ZNF653, isoform 1 | T20933 | |||||||||||
2.3.3.3.4.2 | ZNF653, isoform 2 | T20935 | |||||||||||
2.3.3.4 | Subfamily: ZNF280-like zinc finger factors | ||||||||||||
2.3.3.4.2 | ZNF280B (SUHW2, ZNF279, ZNF632, Zfp280b) [4] | T | |||||||||||
2.3.3.4.3 | ZNF280C (SUHW3, ZNF633, Zfp280c) [5] | T20167 | |||||||||||
2.3.3.4.4 | ZNF280D (SUHW4, ZNF634) [5] | T20177 | |||||||||||
2.3.3.4.4.1 | ZNF280D, isoform 1 | T20176 | |||||||||||
2.3.3.4.4.2 | ZNF280D, isoform 2 | T20178 | |||||||||||
2.3.3.4.4.3 | ZNF280D, isoform 3 | T20179 | |||||||||||
2.3.3.4.5 | POGZ (SUHW5, ZNF280E, ZNF635) [9] | T | |||||||||||
2.3.3.5 | Subfamily: ZSCAN5-like zinc finger factors | ||||||||||||
2.3.3.6 | Subfamily: ZNF75-like zinc finger factors | ||||||||||||
2.3.3.7 | Subfamily: ZNF705 factors | ||||||||||||
2.3.3.8 | Subfamily: ZBTB7 factors | GACCCC | |||||||||||
2.3.3.8.1 | ZBTB7A [4] | T08304 | |||||||||||
2.3.3.8.1.1 | ZBTB7A, isoform 1 | T19395 | |||||||||||
2.3.3.8.1.2 | ZBTB7A, isoform 2 | T08303 | |||||||||||
2.3.3.8.2 | ZBTB7B [4] | T09541 | |||||||||||
2.3.3.8.3 | ZBTB7C [4] | T | |||||||||||
2.3.3.9 | Subfamily: YY1-like factors | GCCATCTTG | |||||||||||
2.3.3.9.1 | YY1 [4] | T00278 | |||||||||||
2.3.3.9.2 | YY2 (ZNF631) [4] | T17589 | |||||||||||
2.3.3.9.3 | ZFP42 (REX1, ZNF754) [4] | T00727 | |||||||||||
2.3.3.10 | Subfamily: ZNF24-like factors | TCAT | |||||||||||
2.3.3.10.1 | ZNF24 (KOX17, ZNF191, ZSCAN3) [4] | T21161 | |||||||||||
2.3.3.10.6 | ZKSCAN1 (KOX18, ZNF139, ZNF36) [6] | T20343 | |||||||||||
2.3.3.10.6.1 | ZKSCAN1, isoform 1 | T20342 | |||||||||||
2.3.3.10.6.2 | ZKSCAN1, isoform 2 | T20344 | |||||||||||
2.3.3.11 | Subfamily: ZBTB6-like factors | ||||||||||||
2.3.3.11.1 | ZBTB6 (ZID, ZNF482) [4] | T19399 | |||||||||||
2.3.3.11.2 | ZBTB26 (ZNF481) [4] | T | |||||||||||
2.3.3.11.3 | ZBTB12 (NG35) [4] | T16838 | |||||||||||
2.3.3.12 | Subfamily: PRDM1-like factors | AAGTGAAAGT | |||||||||||
2.3.3.12.1 | PRDM1 (BLIMP1) [4] | T02316 | |||||||||||
2.3.3.12.1.1 | PRDM1, isoform 1 | T14505 | |||||||||||
2.3.3.12.1.2 | PRDM1, isoform 2 (1A) | T26255 | |||||||||||
2.3.3.12.1.3 | PRDM1, isoform 3 (1B) | T26256 | |||||||||||
2.3.3.12.1.4 | PRDM1, isoform 4 (1C) | T26257 | |||||||||||
2.3.3.12.1.5 | PRDM1, isoform 5 (delta exon 7) | T26258 | |||||||||||
2.3.3.13 | Subfamily: ZNF148-like factors | CACCC | |||||||||||
2.3.3.13.1 | ZNF148 (ZBP89, Zfp148) [4] | T08694 | |||||||||||
2.3.3.13.2 | ZNF281 (GZP1, ZBP99, Zfp281) [4] | T16856 | |||||||||||
2.3.3.14 | Subfamily: ZBTB20-like factors | ||||||||||||
2.3.3.14.1 | ZBTB20 (DPZF, ZNF288, HOF) [5] | T15597 | |||||||||||
2.3.3.14.1.1 | ZBTB20, isoform 1 (HOF-L) | T15595 | |||||||||||
2.3.3.14.1.2 | ZBTB20, isoform 2 (HOF-S) | T15596 | |||||||||||
2.3.3.14.2 | ZBTB45 (ZNF499) [4] | T | |||||||||||
2.3.3.15 | Subfamily: ZNF524-like factors | ||||||||||||
2.3.3.15.1 | ZNF524 (Zfp524) [4] | T20724 | |||||||||||
2.3.3.16 | Subfamily: ZNF238-like factors | AACATCTGGA | |||||||||||
2.3.3.16.1 | ZNF238 (RP58, TAZ1, ZBTB18) [4] | T16607 | |||||||||||
2.3.3.16.2 | ZBTB42 [4] | T | |||||||||||
2.3.3.16.2.1 | ZBTB42, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.3.16.2.2 | ZBTB42, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.3.17 | Subfamily: OVOL-factors | GCGGGGG | |||||||||||
2.3.3.17.1 | OVOL1 [4] | T08547 | |||||||||||
2.3.3.17.2 | OVOL2 (mOVO, ZNF339) [4] | T08543 | |||||||||||
2.3.3.17.2.1 | OVOL2, isoform 1 (MOVO-A) | T08542 | |||||||||||
2.3.3.17.2.2 | OVOL2, isoform 2 (MOVO-C) | T08545 | |||||||||||
2.3.3.17.2.3 | OVOL2, isoform 3 (MOVO-B) | T08544 | |||||||||||
2.3.3.18 | Subfamily: ZNF56-like factors | ||||||||||||
2.3.3.19 | Subfamily: ZNF500-like factors | ||||||||||||
2.3.3.19.3 | ZKSCAN2 (ZNF694) [6] | T | |||||||||||
2.3.3.19.4 | ZSCAN29 (ZNF690) [6] | T | |||||||||||
2.3.3.20 | Subfamily: FEZF factors | ||||||||||||
2.3.3.20.1 | FEZF1 (ZNF312B) [6] | T19931 | |||||||||||
2.3.3.20.2 | FEZF2 (FEZL, ZNF312) [6] | T19936 | |||||||||||
2.3.3.21 | Subfamily: GFI1 factors | AAATCACAGC | |||||||||||
2.3.3.21.1 | GFI1 (ZNF163) [6] | T06593 | |||||||||||
2.3.3.21.2 | GFI1B [6] | T06585 | |||||||||||
2.3.3.22 | Subfamily: BCL6 factors | CTTTCTAGGAAT | |||||||||||
2.3.3.22.1 | BCL6B (BAZF, ZNF62) [5] | T16794 | |||||||||||
2.3.3.22.2 | BCL6 (LAZ3, ZBTB27, ZNF51) [6] | T08156 | |||||||||||
2.3.3.23 | Subfamily: ZNF212-like factors | ||||||||||||
2.3.3.24 | Subfamily: MTF1-like factors | TGCACAC | |||||||||||
2.3.3.24.1 | MTF1 [6] | T00515 | |||||||||||
2.3.3.24.2 | ZNF410 (APA1, Zfp410) [5] | T16880 | |||||||||||
2.3.3.24.2.1 | ZNF410, isoform 1 | T16879 | |||||||||||
2.3.3.24.2.2 | ZNF410, isoform 2 | T16883 | |||||||||||
2.3.3.24.2.3 | ZNF410, isoform 3 | T16884 | |||||||||||
2.3.3.25 | Subfamily: PLAG factors | ||||||||||||
2.3.3.25.1 | PLAGL2 [6] | T18384 | |||||||||||
2.3.3.25.2 | PLAG1 [7] | T21518 | |||||||||||
2.3.3.25.3 | PLAGL1 (LOT1, ZAC) [7] | T10142 | |||||||||||
2.3.3.26 | Subfamily: ZKSCAN3-like factors | TGAGGGG | |||||||||||
2.3.3.26.1 | ZKSCAN3 (ZFP47, ZNF306, ZNF309, ZSCAN13) [7] | T | |||||||||||
2.3.3.26.2 | ZKSCAN4 (ZNF307, ZNF427) [7] | T | F | ||||||||||
2.3.3.27 | Subfamily: ZNF525-like factors | ||||||||||||
2.3.3.28 | Subfamily: ZNF76-like factors | CCCATCATGCCTTGC | |||||||||||
2.3.3.28.1 | ZNF76 (ZNF523, Zfp523) [7] | T19573 | |||||||||||
2.3.3.28.1.1 | ZNF76, isoform 1 | T25999 | |||||||||||
2.3.3.28.1.2 | ZNF76, isoform 2 | T26000 | |||||||||||
2.3.3.28.2 | ZNF143 (SBF, STAF) [7] | T18502 | |||||||||||
2.3.3.28.2.1 | ZNF143, isoform 1 | T18501 | |||||||||||
2.3.3.28.2.2 | ZNF143, isoform 2 | T26365 | |||||||||||
2.3.3.28.2.3 | ZNF143, isoform 3 | T26366 | |||||||||||
2.3.3.29 | Subfamily: ZNF652-like factors | ||||||||||||
2.3.3.29.1 | ZNF652 (ZFP652) [9] | T20929 | |||||||||||
2.3.3.29.1.1 | ZNF652, isoform 1 | T20928 | |||||||||||
2.3.3.29.1.2 | ZNF652, isoform 2 | T20930 | |||||||||||
2.3.3.30 | Subfamily: ZNF350-like factors | TGGgttCAGactTTG | |||||||||||
2.3.3.31 | Subfamily: ZNF642-like factors | ||||||||||||
2.3.3.31.4 | ZNF583 [12] | T20839 | |||||||||||
2.3.3.32 | Subfamily: ZNF679-like factors | ||||||||||||
2.3.3.33 | Subfamily: ZNF763-like factors | ||||||||||||
2.3.3.34 | Subfamily: ZNF3-like factors | ||||||||||||
2.3.3.35 | Subfamily: ZNF620-like factors | ||||||||||||
2.3.3.36 | Subfamily: ZNF324 factors | ||||||||||||
2.3.3.37 | Subfamily: ZNF362-like factors | ||||||||||||
2.3.3.38 | Subfamily: ZNF282-like factors | TCCACCCC | |||||||||||
2.3.3.39 | Subfamily: ZNF764-like factors | ||||||||||||
2.3.3.39.3 | ZNF771 [8] | T21051 | |||||||||||
2.3.3.40 | Subfamily: ZNF177-like factors | ||||||||||||
2.3.3.41 | Subfamily: ZNF32-like factors | ||||||||||||
2.3.3.41.1 | ZNF32 (KOX30, Zfp637) [7] | T | |||||||||||
2.3.3.41.1.1 | ZNF32, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.3.41.1.2 | ZNF32, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.3.41.2 | ZIK1 (ZNF762) [9] | T20335 | |||||||||||
2.3.3.42 | Subfamily: ZNF773-like factors | ||||||||||||
2.3.3.43 | Subfamily: ZNF558-like factors | ||||||||||||
2.3.3.44 | Subfamily: ZNF302-like factors | ||||||||||||
2.3.3.44.2 | ZNF2 (ZNF661, Zfp661) [9] | T21173 | |||||||||||
2.3.3.45 | Subfamily: ZNF562-like factors | ||||||||||||
2.3.3.46 | Subfamily: ZXD-factors | ||||||||||||
2.3.3.46.2 | ZXDB [10] | T | |||||||||||
2.3.3.46.3 | ZXDC (ZXDL) [10] | T | |||||||||||
2.3.3.46.3.1 | ZXDC, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.3.46.3.2 | ZXDC, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.3.46.3.3 | ZXDC, isoform 3 | T | |||||||||||
2.3.3.46.3.4 | ZXDC, isoform 4 | T | |||||||||||
2.3.3.47 | Subfamily: ZNF222-like factors | ||||||||||||
2.3.3.48 | Subfamily: ZNF736-like factors | ||||||||||||
2.3.3.49 | Subfamily: ZNF286 factors | ||||||||||||
2.3.3.50 | Subfamily: CTCF-like factors | ||||||||||||
2.3.3.50.1 | CTCF [11] | T02285 | |||||||||||
2.3.3.50.2 | CTCFL (CTCF-T, BORIS) [11] | T | |||||||||||
2.3.3.50.2.1 | CTCFL, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.3.50.2.2 | CTCFL, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.3.51 | Subfamily: ZNF366-like factors | ||||||||||||
2.3.3.51.2 | ZNF710 (Zfp710) [11] | T21014 | |||||||||||
2.3.3.51.2.1 | ZNF710, isoform 1 | T21013 | |||||||||||
2.3.3.51.2.2 | ZNF710, isoform 2 | T21015 | |||||||||||
2.3.3.51.2.3 | ZNF710, isoform 3 | T21016 | |||||||||||
2.3.3.52 | Subfamily: ZNF322-like factors | ||||||||||||
2.3.3.52.1 | ZNF322A (ZNF322, ZNF388, ZNF489, Zfp322A) [11] | T20185 | |||||||||||
2.3.3.53 | Subfamily: ZNF548-like factors | ||||||||||||
2.3.3.54 | Subfamily: ZNF460-like factors | ||||||||||||
2.3.3.55 | Subfamily: ZNF146-like factors | ||||||||||||
2.3.3.55.1 | ZNF146 [10] | T | |||||||||||
2.3.3.55.2 | ZNF260 (ZFP260) [13] | T20476 | |||||||||||
2.3.3.56 | Subfamily: ZNF214-like factors | ||||||||||||
2.3.3.57 | Subfamily: ZNF479-like factors | ||||||||||||
2.3.3.58 | Subfamily: ZNF180-like factors | ||||||||||||
2.3.3.58.3 | ZNF436 (Zfp46) [12] | T20615 | |||||||||||
2.3.3.58.6 | ZSCAN2 (ZFP29, ZNF854) [14] | T21249 | |||||||||||
2.3.3.59 | Subfamily: ZNF100-like factors | ||||||||||||
2.3.3.59.3 | ZNF431 (Zfp431, Zfp923) [13] | T23370 | |||||||||||
2.3.3.60 | Subfamily: ZNF98-like factors | ||||||||||||
2.3.3.61 | Subfamily: ZNF343-like factors | ||||||||||||
2.3.3.62 | Subfamily: ZFP2-like factors | ||||||||||||
2.3.3.62.1 | ZFP2 (ZNF751, Mkr2) [13] | T | |||||||||||
2.3.3.62.1.1 | ZFP2, isoform 1 | ||||||||||||
2.3.3.62.1.2 | ZFP2, isoform 2 | T02335 | |||||||||||
2.3.3.63 | Subfamily: ZFP30-like factors | ||||||||||||
2.3.3.63.1 | ZFP30 (ZNF745) [13] | T20292 | |||||||||||
2.3.3.63.2 | ZFP82 (ZNF545) [13] | T20313 | |||||||||||
2.3.3.63.2.1 | ZFP82, isoform 1 | T20312 | |||||||||||
2.3.3.63.2.2 | ZFP82, isoform 2 | T20314 | |||||||||||
2.3.3.63.2.3 | ZFP82, isoform 3 | T28055 | |||||||||||
2.3.3.63.3 | ZFP14 (ZNF531) [13] | T | |||||||||||
2.3.3.64 | Subfamily: ZNF354A-like factors | ||||||||||||
2.3.3.64.1 | ZNF354A (EZNF, HKL1, TCF17, Zfp354a) [13] | T19363 | |||||||||||
2.3.3.64.2 | ZNF354B (Zfp354b) [13] | T20196 | |||||||||||
2.3.3.65 | Subfamily: ZFX/ZFY factors | AGGCCC | |||||||||||
2.3.3.65.1 | ZFX [13] | T16099 | |||||||||||
2.3.3.65.2 | ZFY-1 [13] | T20325 | |||||||||||
2.3.3.65.3 | ZFY-2 [13] | T20327 | |||||||||||
2.3.3.66 | Subfamily: ZNF689-like factors | ||||||||||||
2.3.3.66.1 | ZNF689 (Zfp689) [12] | T20996 | |||||||||||
2.3.3.66.2 | ZNF672 (Zfp672) [14] | T20968 | |||||||||||
2.3.3.67 | Subfamily: ZFN283-like factors | ||||||||||||
2.3.3.68 | Subfamily: ZFN81-like factors | ||||||||||||
2.3.3.69 | Subfamily: ZFN25-like factors | ||||||||||||
2.3.3.69.3 | ZFP37 [12] | T21364 | |||||||||||
2.3.3.70 | Subfamily: ZFN26-like factors | ||||||||||||
2.3.3.71 | Subfamily: ZFN300-like factors | ||||||||||||
2.3.3.72 | Subfamily: ZFN813-like factors | ||||||||||||
2.3.3.73 | Subfamily: ZNF816A-like factors | ||||||||||||
2.3.3.74 | Subfamily: ZNF442-like factors | ||||||||||||
2.3.3.75 | Subfamily: ZNF432-like factors | ||||||||||||
2.3.3.76 | Subfamily: ZNF665-like factors | ||||||||||||
2.3.3.77 | Subfamily: ZNF595-like factors | ||||||||||||
2.3.3.78 | Subfamily: ZNF14-like factors | ||||||||||||
2.3.3.79 | Subfamily: ZNF841-like factors | ||||||||||||
2.3.3.80 | Subfamily: ZNF99-like factors | ||||||||||||
2.3.3.0 | Subfamily: unclassified | ||||||||||||
2.3.3.0.1 | ZFP161 (ZBTB14, ZNF478, Zfp5) | CTACCTGCACAGTTCACGGA | T02349 | ||||||||||
2.3.3.0.3 | ZNF496 (ZKSCAN17, Zfp496) | T | |||||||||||
2.3.3.0.3.1 | ZNF496, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.3.0.3.2 | ZNF496, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.3.0.3.3 | ZNF496, isoform 3 | T | |||||||||||
2.3.3.0.9 | OSR2 | T16872 | |||||||||||
2.3.3.0.9.1 | OSR2, isoform 1 (OSR2A) | T16871 | |||||||||||
2.3.3.0.9.2 | OSR2, isoform 2 (OSR2B) | T16873 | |||||||||||
2.3.3.0.13 | ZNF22 (KOX15, KROX26, Zfp422) | CAATG | T21157 | ||||||||||
2.3.3.0.17 | ZFP41 | T20302 | |||||||||||
2.3.3.0.20 | ZNF18 (KOX11, ZKSCAN6, ZNF535, Zfp18, Zfp535) | T21150 | |||||||||||
2.3.3.0.21 | WT1 | CGCCCCCGC | T02351 | ||||||||||
2.3.3.0.21.1 | WT1, isoform 1 | T09249 | |||||||||||
2.3.3.0.21.2 | WT1, isoform 2 | T19358 | |||||||||||
2.3.3.0.21.3 | WT1, isoform 3 | T19356 | |||||||||||
2.3.3.0.21.4 | WT1, isoform 4 | T19357 | |||||||||||
2.3.3.0.21.5 | WT1, isoform 5 | T26353 | |||||||||||
2.3.3.0.21.6 | WT1, isoform 6 | T26354 | |||||||||||
2.3.3.0.23 | PRDM6 (PFM3) | T27850 | |||||||||||
2.3.3.0.23.1 | PRDM6, isoform 1 | T27355 | |||||||||||
2.3.3.0.23.2 | PRDM6, isoform 2 | T27928 | |||||||||||
2.3.3.0.23.3 | PRDM6, isoform 3 | T27929 | |||||||||||
2.3.3.0.23.4 | PRDM6, isoform 4 | T27930 | |||||||||||
2.3.3.0.24 | ZNF444 (EZF2, ZSCAN17, Zfp44) | T | |||||||||||
2.3.3.0.25 | ZNF641 (Zfp641) | T20912 | |||||||||||
2.3.3.0.25.1 | ZNF641, isoform 1 | T20911 | |||||||||||
2.3.3.0.25.2 | ZNF641, isoform 2 | T20913 | |||||||||||
2.3.3.0.26 | ZNF746 (PARIS, Zfp746) | TATTTTT | T | ||||||||||
2.3.3.0.28 | ZBTB44 (BTBD15, ZNF851) | T19390 | |||||||||||
2.3.3.0.28.1 | ZBTB44, isoform 1 | T19389 | |||||||||||
2.3.3.0.28.2 | ZBTB44, isoform 2 | T26360 | |||||||||||
2.3.3.0.31 | ZNF655 (VIK, Zfp655) [6] | T | |||||||||||
2.3.3.0.34 | ZNF131 [6] | T23316 | |||||||||||
2.3.3.0.34.1 | ZNF131, isoform 1 | T23324 | |||||||||||
2.3.3.0.34.2 | ZNF131, isoform 2 | T25958 | |||||||||||
2.3.3.0.34.3 | ZNF131, isoform 3 | T26363 | |||||||||||
2.3.3.0.35 | PRDM14 [6] | GGTCTCTAA | T | ||||||||||
2.3.3.0.37 | ZNF575 (Zfp575) [6] | T20823 | |||||||||||
2.3.3.0.38 | ZBTB49 [7] | T | |||||||||||
2.3.3.0.38.1 | ZBTB49, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.3.0.38.2 | ZBTB49, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.3.0.38.3 | ZBTB49, isoform 3 | T | |||||||||||
2.3.3.0.39 | ZNF691 (Zfp691) [7] | T16890 | |||||||||||
2.3.3.0.40 | ZNF394 (ZKSCAN14, Zfp394, Zfp99) [7] | T20568 | |||||||||||
2.3.3.0.41 | ZNF449 (ZSCAN19, Zfp449) [7] | T | |||||||||||
2.3.3.0.42 | ZNF498 (ZSCAN25, Zfp498) [7] | T | |||||||||||
2.3.3.0.43 | ZSCAN30 (ZNF397OS, Zfp397OS) [7] | T | |||||||||||
2.3.3.0.47 | ZSCAN21 (ZFP38, ZNF38, Zipro1) [7] | T19587 | |||||||||||
2.3.3.0.54 | MYNN (OSZF, ZBTB31) [8] | T20033 | |||||||||||
2.3.3.0.54.1 | MYNN, isoform 1 | T20032 | |||||||||||
2.3.3.0.54.2 | MYNN, isoform 2 | T20034 | |||||||||||
2.3.3.0.54.3 | MYNN, isoform 3 | T20035 | |||||||||||
2.3.3.0.55 | ZBTB24 (ZNF450) [8] | T20221 | |||||||||||
2.3.3.0.55.1 | ZBTB24, isoform 1 | T20220 | |||||||||||
2.3.3.0.55.2 | ZBTB24, isoform 2 | T20223 | |||||||||||
2.3.3.0.55.3 | ZBTB24, isoform 3 | T20222 | |||||||||||
2.3.3.0.57 | ZFP92 [8] | T21421 | |||||||||||
2.3.3.0.60 | ZNF202 (ZKSCAN10, Zfp202) [8] | GGGGTGGGGT | T | ||||||||||
2.3.3.0.69 | ZNF187 (ZSCAN26, SRE-ZBP, Zfp187) [8] | T16850 | |||||||||||
2.3.3.0.69.1 | ZNF187, isoform 1 | T16849 | |||||||||||
2.3.3.0.69.2 | ZNF187, isoform 2 | T16851 | |||||||||||
2.3.3.0.70 | ZSCAN22 (HKR2, ZNF50) [8] | T | |||||||||||
2.3.3.0.72 | ZFP1 (ZNF475) [8] | T20280 | |||||||||||
2.3.3.0.72.1 | ZFP1, isoform 1 | T20279 | |||||||||||
2.3.3.0.72.2 | ZFP1, isoform 2 | T20281 | |||||||||||
2.3.3.0.74 | ZBTB16 (PLZF, ZNF145) [9] | TAAAGTTTGATCTGTTC | T08243 | ||||||||||
2.3.3.0.75 | GTF3A (TFIIIA) [9] | T19312 | |||||||||||
2.3.3.0.76 | ZFP64 [9] | T19406 | |||||||||||
2.3.3.0.76.1 | ZFP64, isoform 1 | T19405 | |||||||||||
2.3.3.0.76.2 | ZFP64, isoform 2 | ||||||||||||
2.3.3.0.76.3 | ZFP64, isoform 3 [8] | ||||||||||||
2.3.3.0.77 | ZNF358 (Zfp358) [9] | T | |||||||||||
2.3.3.0.79 | ZNF263 (FPM315, ZKSCAN12, Zfp263) [9] | GGGAGGAGG | T22394 | ||||||||||
2.3.3.0.81 | ZNF192 (ZKSCAN8, LD5-1, Zfp192) [9] | T23327 | |||||||||||
2.3.3.0.83 | ZNF239 (HOK-2, MOK-2, Zfp239) [9] | T00510 | |||||||||||
2.3.3.0.84 | ZNF664 (ZFOC1, ZNF196, Zfp664) [9] | T20951 | |||||||||||
2.3.3.0.92 | GZF1 (ZBTB23, ZNF336) [10] | TGCGCGTCTATA | T08231 | ||||||||||
2.3.3.0.93 | ZNF408 (PFM14, PRDM17, Zfp408) [10] | T | |||||||||||
2.3.3.0.94 | ZNF648 (Zfp648) [10] | T | |||||||||||
2.3.3.0.95 | ZNF768 (Zfp768) [10] | T21043 | |||||||||||
2.3.3.0.101 | ZNF483 (ZKSCAN16) [11] | T | |||||||||||
2.3.3.0.102 | ZBTB48 (HKR3, ZNF855) [11] | T20247 | |||||||||||
2.3.3.0.102.1 | ZBTB48, isoform 1 | T20246 | |||||||||||
2.3.3.0.102.2 | ZBTB48, isoform 2 | T20248 | |||||||||||
2.3.3.0.103 | ZNF275 (Zfp275) [11] | T | |||||||||||
2.3.3.0.114 | ZNF354C (KID3) [11] | CCACC | T20198 | ||||||||||
2.3.3.0.120 | ZSCAN12 (ZNF305, ZNF96) [11] | T21524 | |||||||||||
2.3.3.0.123 | ZBTB40 [12] | T | |||||||||||
2.3.3.0.125 | ZNF454 (Zfp454) [12] | T | |||||||||||
2.3.3.0.148 | ZNF329 (Zfp329) [12] | T20524 | |||||||||||
2.3.3.0.149 | ZFP90 (ZNF756) [13] | T20318 | |||||||||||
2.3.3.0.150 | ZNF317 (Zfp317) [13] | T | |||||||||||
2.3.3.0.152 | MZF1 (ZNF42, ZSCAN6) [13] | AGTGGGGA | T08517 | ||||||||||
2.3.3.0.157 | ZNF879 (Zfp879) [13] | T | |||||||||||
2.3.3.0.159 | ZNF167 (ZKSCAN7, ZNF448, ZNF64, Zfp167) [13] | T | |||||||||||
2.3.3.0.160 | ZNF250 (ZNF647, Zfp647) [13] | T19444 | |||||||||||
2.3.3.0.162 | ZFP3 (ZNF752) [13] | T20298 | |||||||||||
2.3.3.0.166 | ZNF311 (ZFP31, Zscan20) [14] | T | |||||||||||
2.3.3.0.166.1 | ZNF311, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.3.0.166.2 | ZNF311, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.3.0.167 | ZNF551 (KOX23, Zfp551) [14] | T | |||||||||||
2.3.3.0.169 | ZSCAN10 (ZNF206) [14] | GCGCATGCGC | T18325 | ||||||||||
2.3.3.0.169.1 | ZSCAN10, isoform 1 | T18322 | |||||||||||
2.3.3.0.169.2 | ZSCAN10, isoform 2 | T18324 | |||||||||||
2.3.3.0.169.3 | ZSCAN10, isoform 3 | T18326 | |||||||||||
2.3.3.0.174 | ZNF287 (ZKSCAN13) [14] | T21498 | |||||||||||
2.3.3.0.179 | ZNF667 [15] | T20955 | |||||||||||
2.3.3.0.192 | ZFP28 [15] | T20285 | |||||||||||
2.3.3.0.192.1 | ZFP28, isoform 1 | T20284 | |||||||||||
2.3.3.0.192.2 | ZFP28, isoform 2 | T20286 | |||||||||||
2.3.3.0.193 | ZNF182 (KOX14, ZNF21, Zfp182) [15] | T20399 | |||||||||||
2.3.3.0.195 | PRDM5 (PFM2) [16] | GGAGAGCAGG | T20084 | ||||||||||
2.3.3.0.196 | RBAK (ZNF769) [16] | T | |||||||||||
2.3.3.0.197 | ZNF189 (Zfp189) [16] | T | |||||||||||
2.3.3.0.215 | ZNF569 (Zfp74) [18] | T20803 | |||||||||||
2.3.3.0.219 | ZNF271 (HZF7, ZNF-dp, ZNFEB, Zfp35) [19] | T00921 | |||||||||||
2.3.3.0.220 | ZNF184 (Zfp184) [19] | T20403 | |||||||||||
2.3.3.0.231 | ZFP62 [23] | T | |||||||||||
2.3.3.0.231.1 | ZFP62, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.3.0.231.2 | ZFP62, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.3.0.231.3 | ZFP62, isoform 3 | T | |||||||||||
2.3.4 | Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers | ||||||||||||
2.3.4.1 | Subfamily: ZNF417-like factors | ||||||||||||
2.3.4.2 | Subfamily: ZNF219-like factors | CCCCCA | |||||||||||
2.3.4.2.1 | ZNF219 (Zfp219) [2+1+2+1] | T | |||||||||||
2.3.4.2.2 | ZNF536 (Zfp536) [2+4+1+2] | T20746 | |||||||||||
2.3.4.2.3 | ZNF516 (Zfp516) [2+5+1+1+1] | T20711 | |||||||||||
2.3.4.2.4 | ZNF217 (ZABC1) [1+3+1+2] | T | |||||||||||
2.3.4.3 | Subfamily: Sal-like factors | ||||||||||||
2.3.4.3.1 | SALL1 (Spalt-1, Sal-1, ZNF794) [2+3+2+2] | T19221 | |||||||||||
2.3.4.3.2 | SALL2 (Spalt-2, Sal-2, ZNF795) [2+3+2] | T19225 | |||||||||||
2.3.4.3.3 | SALL3 (Sal-3, ZNF796) [2+3+2+2] | T20099 | |||||||||||
2.3.4.3.3.1 | SALL3, isoform 1 [2+3+2+2] | T20098 | |||||||||||
2.3.4.3.3.2 | SALL3, isoform 2 [2+3] | T20100 | |||||||||||
2.3.4.3.4 | SALL4 (ZNF797) [2+3+2+2] | T19229 | |||||||||||
2.3.4.3.4.1 | SALL4, isoform 1 (Sall4a) [2+3+2+2] | T19228 | |||||||||||
2.3.4.3.4.2 | SALL4, isoform 2 (Sall4b) [2] | T26286 | |||||||||||
2.3.4.3.4.3 | SALL4, isoform 3 (Sall4c) [2] | T26287 | |||||||||||
2.3.4.4 | Subfamily: Ikaros | TTGGGAAT | |||||||||||
2.3.4.4.1 | IKZF1 (IK1, IKAROS, Lyf-1, ZNFN1A1) [4+2] | T00479 | |||||||||||
2.3.4.4.1.1 | IKZF1, isoform I [3+2] | T01469 | |||||||||||
2.3.4.4.1.2 | IKZF1, isoform II [3+2] | T01470 | |||||||||||
2.3.4.4.1.3 | IKZF1, isoform III [3+2] | T01471 | |||||||||||
2.3.4.4.1.4 | IKZF1, isoform IV [1+2] | T01472 | |||||||||||
2.3.4.4.1.5 | IKZF1, isoform V [2] | T01473 | |||||||||||
2.3.4.4.1.6 | IKZF1, isoform VI | T19007 | |||||||||||
2.3.4.4.2 | IKZF2 (HELIOS, ZNFN1A2, Zfpn1a2) [4+2] | T06012 | |||||||||||
2.3.4.4.2.1 | IKZF2, isoform B | T11158 | |||||||||||
2.3.4.4.2.2 | IKZF2, isoform A [3+2] | T19008 | |||||||||||
2.3.4.4.3 | IKZF3 (Aiolos, ZNFN1A3) [4+2] | T05979 | |||||||||||
2.3.4.4.4 | IKZF4 (EOS, ZNFN1A4, Zfpn1a4) [4+2] | T19017 | |||||||||||
2.3.4.4.4.1 | IKZF4, isoform 1 | T19016 | |||||||||||
2.3.4.4.4.2 | IKZF4, isoform 2 | T26152 | |||||||||||
2.3.4.4.4.3 | IKZF4, isoform 3 | T26153 | |||||||||||
2.3.4.4.4.4 | IKZF4, isoform 4 | T26154 | |||||||||||
2.3.4.4.5 | IKZF5 (Pegasus, ZNFN1A5, Zfpn1a5) [3+2] | T19022 | |||||||||||
2.3.4.4.5.1 | IKZF5, isoform 1 | T19020 | |||||||||||
2.3.4.4.5.2 | IKZF5, isoform 2 | T19021 | |||||||||||
2.3.4.4.5.3 | IKZF5, isoform 3 | T26155 | |||||||||||
2.3.4.5 | Subfamily: HIV EP-factors | GGGACTTTCC | |||||||||||
2.3.4.5.1 | HIV-EP1 (ZNF40, PRDII-BF1, MBP-1, CIRIP, GAAP) [2+1+2] | T00007 | F | ||||||||||
2.3.4.5.2 | HIV-EP2 (MBP-2, ZNF40B) [2+2] | T16993 | |||||||||||
2.3.4.5.3 | HIV-EP3 (KBP1, KRC, ZAS3) [2+1+2] | T02315 | |||||||||||
2.3.4.6 | Subfamily: ZBTB1-like factors | ||||||||||||
2.3.4.6.1 | ZBTB1 [1+1+6] | T20252 | |||||||||||
2.3.4.6.2 | ZBTB2 (ZNF437) [1+3] | T | |||||||||||
2.3.4.6.3 | ZBTB25 (KUP, ZNF46) [1+1] | T | |||||||||||
2.3.4.7 | Subfamily: RLF-like factors | ||||||||||||
2.3.4.7.1 | RLF [1+5+1+2+4+1] | F | T | ||||||||||
2.3.4.7.2 | ZNF292 (Zfp292) [1+5+1+1+2+4+1] | T | |||||||||||
2.3.4.7.2.1 | ZNF292, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.4.7.2.2 | ZNF292, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.4.7.3 | ZNF654 (Zfp654) [1+4] | T20939 | |||||||||||
2.3.4.8 | Subfamily: MAZ-like factors | GGGGAGGG | |||||||||||
2.3.4.8.1 | MAZ (Zif87, ZNF801) [1+5] | T02303 | |||||||||||
2.3.4.8.2 | VEZF1 (DB1, ZNF161) [1+5] | T10444 | |||||||||||
2.3.4.8.3 | PATZ1 (RIAZ, ZBTB19, ZNF278, ZSG) [1+5+1] | T04796 | |||||||||||
2.3.4.9 | Subfamily: ZNF532-like factors | ||||||||||||
2.3.4.9.1 | ZNF532 (Zfp532) [1+6+3+2] | T20741 | |||||||||||
2.3.4.9.1.1 | ZNF532, isoform 1 | T20740 | |||||||||||
2.3.4.9.1.2 | ZNF532, isoform 2 | T20742 | |||||||||||
2.3.4.9.2 | ZNF592 (Zfp592) [2+6+3+2] | T19534 | |||||||||||
2.3.4.9.3 | ZNF687 (Zfp687) [1+5+2+2] | T20988 | |||||||||||
2.3.4.9.3.1 | ZNF687, isoform 1 | T20987 | |||||||||||
2.3.4.9.3.2 | ZNF687, isoform 2 [1+5+2] | T20989 | |||||||||||
2.3.4.9.3.3 | ZNF687, isoform 3 [1+5+2] | T20990 | |||||||||||
2.3.4.10 | Subfamily: ZNF512-factors | ||||||||||||
2.3.4.10.1 | ZNF512 (Zfp512) [1+1+2] | T20697 | |||||||||||
2.3.4.10.2 | ZNF512B (Zfp512b) [2+3+2] | F | T | ||||||||||
2.3.4.11 | Subfamily: ZNF658-factors | ||||||||||||
2.3.4.12 | Subfamily: ZNF423-like factors | GCACCCAAGGGTGC | |||||||||||
2.3.4.12.1 | ZNF423 (OAZ, Zfp423) [1+7+5+7+10] | T06599 | |||||||||||
2.3.4.12.1.1 | ZNF423, isoform 1 | T15869 | |||||||||||
2.3.4.12.1.2 | ZNF423, isoform 2 | T15870 | |||||||||||
2.3.4.12.2 | ZNF521 (EHZF, LIP3, Zpf521) [1+7+5+7+5+5] | T20719 | |||||||||||
2.3.4.12.2.1 | ZNF521, isoform 1 | T20718 | |||||||||||
2.3.4.12.2.2 | ZNF521, isoform 2 | T20720 | |||||||||||
2.3.4.13 | Subfamily: ZNF639-like factors | ||||||||||||
2.3.4.13.1 | ZNF639 (ZASC1, Zfp639) [4+4] | T | |||||||||||
2.3.4.13.2 | ZNF711 (CMPX1, ZNF6, Zfp711) [1+10] | T | |||||||||||
2.3.4.14 | Subfamily: Evi-1-like factors | ACAAGATAA | |||||||||||
2.3.4.14.1 | EVI-1 (MECOM) [7+3] | T00273 | |||||||||||
2.3.4.14.1.1 | EVI-1, isoform 1 | T10211 | |||||||||||
2.3.4.14.1.2 | EVI-1, isoform 2 | T25985 | |||||||||||
2.3.4.14.2 | PRDM16 (MEL1, PFM13) [7+3] | T27849 | |||||||||||
2.3.4.14.2.1 | PRDM16, isoform 1 | T27353 | |||||||||||
2.3.4.14.2.2 | PRDM16, isoform 2 (MEL1L) | T27927 | |||||||||||
2.3.4.14.2.3 | PRDM16, isoform 3 | T27354 | |||||||||||
2.3.4.15 | Subfamily: BCL11 | ||||||||||||
2.3.4.15.1 | BCL11A (CTIP1, EVI9, ZNF856) [1+2] | T27831 | |||||||||||
2.3.4.15.1.1 | BCL11A, isoform 1 (a) [1+2] | T27221 | |||||||||||
2.3.4.15.1.2 | BCL11A, isoform 2 (b) [2] | T27873 | |||||||||||
2.3.4.15.1.3 | BCL11A, isoform 3 (c) [1] | T27874 | |||||||||||
2.3.4.15.1.4 | BCL11A, isoform 4 [2] | T27875 | |||||||||||
2.3.4.15.1.5 | BCL11A, isoform 5 [1] | T27222 | |||||||||||
2.3.4.15.1.6 | BCL11A, isoform 6 [1] | T27876 | |||||||||||
2.3.4.15.1.7 | BCL11A, isoform 7 [0] | T27877 | |||||||||||
2.3.4.15.1.8 | BCL11A, isoform 8 [2] | T27878 | |||||||||||
2.3.4.15.2 | BCL11B (CTIP2, RIT1) [1+2+3] | T | |||||||||||
2.3.4.15.2.1 | BCL11B, isoform 1 (α) | T | |||||||||||
2.3.4.15.2.2 | BCL11B, isoform 2 (β) | T | |||||||||||
2.3.4.15.2.3 | BCL11B, isoform 3 (γ) | T | |||||||||||
2.3.4.15.3 | ZNF296 (ZNF342) [1+2+3] | T | |||||||||||
2.3.4.16 | Subfamily: Insulinoma-associated proteins | ||||||||||||
2.3.4.16.1 | INSM1 (IA-1) [2+1+2] | T16447 | |||||||||||
2.3.4.16.2 | INSM2 (IA-6) [2+3] | T21510 | |||||||||||
2.3.4.17 | Subfamily: Hypermethylated in Cancer proteins | GGGTGCCCGG | |||||||||||
2.3.4.17.1 | HIC1 (ZBTB29) [1+4] | T06430 | F | ||||||||||
2.3.4.17.2 | HIC2 (HRG22, ZBTB30) [1+4] | T18974 | |||||||||||
2.3.4.17.2.1 | HIC2, isoform 1 | T18976 | |||||||||||
2.3.4.17.2.2 | HIC2, isoform 2 [1+1] | T18975 | |||||||||||
2.3.4.18 | Subfamily: ZNF518 | ||||||||||||
2.3.4.18.1 | ZNF518A (Zfp518a) [4+1] | T | |||||||||||
2.3.4.18.2 | ZNF518B (Zfp518b) [2+1] | T21344 | |||||||||||
2.3.4.19 | Subfamily: Basonuclin | ||||||||||||
2.3.4.19.1 | BNC1 [2+2+2] | T05192 | |||||||||||
2.3.4.19.2 | BNC2 [1+1+2] | T | |||||||||||
2.3.4.19.2.1 | BNC2, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.4.19.2.2 | BNC2, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.4.20 | Subfamily: TRERF1-like factors | ||||||||||||
2.3.4.20.1 | TRERF1 (BCAR2, RAPA, TREP132) = 3.5.1.3.9 [1+1+1] | T16489 | |||||||||||
2.3.4.20.1.1 | TRERF1, isoform 1 | T16488 | |||||||||||
2.3.4.20.1.2 | TRERF1, isoform 2 | T16490 | |||||||||||
2.3.4.20.1.3 | TRERF1, isoform 3 [1] | T16491 | |||||||||||
2.3.4.20.1.4 | TRERF1, isoform 4 | T16492 | |||||||||||
2.3.4.20.2 | ZNF541 (Ship1, Zfp541) [3+1+1] = 3.5.1.3.10 | T | |||||||||||
2.3.4.20.2.1 | ZNF541, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.4.20.2.2 | ZNF541, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.4.21 | Subfamily: HINFP-like factors | CGGACGTT | |||||||||||
2.3.4.21.1 | HINFP (MIZF, ZNF743) [1+8] | T | |||||||||||
2.3.4.21.2 | ZFAT (ZFAT1, ZNF406, Zfp406) [1+1+7+10] | T20270 | |||||||||||
2.3.4.21.2.1 | ZFAT, isoform 1 | T20269 | |||||||||||
2.3.4.21.2.2 | ZFAT, isoform 2 | T20271 | |||||||||||
2.3.4.22 | Subfamily: ZNF526-like factors | ||||||||||||
2.3.4.22.1 | ZNF526 (Zfp526) [1+2+1+9] | T20728 | |||||||||||
2.3.4.22.1.1 | ZNF526, isoform 1 | T20727 | |||||||||||
2.3.4.22.1.2 | ZNF526, isoform 2 [1+2+1+4] | T20729 | |||||||||||
2.3.4.22.2 | ZNF574 [3+1+4+8+4] | T20819 | |||||||||||
2.3.4.23 | Subfamily: ZNF319-like factors | ||||||||||||
2.3.4.23.1 | ZNF319 (Zfp319) [3+13] | T20516 | |||||||||||
2.3.4.23.2 | ZNF786 (Zfp786) [2+14] | T21088 | |||||||||||
2.3.4.24 | Subfamily: ZNF134-like factors | ||||||||||||
2.3.4.25 | Subfamily: ZNF37A-like factors | ||||||||||||
2.3.4.25.3 | ZNF248 (Zfp248) [1+7] | T | |||||||||||
2.3.4.25.4 | ZNF334 (Zfp334) [9+5] | T | |||||||||||
2.3.4.25.5 | ZNF382 (KS1, Zfp382) [1+9] | T20560 | |||||||||||
2.3.4.0 | Subfamily: unclassified | ||||||||||||
2.3.4.0.1 | CASZ1 (CST, SRG, ZNF693) [3+1+1+3] | T19862 | |||||||||||
2.3.4.0.1.1 | CASZ1, isoform 1 | T19861 | |||||||||||
2.3.4.0.1.2 | CASZ1, isoform 2 [3+1] | T19863 | |||||||||||
2.3.4.0.2 | ZNF335 (NIF-1, Zfp335) [1+8+4] | T | |||||||||||
2.3.4.0.3 | PRDM8 (PFM5) [1+2] | T20089 | |||||||||||
2.3.4.0.4 | WIZ (ZNF803) [4+2+1+1+1+1+1] | T | |||||||||||
2.3.4.0.4.1 | WIZ, isoform L | T | |||||||||||
2.3.4.0.4.2 | WIZ, isoform S [1+1+1+1+1+1] | T | |||||||||||
2.3.4.0.4.3 | WIZ, isoform 2 [1+1+1+1+1] | T | |||||||||||
2.3.4.0.4.4 | WIZ, isoform 3 [4] | T | |||||||||||
2.3.4.0.5 | ZNF469 [1+1+3] | F | T | ||||||||||
2.3.4.0.6 | ZFPM1 (FOG1, ZFN89A) = 2.7.2.0.1 [3+1] | T02334 | |||||||||||
2.3.4.0.7 | ZBTB4 (KAISO-L1) [1+3+2] | T | |||||||||||
2.3.4.0.8 | ZBTB38 [2+3+5] | T | |||||||||||
2.3.4.0.9 | ZBTB39 [2+3+3] | T | |||||||||||
2.3.4.0.10 | ZNF295 (ZBTB21) [2+1+2+2+1] | T | |||||||||||
2.3.4.0.11 | ZNF827 [3+4+2] | T21121 | |||||||||||
2.3.4.0.11.1 | ZNF827, isoform 1 | T21120 | |||||||||||
2.3.4.0.11.2 | ZNF827, isoform 2 [2] | T21122 | |||||||||||
2.3.4.0.12 | PRDM13 (PFM10) [1+3] | T | |||||||||||
2.3.4.0.12.1 | PRDM13, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.4.0.12.2 | PRDM13, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.4.0.13 | ZNF646 (PFM10, Zfp646) [1+3] | T | F | ||||||||||
2.3.4.0.14 | ZNF579 (Zfp579) [3+2+3] | T20833 | |||||||||||
2.3.4.0.15 | RREB1 (FINB, Zep-1, LZ321) [3+2+1+5+1+1+2] | CCCCAAACACCCCC | T17652 | ||||||||||
2.3.4.0.15.1 | RREB1, isoform 1 | T17651 | |||||||||||
2.3.4.0.15.2 | RREB1, isoform 2 [3+2+1+5+1+1+2]] | T17653 | |||||||||||
2.3.4.0.15.3 | RREB1, isoform 3 [3+2+1+5+2+1+2] | T17654 | |||||||||||
2.3.4.0.15.4 | RREB1, isoform 4 [3+2+1+5+1] | T17655 | |||||||||||
2.3.4.0.16 | PRDM2 (G3B, MTB-ZF, MTE-BP, KMT8, RIZ) [2+1+3+1+1] | GTCATATGAC | T | ||||||||||
2.3.4.0.17 | ZNF800 (Zfp800) [1+3+2+1] | T21110 | |||||||||||
2.3.4.0.18 | ZNF618 [3+1] | T21454 | F | ||||||||||
2.3.4.0.18.1 | ZNF618, isoform 1 | T21453 | |||||||||||
2.3.4.0.18.2 | ZNF618, isoform 2 [3] | T21455 | |||||||||||
2.3.4.0.19 | ZNF277 (NRIF4, ZNF277P, Zfp277) [1+1] | T | |||||||||||
2.3.4.0.20 | TRPS1 (GC79) = 2.2.1.2.13 [1+1+3+2] | T19349 | |||||||||||
2.3.4.0.21 | ZNF451 (COASTER, Zfp451) [1+3+2+3+2] | T19504 | |||||||||||
2.3.4.0.22 | ZNF438 [3+1] | T | |||||||||||
2.3.4.0.23 | PEG3 (ZSCAN24) [4+1+5+2] | T | |||||||||||
2.3.4.0.23.1 | PEG3, isoform 1 | ||||||||||||
2.3.4.0.23.2 | PEG3, isoform 2 [2] | T22527 | |||||||||||
2.3.4.0.24 | ZNF507 (Zfp507) [2+1+3+2+1] | T20688 | |||||||||||
2.3.4.0.25 | ZNF236 (Zfp236) [9+4+4+4+4+5] | T | |||||||||||
2.3.4.0.26 | ZNF770 (Zfp770) [3+3+1+2+2] | T21047 | |||||||||||
2.3.4.0.27 | REST (NRSF, XBR) [1+7+1] | TTCAGCACCACGGACAGCGCC | T05934 | ||||||||||
2.3.4.0.27.1 | REST, isoform 1 | T09307 | |||||||||||
2.3.4.0.27.2 | REST, isoform 2 (N16, REST4) [1+4] | T10486 | |||||||||||
2.3.4.0.27.3 | REST, isoform 3 (N28) [1+4] | T26267 | |||||||||||
2.3.4.0.28 | ZFP57 (ZNF698) [4+3] | TTCAGCACCACGGACAGCGCC | T20308 | ||||||||||
2.3.4.0.28.1 | ZFP57, isoform 1 | T20307 | |||||||||||
2.3.4.0.28.2 | ZFP57, isoform 2 | T20309 | |||||||||||
2.3.4.0.29 | ZNF8 (HF.18, Zfp128) [6+1] | T22794 | |||||||||||
2.3.4.0.30 | ZNF597 (Zfp597) [4+3] | T | |||||||||||
2.3.4.0.31 | PRDM4 (PFM1) [1+5] | T18699 | |||||||||||
2.3.4.0.32 | PRDM15 (ZNF298) [1+15] | T | |||||||||||
2.3.4.0.33 | ZBTB41 (FRBZ1) [1+13] | T20243 | |||||||||||
2.3.4.0.34 | PRDM10 (PFM7, TRIS) [1+9] | T | |||||||||||
2.3.4.0.34.1 | PRDM10, isoform 1 | ||||||||||||
2.3.4.0.34.2 | PRDM10, isoform 2 [0] | ||||||||||||
2.3.4.0.35 | ZNF341 (Zfp341) [1+2+9] | T | F | ||||||||||
2.3.4.0.36 | ZNF513 (Zfp513) [3+5] | T20703 | |||||||||||
2.3.4.0.36.1 | ZNF513, isoform 1 | T20702 | |||||||||||
2.3.4.0.36.2 | ZNF513, isoform 2 | T20704 | |||||||||||
2.3.4.0.37 | ZNF142 (Zfp142) [14+17] | T | |||||||||||
2.3.4.0.38 | FIZ1 (ZNF798) [4+2+5] | T | |||||||||||
2.3.4.0.39 | ZNF628 (Zfp628) [7+2+6] | CAAGGTTGGTTGC | T08324 | ||||||||||
2.3.4.0.39.1 | ZNF628, isoform 1 | T08319 | |||||||||||
2.3.4.0.39.2 | ZNF628, isoform 2 [7] | T26369 | |||||||||||
2.3.4.0.40 | ZNF784 (Zfp784) [3+3] | T21081 | |||||||||||
2.3.4.0.41 | ZNF697 (Zfp697) [1+10] | T21002 | |||||||||||
2.3.4.0.42 | ZKSCAN5 (ZFP95) [4+9] | T21526 | |||||||||||
2.3.4.0.43 | ZNF316 (Zfp316) [6+9] | T20264 | |||||||||||
2.3.4.0.44 | ZNF775 (Zfp775) [4+4+3] | T21063 | |||||||||||
2.3.4.0.45 | ZNF467 (Zfp467) [7+5] | T19511 | |||||||||||
2.3.4.0.46 | ZNF787 (TTF-I-IP20, Zfp787) [5+2] | T21090 | |||||||||||
2.3.4.0.48 | ZNF48 (ZNF553, Zfp48, Zfp553) [8+2+2] | T21192 | |||||||||||
2.3.4.0.49 | ZNF629 (ZNF65, Zfp629) [15+3+1] | T20905 | |||||||||||
2.3.4.0.50 | ZNF668 (Zfp668) [13+3] | T20959 | |||||||||||
2.3.4.0.53 | ZNF445 (ZKSCAN15, ZNF168, Zfp445) [12+2] | T20627 | |||||||||||
2.3.4.0.56 | ZSCAN20 (KOX29, ZNF31, ZNF360) [4+6] | T | |||||||||||
2.3.4.0.56.1 | ZSCAN20, isoform 1 | T | |||||||||||
2.3.4.0.56.2 | ZSCAN20, isoform 2 | T | |||||||||||
2.3.4.0.64 | ZNF426 (Zfp426) [1+11] | T19487 | |||||||||||
2.3.4.0.65 | ZFP112 (ZNF112, ZNF228) [1+16] | T21386 | |||||||||||
2.3.4.0.65.1 | ZFP112, isoform 1 | T21385 | |||||||||||
2.3.4.0.65.2 | ZFP112, isoform 2 | T21387 | |||||||||||
2.3.4.0.67 | ZNF606 (ZNF328, Zfp606) [2+14] | T | |||||||||||
2.3.4.0.71 | PRDM9 (PFM6) [1+12] | T | |||||||||||
2.3.4.0.71.1 | PRDM9, isoform 1 (Meisetz) | ||||||||||||
2.3.4.0.71.2 | PRDM9, isoform 2 (Meisetz-S1) [0] | ||||||||||||
2.3.4.0.71.3 | PRDM9, isoform 3 (Meisetz-S2) [0] | ||||||||||||
2.3.4.0.71.4 | PRDM9, isoform 4 [0] | ||||||||||||
2.3.4.0.72 | ZBTB17 (MIZ1, ZNF151, ZNF60) [12+1] | T17704 | |||||||||||
2.3.4.0.73 | ZNF407 (Zfp407) [3+3+1+2+2+11] | T | |||||||||||
2.3.4.0.74 | E4F1 (p120E4F, p50E4F) [3+6] | TACGTCAC | T02287 | ||||||||||
2.3.4.0.74.1 | E4F1, isoform 1 | T14957 | |||||||||||
2.3.4.0.74.2 | E4F1, isoform 2 | T26091 | |||||||||||
2.3.4.0.74.3 | E4F1, isoform 3 | T26092 | |||||||||||
2.3.4.0.74.4 | E4F1, isoform 4 [3+1] | T26093 | |||||||||||
2.3.4.0.74.5 | E4F1, isoform 5 [2+6] | T26094 | |||||||||||
2.3.4.0.75 | ZNF462 (Zfp462) [1+2+2+1+3+1+1+3+2+1+4+5+1] | T | |||||||||||
2.3.4.0.76 | ZNF644 (ZEP2, Zfp644) [5+1+1] | T | |||||||||||
2.3.4.0.77 | ADNP (ADNP1) = 3.1.8.1.1 [4+3+2] | T21522 | |||||||||||
2.3.4.0.78 | ADNP2 (ZNF508) = 3.1.8.1.2 [1+1+1+1] | T19732 | |||||||||||
2.3.5 | Family: BED zinc finger factors | TGTCGCGACA | |||||||||||
2.3.5.0.3 | ZBED3 | T | |||||||||||
2.3.5.0.4 | ZBED4 | T | |||||||||||
2.3.5.0.6 | ZBED6 (MGR) | T17368 | |||||||||||
2.3.5.0.6.1 | ZBED6, isoform 1 (a) | T17346 | |||||||||||
2.3.5.0.6.2 | ZBED6, isoform 2 (b) | T17365 | |||||||||||
2.4 | Class: C6 zinc cluster factors | ||||||||||||
2.5 | Class: DM-type intertwined zinc finger factors | ||||||||||||
2.5.1 | Family: DMRT | TGATACATTGTTGC | |||||||||||
2.5.1.0.1 | DMRT1 | T10713 | |||||||||||
2.5.1.0.1.1 | DMRT1, isoform 1 (a) | T10712 | |||||||||||
2.5.1.0.1.2 | DMRT1, isoform 2 (b) | T26413 | |||||||||||
2.5.1.0.1.3 | DMRT1, isoform 3 (d) | T26414 | |||||||||||
2.5.1.0.1.4 | DMRT1, isoform 4 (c) | T26415 | |||||||||||
2.5.1.0.2 | DMRT2 | T10722 | |||||||||||
2.5.1.0.3 | DMRT3 | T10724 | |||||||||||
2.5.1.0.4 | DMRTA1 (DMRT4) | T10728 | |||||||||||
2.5.1.0.5 | DMRTA2 (DMRT5) | T10732 | |||||||||||
2.5.1.0.6 | DMRTB1 | T10730 | |||||||||||
2.5.1.0.7 | DMRTC2 | T10726 | |||||||||||
2.5.1.0.8 | DMRTC1a (no DM domain!) | T | |||||||||||
2.5.1.0.8.1 | DMRTC1a, isoform 1 (c) | T | |||||||||||
2.5.1.0.8.2 | DMRTC1a, isoform 2 (b) | T | |||||||||||
2.5.1.0.8.3 | DMRTC1a, isoform 3 (a) | T | |||||||||||
2.5.1.0.9 | DMRTC1b (no DM domain!) | T | |||||||||||
2.5.1.0.10 | DMRTC1c (no DM domain!) | T | |||||||||||
2.6 | Class: CXXC zinc finger factors | ||||||||||||
2.6.1 | Family: CpG-binding proteins | ||||||||||||
2.6.1.0.1 | CpG-binding protein (CXXC1, CFP1, CGBP, PCCX1, PHF18) | T19901 | |||||||||||
2.6.1.0.2 | MBD1 (CXXC3, PCM1) | T | |||||||||||
2.6.1.0.2.1 | MBD1, isoform 1 (a) | T | |||||||||||
2.6.1.0.2.2 | MBD1, isoform 2 (b) | T | |||||||||||
2.6.1.0.2.3 | MBD1, isoform 3 (d) | T | |||||||||||
2.6.1.0.2.4 | MBD1, isoform 4 | T | |||||||||||
2.6.1.0.2.5 | MBD1, isoform 5 | T | |||||||||||
2.6.1.0.3 | TET1 (CXXC6, LCX) | T | |||||||||||
2.6.1.0.4 | MLL (CXXC7, ALL1, HRX, HTRX, KMT2A, MLL1, TRX1) | T27835 | |||||||||||
2.6.1.0.4.1 | MLL, isoform 1 | T27239 | |||||||||||
2.6.1.0.4.2 | MLL, isoform 14P-18B | T27889 | |||||||||||
2.6.1.0.5 | KDM2A (CXXC8, FBL7, FBXL11, JHDM1A) | T27843 | |||||||||||
2.6.1.0.5.1 | KDM2A, isoform 1 | T27346 | |||||||||||
2.6.1.0.5.2 | KDM2A, isoform 2 | T27920 | |||||||||||
2.6.1.0.5.3 | KDM2A, isoform 3 | T27921 | |||||||||||
2.6.1.0.6 | DNMT1 (CXXC9, AIM, DNMT) | T27826 | |||||||||||
2.6.1.0.6.1 | DNMT1, isoform 1 (long) | T27185 | |||||||||||
2.6.1.0.6.2 | DNMT1, isoform 2 (short) | T27865 | |||||||||||
2.6.1.0.7 | MLL2 (HRX2, KMT2B, WBP7, MLL4, TRX2) | T19083 | |||||||||||
2.7 | Class: C2HC zinc finger factors | ||||||||||||
2.7.1 | Family: Myelin transcription factor-related proteins | AAGTT | |||||||||||
2.7.1.0.1 | MYT1 (MyT1, MTF1, MYTI, PLPB1) [7] | T22947 | |||||||||||
2.7.1.0.1.1 | MYT1, isoform 1 (NZF-2b) | T25788 | |||||||||||
2.7.1.0.1.2 | MYT1, isoform 2 (NZF-2a) [6] | T25789 | |||||||||||
2.7.1.0.1.3 | MYT1, isoform 3 [6] | T26205 | |||||||||||
2.7.1.0.2 | MYT1L (MyT1L, NZF-1) [6] | T27828 | |||||||||||
2.7.1.0.2.1 | MYT1L, isoform 1 | T27211 | |||||||||||
2.7.1.0.2.2 | MYT1L, isoform 2 | T27212 | |||||||||||
2.7.1.0.2.3 | MYT1L, isoform 3 [0] | ||||||||||||
2.7.1.0.2.4 | MYT1L, isoform 4 [2] | ||||||||||||
2.7.1.0.3 | ST18 (ZNF387, NZF-3) [6] | T | |||||||||||
2.7.2 | Family: Friend of GATA proteins | ||||||||||||
2.7.2.0.1 | FOG1 (ZFPM1, ZFN89A) [5] = 2.3.4.0.6 | T02334 | |||||||||||
2.7.2.0.2 | FOG2 (ZFPM2, ZFN89B) [5] = 2.3.2.4.6 | T18922 | F | ||||||||||
2.7.3 | Family: Histone acetyltransferases with C2HC zinc finger | ||||||||||||
2.7.3.0.1 | MYST1 (KAT8, TIP60 protein 1) [1] | T27842 | |||||||||||
2.7.3.0.1.1 | MYST1, isoform 1 | T27345 | |||||||||||
2.7.3.0.1.2 | MYST1, isoform 2 [0] | T27919 | |||||||||||
2.7.3.0.2 | MYST2 (KAT7, TIP60 protein 2, HBO1, HBOa) [1] | T | |||||||||||
2.7.3.0.2.1 | MYST2, isoform 1 | T | |||||||||||
2.7.3.0.2.2 | MYST2, isoform 2 | T | |||||||||||
2.7.3.0.2.3 | MYST2, isoform 3 | T | |||||||||||
2.7.3.0.2.4 | MYST2, isoform 4 | T | |||||||||||
2.7.3.0.2.5 | MYST2, isoform 5 | T | |||||||||||
2.7.3.0.3 | MYST3 (KAT6A, TIP60 protein 3, RUNXBP2, ZNF220, MOZ) [1] | T | |||||||||||
2.7.3.0.4 | MYST4 (KAT6B, TIP60 protein 4, MORF, MOZ2) [1] | T | |||||||||||
2.7.3.0.4.1 | MYST4, isoform 1 | T | |||||||||||
2.7.3.0.4.2 | MYST4, isoform 2 | T | |||||||||||
2.7.3.0.5 | KAT5 (HTATIP, TIP60) [1] | T27824 | |||||||||||
2.7.3.0.5.1 | KAT5, isoform 1 | T27282 | |||||||||||
2.7.3.0.5.2 | KAT5, isoform 2 | T27283 | |||||||||||
2.7.3.0.5.3 | KAT5, isoform 3 | T27284 | |||||||||||
2.7.3.0.5.4 | KAT5, isoform 4 | T27944 | |||||||||||
2.7.4 | Family: Lethal(3)malignant brain tumor-related proteins | ||||||||||||
2.7.4.0.1 | L3MBTL1 (L3MBT, L3MBTL) [1] | T | |||||||||||
2.7.5 | Family: LYAR-related proteins | ||||||||||||
2.7.5.0.1 | LYAR (PNAS-5) [2] | T | |||||||||||
2.8 | Class: C3H zinc finger factors | ||||||||||||
2.8.1 | Family: ZC3H8-related factors | ||||||||||||
2.8.1.0.1 | ZC3H8 (ZC3HDC8, FLIZ1) [3] | T | |||||||||||
2.8.1.0.2 | ZC3H4 [3] | T | |||||||||||
2.8.1.0.2.1 | ZC3H4, isoform 1 | T | |||||||||||
2.8.1.0.2.2 | ZC3H4, isoform 2 | T | |||||||||||
2.8.1.0.3 | ZC3H6 (ZC3HDC6) [3] | T | |||||||||||
2.8.1.0.3.1 | ZC3H6, isoform 1 | ||||||||||||
2.8.1.0.3.2 | ZC3H6, isoform 2 [0] | ||||||||||||
2.8.2 | Family: ZGPAT-related factors | ||||||||||||
2.8.2.0.1 | ZGPAT (GPATC6, GPATCH6, ZC3H9, ZC3HDC9, ZIP) [1] | T27855 | |||||||||||
2.8.3 | Family: RC3H-related factors | ||||||||||||
2.8.3.0.1 | RC3H2 (Roquin-2, MNAB, RNF164) [1] | T | |||||||||||
2.8.4 | Family: CNOT4-related factors | ||||||||||||
2.8.4.0.1 | CNOT4 (NOT4) [1] | T27838 | |||||||||||
2.8.4.0.1.1 | CNOT4, isoform 1 | T27257 | |||||||||||
2.8.4.0.1.2 | CNOT4, isoform 2 | T27258 | |||||||||||
2.8.4.0.1.3 | CNOT4, isoform 3 | T27940 | |||||||||||
2.9 | Class: C2CH THAP-type zinc finger factors | ||||||||||||
2.9.1 | Family: THAP-related factors | TTGCCCGTACT | |||||||||||
2.9.1.0.1 | THAP1 | T | |||||||||||
2.9.1.0.2 | THAP2 | T | |||||||||||
2.9.1.0.3 | THAP3 | T | |||||||||||
2.9.1.0.4 | THAP4 (CGI-36, PP238) | T | |||||||||||
2.9.1.0.4.1 | THAP4, isoform 1 | T | |||||||||||
2.9.1.0.4.2 | THAP4, isoform 2 | T | |||||||||||
2.9.1.0.7 | THAP7 | T | |||||||||||
2.9.1.0.11 | THAP11 (HRIHFB2206) | T | |||||||||||
2.9.1.0.12 | PRKRIR (P52RIPK, DAP4, THAP0) | T | |||||||||||
3 | Superclass: Helix-turn-helix domains | ||||||||||||
3.1 | Class: Homeo domain factors | ||||||||||||
3.1.1 | Family: HOX-related factors | ||||||||||||
3.1.1.1 | Subfamily: HOX1 | TAATTA | |||||||||||
3.1.1.1.1 | Hox-A1 (HOX1F, ERA-1) | T01696 | |||||||||||
3.1.1.1.1.1 | Hox-A1, isoform 1 (ERA-1-993) | ||||||||||||
3.1.1.1.1.2 | Hox-A1, isoform 2 (ERA-1-399) | ||||||||||||
3.1.1.1.2 | Hox-B1 (HOX2I) | T01720 | |||||||||||
3.1.1.1.3 | Hox-D1 (HOX4G) | T01750 | |||||||||||
3.1.1.2 | Subfamily: HOX2 | TAATTA | |||||||||||
3.1.1.2.1 | Hox-A2 (HOX1K) | T13907 | |||||||||||
3.1.1.2.2 | Hox-B2 (HOX2H) | T19758 | |||||||||||
3.1.1.3 | Subfamily: HOX3 | TAATTA | |||||||||||
3.1.1.3.1 | Hox-A3 (HOX1E) | T00378 | |||||||||||
3.1.1.3.2 | Hox-B3 (HOX2G) | T01724 | |||||||||||
3.1.1.3.3 | Hox-D3 (HOX4A) | T03339 | |||||||||||
3.1.1.4 | Subfamily: HOX4 | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.1.4.1 | Hox-A4 (HOX1D) | T01701 | F | ||||||||||
3.1.1.4.2 | Hox-B4 (HOX2F) | T01728 | |||||||||||
3.1.1.4.3 | Hox-C4 (HOX3E) | T03340 | |||||||||||
3.1.1.4.4 | Hox-D4 (HOX4B) | T | |||||||||||
3.1.1.5 | Subfamily: HOX5 | TAATTA | |||||||||||
3.1.1.5.1 | Hox-A5 (HOX1C) | T00377 | |||||||||||
3.1.1.5.2 | Hox-B5 (HOX2A) | T13933 | |||||||||||
3.1.1.5.3 | Hox-C5 (HOX3D) | T03351 | |||||||||||
3.1.1.6 | Subfamily: HOX6-7 | TAATTA | |||||||||||
3.1.1.6.1 | Hox-A6 (HOX1B) | T03338 | |||||||||||
3.1.1.6.2 | Hox-B6 (HOX2B) | T01733 | |||||||||||
3.1.1.6.3 | Hox-C6 (HOX3C) | T25653 | |||||||||||
3.1.1.6.3.1 | Hox-C6, isoform 1 (PRII) | T01744 | |||||||||||
3.1.1.6.3.2 | Hox-C6, isoform 2 (PRI) | T01743 | |||||||||||
3.1.1.6.4 | Hox-A7 (HOX1A) | T01278 | |||||||||||
3.1.1.6.5 | Hox-B7 (HOX2C) | T01735 | |||||||||||
3.1.1.7 | Subfamily: HOX8 | GTAATTA | |||||||||||
3.1.1.7.1 | Hox-B8 (HOX2D) | T01737 | |||||||||||
3.1.1.7.2 | Hox-C8 (HOX3A) | T01749 | |||||||||||
3.1.1.7.3 | Hox-D8 (HOX4E) | T | F | ||||||||||
3.1.1.8 | Subfamily: HOX9-13 | TCGTAAA | |||||||||||
3.1.1.8.1 | Hox-A9 (HOX1G) | T14354 | |||||||||||
3.1.1.8.1.1 | Hox-A9, isoform 1 | T01710 | |||||||||||
3.1.1.8.1.2 | Hox-A9, isoform 2 (T) | T04132 | |||||||||||
3.1.1.8.2 | Hox-B9 (HOX2E) | T01739 | |||||||||||
3.1.1.8.3 | Hox-C9 (HOX3B) | T03349 | |||||||||||
3.1.1.8.4 | Hox-D9 (HOX4C) | T01755 | |||||||||||
3.1.1.8.5 | Hox-A10 (HOX1H) | T01715 | |||||||||||
3.1.1.8.5.1 | Hox-A10, isoform 1 | T09504 | |||||||||||
3.1.1.8.5.2 | Hox-A10, isoform 2 | T09505 | |||||||||||
3.1.1.8.6 | Hox-C10 (HOX3I) | T03350 | |||||||||||
3.1.1.8.7 | Hox-D10 (HOX4D, HOX4E) | T01757 | |||||||||||
3.1.1.8.8 | Hox-A11 (HOX1I) | T01717 | |||||||||||
3.1.1.8.9 | Hox-C11 (HOX3H) | T03352 | |||||||||||
3.1.1.8.10 | Hox-D11 (HOX4F) | T01760 | |||||||||||
3.1.1.8.11 | Hox-C12 (HOX3F) | T03353 | |||||||||||
3.1.1.8.12 | Hox-D12 (HOX4H) | T01763 | |||||||||||
3.1.1.8.13 | Hox-A13 (HOX1J) | T03337 | F | ||||||||||
3.1.1.8.14 | Hox-B13 | T03802 | |||||||||||
3.1.1.8.15 | Hox-C13 (HOX3G) | T03354 | |||||||||||
3.1.1.8.16 | Hox-D13 (HOX4I) | T01765 | |||||||||||
3.1.1.9 | Subfamily: CDX (Caudal type homeobox) | GGTAATAAA | |||||||||||
3.1.1.9.1 | CDX-1 | T01999 | F | ||||||||||
3.1.1.9.2 | CDX-2 (CDX-3) | T02002 | |||||||||||
3.1.1.9.3 | CDX-4 | T03245 | |||||||||||
3.1.1.10 | Subfamily: EVX (Even-skipped homolog) | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.1.10.1 | EVX-1 | T02023 | |||||||||||
3.1.1.10.2 | EVX-2 | T16867 | |||||||||||
3.1.1.11 | Subfamily: GBX (Gastrulation brain homeobox) | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.1.11.1 | GBX-1 | T16868 | |||||||||||
3.1.1.11.2 | GBX-2 | T04020 | |||||||||||
3.1.1.12 | Subfamily: GSX | TAATTA | |||||||||||
3.1.1.12.1 | GSX-1 (GSH-1) | T05100 | |||||||||||
3.1.1.12.2 | GSX-2 (GSH-2) | T17003 | |||||||||||
3.1.1.13 | Subfamily: MNX | ACTAATTA | |||||||||||
3.1.1.13.1 | MNX1 (HB9, HLXB9) | T03421 | |||||||||||
3.1.1.14 | Subfamily: MEOX | TAATTA | |||||||||||
3.1.1.14.1 | MEOX-1 (MOX-1) | T04047 | |||||||||||
3.1.1.14.2 | MEOX-2 (MOX-2) | T04048 | |||||||||||
3.1.1.15 | Subfamily: PDX | TAATTA | |||||||||||
3.1.1.15.1 | PDX-1 (IPF-1) | T02057 | |||||||||||
3.1.2 | Family: NK-related factors | ||||||||||||
3.1.2.1 | Subfamily: BARHL | AACCAATTA | |||||||||||
3.1.2.1.1 | BarH-L1 | T03920 | |||||||||||
3.1.2.1.2 | BarH-L2 | T16779 | |||||||||||
3.1.2.2 | Subfamily: BARX | TAATTA | |||||||||||
3.1.2.2.1 | BARX-1 | T02403 | |||||||||||
3.1.2.2.2 | BARX-2 | T11228 | |||||||||||
3.1.2.3 | Subfamily: BSX | TAATTA | |||||||||||
3.1.2.3.1 | BSX-1 (BSX) | T16798 | |||||||||||
3.1.2.3.1.1 | BSX-1, isoform 1 (Bsxla) | T16797 | |||||||||||
3.1.2.3.1.2 | BSX-1, isoform 2 (Bsxlb) | T16800 | |||||||||||
3.1.2.4 | Subfamily: DBX | TTAATTA | |||||||||||
3.1.2.4.1 | DBX-1 | T08090 | |||||||||||
3.1.2.4.2 | DBX-2 | T08092 | |||||||||||
3.1.2.5 | Subfamily: DLX | TAATTA | |||||||||||
3.1.2.5.1 | DLX-1 | T02006 | |||||||||||
3.1.2.5.2 | DLX-2 | T02009 | |||||||||||
3.1.2.5.3 | DLX-3 | T02409 | |||||||||||
3.1.2.5.4 | DLX-4 | T03993 | |||||||||||
3.1.2.5.5 | DLX-5 | T03989 | |||||||||||
3.1.2.5.5.1 | DLX-5, isoform 1 (α) | T08471 | |||||||||||
3.1.2.5.5.2 | DLX-5, isoform 2 (β) | T17006 | |||||||||||
3.1.2.5.5.3 | DLX-5, isoform 3 (γ) | T17007 | |||||||||||
3.1.2.5.6 | DLX-6 | T03990 | F | ||||||||||
3.1.2.5.6.1 | DLX-6, isoform 1 | T14717 | |||||||||||
3.1.2.5.6.2 | DLX-6, isoform 2 | T26086 | |||||||||||
3.1.2.6 | Subfamily: EMX | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.2.6.1 | EMX-1 | T02011 | |||||||||||
3.1.2.6.2 | EMX-2 | T02013 | |||||||||||
3.1.2.7 | Subfamily: EN (Engrailed-like factors) | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.2.7.1 | EN-1 | T02016 | F | ||||||||||
3.1.2.7.2 | EN-2 | T02020 | |||||||||||
3.1.2.8 | Subfamily: HHEX | ATTAA | |||||||||||
3.1.2.8.1 | HHEX (PRH) | T03417 | |||||||||||
3.1.2.9 | Subfamily: HLX | TAATTAATTA | |||||||||||
3.1.2.9.1 | HLX-1 (HB24) | T02053 | |||||||||||
3.1.2.10 | Subfamily: LBX | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.2.10.1 | LBX-1 | T04315 | |||||||||||
3.1.2.10.2 | LBX-2 | T16903 | |||||||||||
3.1.2.11 | Subfamily: MSX | ACCAATTA | |||||||||||
3.1.2.11.1 | MSX-1 (HOX7) | T02072 | |||||||||||
3.1.2.11.2 | MSX-2 (HOX8) | T02076 | |||||||||||
3.1.2.12 | Subfamily: NANOG | CCATTT | |||||||||||
3.1.2.12.1 | NANOG | ||||||||||||
3.1.2.12.1.1 | NANOG, isoform 1 | ||||||||||||
3.1.2.12.1.2 | NANOG, isoform 2 | ||||||||||||
3.1.2.13 | Subfamily: NK-1 | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.2.13.1 | NKX-1.1 (NKX1-1, SAX-2) | T16916 | |||||||||||
3.1.2.13.2 | NKX-1.2 (NKX1-2, SAX-1) | T16801 | |||||||||||
3.1.2.14 | Subfamily: NK-2.1 | CCACTTGA | |||||||||||
3.1.2.14.1 | NKX-2.1 (NKX2-1, TTF-1) | T00859 | |||||||||||
3.1.2.14.2 | NKX-2.4 (NKX2-4, NK-2HD) | T16918 | |||||||||||
3.1.2.15 | Subfamily: NK-2.2 | CCACTTGA | |||||||||||
3.1.2.15.1 | NKX-2.2 (NKX2-2, NKX2B) | T02384 | |||||||||||
3.1.2.15.2 | NKX-2.8 (NKX2-8, NKX2-9, NKX2G, NKX2H) | T04338 | |||||||||||
3.1.2.16 | Subfamily: NK-3 | AAGTACTT | |||||||||||
3.1.2.16.1 | NKX-3.1 (NKX3-1, NKX3A) | T04256 | |||||||||||
3.1.2.16.2 | NKX-3.2 (NKX3-2, NKX3B) | T02667 | F | ||||||||||
3.1.2.17 | Subfamily: NK-4 | CCACTTAA | |||||||||||
3.1.2.17.1 | NKX-2.3 (NKX2-3, NKX2C, NKX4-3) | T04325 | |||||||||||
3.1.2.17.2 | NKX-2.5 (NKX2-5, NKX2E, NKX4-1, CSX) | T01675 | |||||||||||
3.1.2.17.3 | NKX-2.6 (NKX2-6, NKX2F, NKX4-2, CSX2) | T04342 | |||||||||||
3.1.2.18 | Subfamily: NK-5/HMX | AGCAATTAA | |||||||||||
3.1.2.18.1 | HMX-1 (H6, NKX5-3, NKX-5.3) | T04444 | |||||||||||
3.1.2.18.2 | HMX-2 (H6L, NKX5-2, NKX-5.2) | T22946 | |||||||||||
3.1.2.18.3 | HMX-3 (NKX5-1, NKX-5.1) | T04446 | |||||||||||
3.1.2.19 | Subfamily: NK-6 | AATAATTA | |||||||||||
3.1.2.19.1 | NKX-6.1 (NKX6-1, NKX6A) | T04269 | |||||||||||
3.1.2.19.2 | NKX-6.2 (NKX6-2, NKX6B) | T02050 | |||||||||||
3.1.2.19.3 | NKX-6.3 (NKX6-3) | T16930 | |||||||||||
3.1.2.20 | Subfamily: NOTO | ||||||||||||
3.1.2.20.1 | NOTO | T19770 | |||||||||||
3.1.2.21 | Subfamily: TLX | AATTAATA | |||||||||||
3.1.2.21.1 | TLX-1 (HOX11, TCL-3) | T02055 | |||||||||||
3.1.2.21.2 | TLX-2 (HOX11L1, NCX) | T04368 | |||||||||||
3.1.2.21.3 | TLX-3 (HOX11L2) | T04314 | |||||||||||
3.1.2.22 | Subfamily: VAX | TAATTA | |||||||||||
3.1.2.22.1 | VAX-1 | T03274 | |||||||||||
3.1.2.22.1.1 | VAX-1, isoform 1 | T14527 | |||||||||||
3.1.2.22.1.2 | VAX-1, isoform 2 | T26350 | |||||||||||
3.1.2.22.2 | VAX-2 | T03276 | |||||||||||
3.1.2.23 | Subfamily: VENTX | ||||||||||||
3.1.3 | Family: Paired-related HD factors | ||||||||||||
3.1.3.1 | Subfamily: ALX | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.3.1.1 | ALX-1 (CART-1) | T03999 | |||||||||||
3.1.3.1.2 | ALX-3 | T03343 | |||||||||||
3.1.3.1.3 | ALX-4 | T02967 | |||||||||||
3.1.3.2 | Subfamily: ARGFX | ||||||||||||
3.1.3.3 | Subfamily: ARX | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.3.3.1 | ARX | T16770 | |||||||||||
3.1.3.4 | Subfamily: DMBX | GGATTA | |||||||||||
3.1.3.4.1 | DMBX (MBX, OTX-3, PAXB) | T06253 | |||||||||||
3.1.3.4.1.1 | DMBX, isoform 1 | T11177 | |||||||||||
3.1.3.4.1.2 | DMBX, isoform 2 | T26087 | |||||||||||
3.1.3.5 | Subfamily: DPRX | ||||||||||||
3.1.3.6 | Subfamily: DRGX | ||||||||||||
3.1.3.6.1 | DRGX (PRRXL1, Drg11) | T19744 | |||||||||||
3.1.3.6.1.1 | DRGX, isoform 1 | T25980 | |||||||||||
3.1.3.6.1.2 | DRGX, isoform 2 (Prrxl1-B) | T19743 | |||||||||||
3.1.3.7 | Subfamily: DUX | TCTAATTGAGAATTAC | |||||||||||
3.1.3.8 | Subfamily: ESX | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.3.9 | Subfamily: GSC | GGATTA | |||||||||||
3.1.3.9.1 | GSC | T02047 | |||||||||||
3.1.3.9.2 | GSC-2 | T04039 | |||||||||||
3.1.3.10 | Subfamily: HESX | TAATTGAATTA | |||||||||||
3.1.3.10.1 | HESX-1 | T02785 | |||||||||||
3.1.3.11 | Subfamily: HOPX | ||||||||||||
3.1.3.11.1 | HOPX-1 | T | |||||||||||
3.1.3.12 | Subfamily: ISX | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.3.12.1 | ISX | T17019 | |||||||||||
3.1.3.12.1.1 | ISX, isoform 1 | T17018 | |||||||||||
3.1.3.12.1.2 | ISX, isoform 2 | T26163 | |||||||||||
3.1.3.13 | Subfamily: LEUTX | ||||||||||||
3.1.3.14 | Subfamily: MIX | ||||||||||||
3.1.3.14.1 | MIXL1 | T04800 | |||||||||||
3.1.3.15 | Subfamily: NOBOX | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.3.16 | Subfamily: OTP | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.3.16.1 | OTP | T16920 | |||||||||||
3.1.3.17 | Subfamily: OTX | GGGATTAA | |||||||||||
3.1.3.17.1 | OTX-1 | T02080 | |||||||||||
3.1.3.17.2 | OTX-2 | T02083 | |||||||||||
3.1.3.17.3 | CRX (CORD-2) | T03461 | |||||||||||
3.1.3.18 | Subfamily: PHOX | ATAATTAA | |||||||||||
3.1.3.18.1 | PHOX-2A (ARIX, PMX2A) | T02090 | |||||||||||
3.1.3.18.2 | PHOX-2B (PMX2B) | T03976 | |||||||||||
3.1.3.19 | Subfamily: PITX | GGGATTAA | |||||||||||
3.1.3.19.1 | PITX-1 (BFT, PTX1) | T02415 | |||||||||||
3.1.3.19.2 | PITX-2 (ARP, RGS, RIEG1, Ptx2) | T09186 | |||||||||||
3.1.3.19.2.1 | Ptx2A | T02410 | |||||||||||
3.1.3.19.2.2 | Ptx2B | T02412 | |||||||||||
3.1.3.19.2.3 | Ptx2C | T17005 | |||||||||||
3.1.3.19.2.4 | Ptx2Cα | T25959 | |||||||||||
3.1.3.19.2.5 | Ptx2Cβ | T25960 | |||||||||||
3.1.3.19.3 | PITX-3 (PTX3) | T02666 | |||||||||||
3.1.3.20 | Subfamily: PROP | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.3.20.1 | PROP-1 | T | |||||||||||
3.1.3.21 | Subfamily: PRRX | GCTAATTAGC | |||||||||||
3.1.3.21.1 | PRRX-1 (PHOX1, PMX1) | T02966 | |||||||||||
3.1.3.21.1.1 | PRRX-1, isoform 1 (K2-a) | T02060 | |||||||||||
3.1.3.21.1.2 | PRRX-1, isoform 2 (K2-b) | T02061 | |||||||||||
3.1.3.21.2 | PRRX-2 (PMX2, PRX2) | T01483 | |||||||||||
3.1.3.22 | Subfamily: RAX | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.3.22.1 | RAX (RX) | T03502 | |||||||||||
3.1.3.23 | Subfamily: RHOX | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.3.24 | Subfamily: SEBOX | ||||||||||||
3.1.3.24.1 | SEBOX (OG-9) | T03309 | |||||||||||
3.1.3.25 | Subfamily: SHOX | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.3.25.2 | SHOX-2 (OG-12X, SHOT) | T14734 | |||||||||||
3.1.3.25.2.1 | SHOX-2, isoform 1 (OG12A) | T03310 | |||||||||||
3.1.3.25.2.2 | SHOX-2, isoform 2 (OG12B) | T26289 | |||||||||||
3.1.3.26 | Subfamily: TPRX | ||||||||||||
3.1.3.27 | Subfamily: UNCX | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.3.27.1 | UNCX (Uncx4.1) | T03307 | |||||||||||
3.1.3.28 | Subfamily: VSX | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.3.28.1 | VSX-1 (RINX) | T16785 | |||||||||||
3.1.3.28.2 | VSX-2 (HOX10) | T02970 | |||||||||||
3.1.4 | Family: TALE-type homeo domain factors | ||||||||||||
3.1.4.1 | Subfamily: IRX (Iroquois) | TACATGTA | |||||||||||
3.1.4.1.1 | IRX-1 | T04281 | |||||||||||
3.1.4.1.2 | IRX-2 | T14754 | |||||||||||
3.1.4.1.3 | IRX-3 | T02439 | |||||||||||
3.1.4.1.3.1 | IRX-3, isoform 1 | T11255 | |||||||||||
3.1.4.1.3.2 | IRX-3, isoform 2 | T26162 | |||||||||||
3.1.4.1.4 | IRX-4 | T04276 | |||||||||||
3.1.4.1.5 | IRX-5 | T04283 | |||||||||||
3.1.4.1.6 | IRX-6 | T08164 | |||||||||||
3.1.4.2 | Subfamily: MEIS | AGCTGTCAA | |||||||||||
3.1.4.2.1 | Meis1 | T09993 | |||||||||||
3.1.4.2.1.1 | Meis1, isoform 1 (Meis1A) | T03388 | |||||||||||
3.1.4.2.1.2 | Meis1, isoform 2 (Meis1B) | T03389 | |||||||||||
3.1.4.2.1.3 | Meis1, isoform 3 | T26190 | |||||||||||
3.1.4.2.2 | Meis2 | T11160 | |||||||||||
3.1.4.2.2.1 | Meis2A | T03405 | |||||||||||
3.1.4.2.2.2 | Meis2B | T03407 | |||||||||||
3.1.4.2.2.3 | Meis2C | T03408 | |||||||||||
3.1.4.2.2.4 | Meis2D | T03409 | |||||||||||
3.1.4.2.3 | Meis3 | T03406 | |||||||||||
3.1.4.2.3.1 | Meis3, isoform 1 | T11188 | |||||||||||
3.1.4.2.3.2 | Meis3, isoform 2 | T25908 | |||||||||||
3.1.4.3 | Subfamily: MKX (Mohawk) | ||||||||||||
3.1.4.3.1 | MKX (IRX-L1) | T | |||||||||||
3.1.4.4 | Subfamily: PBX | CATCAAT | |||||||||||
3.1.4.4.1 | PBX-1 | T08131 | |||||||||||
3.1.4.4.1.1 | PBX-1a | T03451 | |||||||||||
3.1.4.4.1.2 | PBX-1b | T02088 | |||||||||||
3.1.4.4.2 | PBX-2 | T04127 | |||||||||||
3.1.4.4.3 | PBX-3 | T14296 | |||||||||||
3.1.4.4.3.1 | PBX-3a | T04125 | |||||||||||
3.1.4.4.3.2 | PBX-3b | T04126 | |||||||||||
3.1.4.4.4 | PBX-4 | T19780 | |||||||||||
3.1.4.4.4.1 | PBX-4, isoform 1 | T19779 | |||||||||||
3.1.4.4.4.2 | PBX-4, isoform 2 | T19781 | |||||||||||
3.1.4.5 | Subfamily: PKNOX | ACCTGTCAAT | |||||||||||
3.1.4.5.1 | PKNOX-1 (PREP-1) | T04121 | |||||||||||
3.1.4.5.2 | PKNOX-2 (PREP-2) | T16934 | |||||||||||
3.1.4.6 | Subfamily: TGIF | AGCTGTCAAT | |||||||||||
3.1.4.6.1 | TGIF-1 | T04077 | |||||||||||
3.1.4.6.1.1 | TGIF-1, isoform 1 | T10218 | |||||||||||
3.1.4.6.1.2 | TGIF-1, isoform 2 | T17016 | |||||||||||
3.1.4.6.2 | TGIF-2 | T16763 | |||||||||||
3.1.4.6.3 | TGIF-2LX | T | |||||||||||
3.1.5 | Family: HD-LIM factors | AATTAA; | |||||||||||
3.1.5.1 | Subfamily: ISL | ATCAATTAA | |||||||||||
3.1.5.1.1 | ISL-1 (Islet-1) | T09161 | |||||||||||
3.1.5.1.1.1 | ISL-1, isoform 1 (α) | T06054 | |||||||||||
3.1.5.1.1.2 | ISL-1, isoform 2 (β) | T06055 | |||||||||||
3.1.5.1.2 | ISL-2 (Islet-2) | T16901 | |||||||||||
3.1.5.2 | Subfamily: Lhx-1-like factors | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.5.2.1 | Lhx1 (Lim-1) | T01961 | |||||||||||
3.1.5.2.2 | Lhx5 | T04181 | |||||||||||
3.1.5.3 | Subfamily: Lhx-2-like factors | TAATTA | |||||||||||
3.1.5.3.1 | Lhx2 (LH-2) | T01969 | |||||||||||
3.1.5.3.2 | Lhx9 | T11357 | |||||||||||
3.1.5.3.2.1 | Lhx9, isoform 1 β | T04192 | |||||||||||
3.1.5.3.2.2 | Lhx9, isoform 2 α | T04195 | |||||||||||
3.1.5.3.2.3 | Lhx9, isoform 3 | T25470 | |||||||||||
3.1.5.3.2.4 | Lhx9, isoform 4 | T26174 | |||||||||||
3.1.5.4 | Subfamily: Lhx-3-like factors | TAATTA | |||||||||||
3.1.5.4.1 | Lhx3 | T10879 | |||||||||||
3.1.5.4.1.1 | Lhx3, isoform A | T01964 | |||||||||||
3.1.5.4.1.2 | Lhx3, isoform B | T04840 | |||||||||||
3.1.5.4.2 | Lhx4 | T03542 | |||||||||||
3.1.5.5 | Subfamily: Lhx-6-like factors | CTAATTAG | |||||||||||
3.1.5.5.1 | Lhx6 (Lhx6.1) | T05162 | |||||||||||
3.1.5.5.1.1 | Lhx6, isoform 1 (Lhx6.1a) | T04187 | |||||||||||
3.1.5.5.1.2 | Lhx6, isoform 2 (Lhx6.1b) | T04188 | |||||||||||
3.1.5.5.2 | Lhx8 | T11354 | |||||||||||
3.1.5.6 | Subfamily: Lmx | TTAATTAA | |||||||||||
3.1.5.6.1 | Lmx-1α (LMX-1.1, LMX1A) | T04300 | |||||||||||
3.1.5.6.2 | Lmx-1β (LMX-1.2, LMX1B) | T04303 | |||||||||||
3.1.6 | Family: HD-SINE factors | GGTATCA | |||||||||||
3.1.6.1 | Subfamily: SIX1-like factors | GGGTATCA | |||||||||||
3.1.6.1.1 | SIX1 | T03262 | |||||||||||
3.1.6.1.2 | SIX2 | T03261 | |||||||||||
3.1.6.2 | Subfamily: SIX3-like factors | GGGTATCA | |||||||||||
3.1.6.2.1 | SIX3 | T09227 | |||||||||||
3.1.6.2.1.1 | SIX3A (α) | T03263 | |||||||||||
3.1.6.2.1.2 | SIX3B (β) | T03270 | |||||||||||
3.1.6.2.2 | SIX6 | T03272 | |||||||||||
3.1.6.3 | Subfamily: SIX4-like factors | GGTGTCA | |||||||||||
3.1.6.3.1 | SIX4 | T08392 | |||||||||||
3.1.6.3.1.1 | SIX4, isoform 1 (SM) | T03264 | |||||||||||
3.1.6.3.1.2 | SIX4, isoform 2 (M18) | T03265 | |||||||||||
3.1.6.3.1.3 | SIX4, isoform 3 (M8) | T03266 | |||||||||||
3.1.6.3.2 | SIX5 | T03271 | |||||||||||
3.1.7 | Family: HD-PROS factors | ||||||||||||
3.1.7.0.1 | PROX-1 | T | |||||||||||
3.1.7.0.2 | PROX-2 | T | |||||||||||
3.1.8 | Family: HD-ZF factors | ||||||||||||
3.1.8.1 | Subfamily: ADNP | ||||||||||||
3.1.8.1.1 | ADNP1 = 2.3.4.0.77 | T21522 | |||||||||||
3.1.8.1.2 | ADNP2 (ZNF508) = 2.3.4.0.78 | T19732 | |||||||||||
3.1.8.2 | Subfamily: TSHZ | ||||||||||||
3.1.8.2.1 | TSHZ-1 | T19791 | |||||||||||
3.1.8.2.2 | TSHZ-2 | T19795 | F | ||||||||||
3.1.8.2.3 | TSHZ-3 | T19799 | |||||||||||
3.1.8.3 | Subfamily: ZEB | CACCTG | |||||||||||
3.1.8.3.1 | ZEB1 (TCF-8) | T03915 | |||||||||||
3.1.8.3.2 | ZEB2 (SMADIP1) | T04864 | |||||||||||
3.1.8.4 | Subfamily: ZFHX | ||||||||||||
3.1.8.4.1 | ZFHX2 (ZFH-2) | T | |||||||||||
3.1.8.4.2 | ZFHX3 (ZFH-3, ATBF1) | T03881 | |||||||||||
3.1.8.4.3 | ZFHX4 (ZFH-4) | T21506 | |||||||||||
3.1.8.5 | Subfamily: ZHX | ATCGTTTT | |||||||||||
3.1.8.5.1 | ZHX1 | T04356 | |||||||||||
3.1.8.5.2 | ZHX2 (AFP) | T19824 | |||||||||||
3.1.8.5.3 | ZHX3 (TIX1) | T19826 | |||||||||||
3.1.8.5.4 | HOMEZ | T16893 | |||||||||||
3.1.8.5.4.1 | HOMEZ, isoform 1 | T16892 | |||||||||||
3.1.8.5.4.2 | HOMEZ, isoform 2 | T16896 | |||||||||||
3.1.9 | Family: HD-CUT factors | ||||||||||||
3.1.9.1 | Subfamily: ONECUT | AAATCAAT | |||||||||||
3.1.9.1.1 | ONECUT-1 (HNF6, HNF-6α, OC-1) | T03296 | |||||||||||
3.1.9.1.2 | ONECUT-2 (HNF-6β, OC-2) | T16615 | F | ||||||||||
3.1.9.1.3 | ONECUT-3 (OC-3) | T19774 | |||||||||||
3.1.9.2 | Subfamily: CUX | TGATCA | |||||||||||
3.1.9.2.1 | Cux-1 (CDP, Cut-L1) | T09991 | F | ||||||||||
3.1.9.2.1.1 | Cux-1, isoform 1 (CASP) | T17015 | |||||||||||
3.1.9.2.1.2 | Cux-1, isoform 2 | T17013 | |||||||||||
3.1.9.2.1.3 | Cux-1, isoform 3 | T26079 | |||||||||||
3.1.9.2.1.4 | Cux-1, isoform 4 (CASP) | T02042 | |||||||||||
3.1.9.2.1.5 | Cux-1, isoform 5 | T17012 | |||||||||||
3.1.9.2.1.6 | Cux-1, isoform 6 | T17014 | |||||||||||
3.1.9.2.2 | Cux-2 (Cut-L2) | T04456 | F | ||||||||||
3.1.9.3 | Subfamily: SATB | TAATGA | |||||||||||
3.1.9.3.1 | SATB-1 | T17580 | |||||||||||
3.1.9.3.2 | SATB-2 | T | |||||||||||
3.1.9.3.2.1 | SATB-2, isoform 1 | T | |||||||||||
3.1.9.3.2.2 | SATB-2, isoform 2 | T | |||||||||||
3.1.10 | Family: POU domain factors | ||||||||||||
3.1.10.1 | Subfamily: POU1 (Pit-1-like factors) | TAATTAATTA | |||||||||||
3.1.10.1.1 | POU1F1 (Pit-1, GHF-1) | T01172 | |||||||||||
3.1.10.1.1.1 | POU1F1, isoform 1 (Pit-1) | T09174 | |||||||||||
3.1.10.1.1.2 | POU1F1, isoform 2 (Pit-1T) | T26243 | |||||||||||
3.1.10.1.1.3 | POU1F1, isoform 3 (Pit-1a) | T17004 | |||||||||||
3.1.10.2 | Subfamily: POU2 (Oct-1/2-like factors) | TATGCAAAT | |||||||||||
3.1.10.2.1 | POU2F1 (Oct-1, OTF-1) | T01192 | |||||||||||
3.1.10.2.1.1 | POU2F1, isoform 1 (Oct-1A) | T00644 | |||||||||||
3.1.10.2.1.2 | POU2F1, isoform 2 (Oct-1B) | T01862 | |||||||||||
3.1.10.2.1.3 | POU2F1, isoform 3 (Oct-1C) | T01863 | |||||||||||
3.1.10.2.1.4 | POU2F1, isoform 4 | T26248 | |||||||||||
3.1.10.2.1.5 | POU2F1, isoform 5 (Oct-1R) | T26249 | |||||||||||
3.1.10.2.1.6 | POU2F1, isoform 6 | T26250 | |||||||||||
3.1.10.2.1.7 | POU2F1, isoform 7 | T26251 | |||||||||||
3.1.10.2.1.8 | POU2F1, isoform 8 | T26252 | |||||||||||
3.1.10.2.1.9 | POU2F1, isoform 9 | T26253 | |||||||||||
3.1.10.2.1.10 | POU2F1, isoform 10 (Oct-1Z) | T26387 | |||||||||||
3.1.10.2.1.11 | POU2F1, isoform 11 | T26388 | |||||||||||
3.1.10.2.1.12 | POU2F1, isoform 12 | T26389 | |||||||||||
3.1.10.2.2 | POU2F2 (Oct-2, OTF-2) | T13860 | |||||||||||
3.1.10.2.2.1 | POU2F2, isoform 1 (OCT2.1) | T01864 | |||||||||||
3.1.10.2.2.2 | POU2F2, isoform 2 (OCT2.2) | T00648 | |||||||||||
3.1.10.2.2.3 | POU2F2, isoform 3 (OCT2.3) | T01865 | |||||||||||
3.1.10.2.2.4 | POU2F2, isoform 4 (OCT2.4) | T01866 | |||||||||||
3.1.10.2.2.5 | POU2F2, isoform 5 (OCT2.5) | T00964 | |||||||||||
3.1.10.2.2.6 | POU2F2, isoform 6 (OCT2.6) | T01867 | |||||||||||
3.1.10.2.2.7 | POU2F2, isoform 7 (OCT2.7) | T26254 | |||||||||||
3.1.10.2.3 | POU2F3 (Oct-11, OTF-11, Skn-1) | T01874 | |||||||||||
3.1.10.3 | Subfamily: POU3 (Oct-6-like factors) | TAATTAATTA | |||||||||||
3.1.10.3.1 | POU3F1 (Oct-6, OTF-6, SCIP) | T18500 | |||||||||||
3.1.10.3.2 | POU3F2 (Oct-7, OTF-7, Brn-2) | T01873 | |||||||||||
3.1.10.3.3 | POU3F3 (Oct-8, OTF-8, Brn-1) | T00658 | |||||||||||
3.1.10.3.4 | POU3F4 (Oct-9, OTF-9, Brn-4) | T00659 | |||||||||||
3.1.10.4 | Subfamily: POU4 (Brn-3-like factors) | ATTAATGA | |||||||||||
3.1.10.4.1 | POU4F1 (Brn-3A, Oct-T1) | T06590 | |||||||||||
3.1.10.4.2 | POU4F2 (Brn-3B) | T01881 | |||||||||||
3.1.10.4.3 | POU4F3 (Brn-3C) | T04462 | |||||||||||
3.1.10.5 | Subfamily: POU5 (Oct-3/4-like factors) | ||||||||||||
3.1.10.5.1 | POU5F1 (Oct-3, Oct-4, OTF-3) | T00546 | |||||||||||
3.1.10.5.3 | POU5F2 (SPRM-1) | T19723 | |||||||||||
3.1.10.6 | Subfamily: POU6 (Brn-5-like factors) | TAATGAG | |||||||||||
3.1.10.6.1 | POU6F1 (Brn-5) | T11287 | |||||||||||
3.1.10.6.1.1 | POU6F1, isoform C2 | T01888 | |||||||||||
3.1.10.6.1.2 | POU6F1, isoform C1 | T01889 | |||||||||||
3.1.10.6.1.3 | POU6F1, isoform C7 | T01890 | |||||||||||
3.1.10.6.2 | POU6F2 (Brn-5) | T19728 | |||||||||||
3.1.10.7 | Subfamily: HNF1-like factors | GTTAATGATTAAC | |||||||||||
3.1.10.7.1 | HNF-1α (HNF-1A, LF-B1) | T01211 | |||||||||||
3.1.10.7.2 | HNF-1β (HNF-1B, vHNF1, LF-B3) | T00890 | |||||||||||
3.1.10.7.2.1 | HNF-1β, isoform 1 | T09049 | |||||||||||
3.1.10.7.2.2 | HNF-1β, isoform 2 | T10376 | |||||||||||
3.1.10.7.2.3 | HNF-1β, isoform 3 | T17010 | |||||||||||
3.1.10.7.2.4 | HNF-1β, isoform 4 | T17011 | |||||||||||
3.1.10.7.3 | HMBOX1 (HNF-1LA) | T16882 | |||||||||||
3.1.10.7.3.1 | HMBOX1, isoform 1 | T16881 | |||||||||||
3.1.10.7.3.2 | HMBOX1, isoform 2 | T16885 | |||||||||||
3.1.10.7.3.3 | HMBOX1, isoform 3 | T16887 | |||||||||||
3.1.10.7.3.4 | HMBOX1, isoform 4 | T16888 | |||||||||||
3.1.10.8 | Subfamily: HDX-like factors | GAAATCA | |||||||||||
3.1.10.8.1 | HDX | T16877 | |||||||||||
3.1.10.8.1.1 | HDX, isoform 1 | T16876 | |||||||||||
3.1.10.8.1.2 | HDX, isoform 2 | T16878 | |||||||||||
3.1.11 | Family: PHTF factors | ||||||||||||
3.1.11.0.1 | PHTF1 | T27847 | |||||||||||
3.1.11.0.2 | PHTF2 | T27848 | |||||||||||
3.2 | Class: Paired box factors | ||||||||||||
3.2.1 | Family: Paired plus homeo domain | CTAATTAG | |||||||||||
3.2.1.1 | Subfamily: PAX-3/7 | CTAATTAG | |||||||||||
3.2.1.1.1 | Pax-3 (HuP2) | T00680 | |||||||||||
3.2.1.1.2 | Pax-7 (HuP1) | T02960 | |||||||||||
3.2.1.2 | Subfamily: PAX-4/6 | CTAATTAG | |||||||||||
3.2.1.2.1 | Pax-4 | T11179 | |||||||||||
3.2.1.2.1.1 | Pax-4, isoform 1 | T02983 | |||||||||||
3.2.1.2.1.2 | Pax-4, isoform 2 | T26236 | |||||||||||
3.2.1.2.1.3 | Pax-4, isoform 3 | T03195 | |||||||||||
3.2.1.2.2 | Pax-6 (AN2) | T00681 | |||||||||||
3.2.1.2.2.1 | Pax-6, isoform 1 | T09150 | |||||||||||
3.2.1.2.2.2 | Pax-6, isoform 3 (p32) | ||||||||||||
3.2.1.2.2.3 | Pax-6-5a, isoform 5a | T09981 | |||||||||||
3.2.2 | Family: Paired domain only | ||||||||||||
3.2.2.1 | Subfamily: PAX-1/9 (no homeo remnant) | ||||||||||||
3.2.2.1.1 | Pax-1 (HuP48) | T00677 | |||||||||||
3.2.2.1.2 | Pax-9 | T02985 | |||||||||||
3.2.2.2 | Subfamily: PAX-2-like factors (partial homeobox) | GTCATGCGTGA | |||||||||||
3.2.2.2.1 | Pax-2 | T16059 | |||||||||||
3.2.2.2.1.1 | Pax-2, isoform 1 (long) | T00678 | |||||||||||
3.2.2.2.1.2 | Pax-2, isoform 2 (short) | T26232 | |||||||||||
3.2.2.2.2 | Pax-5 | T01201 | |||||||||||
3.2.2.2.3 | Pax-8 | T01828 | |||||||||||
3.3 | Class: Fork head / winged helix factors | ||||||||||||
3.3.1 | Family: Forkhead box (FOX) factors | TGTTT | |||||||||||
3.3.1.1 | Subfamily: FOXA | TGTTTGTTT | |||||||||||
3.3.1.1.1 | FOXA1 (HNF-3α) | T02343 | |||||||||||
3.3.1.1.2 | FOXA2 (HNF-3β) | T02344 | |||||||||||
3.3.1.1.3 | FOXA3 (HNF-3γ) | T02345 | |||||||||||
3.3.1.2 | Subfamily: FOXB | ||||||||||||
3.3.1.2.1 | FOXB1 (Fkh-5) | T02443 | |||||||||||
3.3.1.2.2 | FOXB2 | T02442 | |||||||||||
3.3.1.3 | Subfamily: FOXC | TGTTTATTTAC | |||||||||||
3.3.1.3.1 | FOXC1 (Fkh-L7, FREAC3) | T02426 | |||||||||||
3.3.1.3.2 | FOXC2 (Fkh-L14) | T02445 | |||||||||||
3.3.1.4 | Subfamily: FOXD | TGTTTACTTAAG | |||||||||||
3.3.1.4.1 | FOXD1 (Fkh-L8, FREAC4) | T02293 | |||||||||||
3.3.1.4.2 | FOXD2 (Fkh-L17, FREAC9) | T02492 | |||||||||||
3.3.1.4.3 | FOXD3 (HFH-2) | T04166 | F | ||||||||||
3.3.1.4.4 | FOXD4 (Fkh-L9, FREAC5) | T02431 | F | ||||||||||
3.3.1.5 | Subfamily: FOXE | ||||||||||||
3.3.1.5.1 | FOXE1 (FOXE2, Fkh-L15) | T06409 | |||||||||||
3.3.1.5.2 | FOXE3 (Fkh-L12, FREAC8) | T06410 | |||||||||||
3.3.1.6 | Subfamily: FOXF | TGTTTATATG | |||||||||||
3.3.1.6.1 | FOXF1 (Fkh-L5, FREAC1) | T02461 | |||||||||||
3.3.1.6.2 | FOXF2 (Fkh-L6, FREAC2) | T02514 | |||||||||||
3.3.1.7 | Subfamily: FOXG | TTTGTTTTT | |||||||||||
3.3.1.7.1 | FOXG1 (Fkh-2) | T02353 | |||||||||||
3.3.1.8 | Subfamily: FOXH | TGTGTATT | |||||||||||
3.3.1.8.1 | FOXH1 | T09107 | |||||||||||
3.3.1.8.1.1 | FOXH1, isoform 1 (long) | T04100 | |||||||||||
3.3.1.8.1.2 | FOXH1, isoform 2 (short) | T | |||||||||||
3.3.1.9 | Subfamily: FOXI | TGTTTGTTTA | |||||||||||
3.3.1.9.1 | FOXI1 (Fkh-L10, FREAC6) | T02487 | |||||||||||
3.3.1.9.2 | FOXI2 | T09341 | |||||||||||
3.3.1.9.3 | FOXI3 | T | |||||||||||
3.3.1.10 | Subfamily: FOXJ | TGTTTGTTTA | |||||||||||
3.3.1.10.1 | FOXJ1 (Fkh-L13, HFH-4) | T02460 | |||||||||||
3.3.1.10.2 | FOXJ2 (Fkx) | T04170 | |||||||||||
3.3.1.10.3 | FOXJ3 (Fkx) | T18933 | |||||||||||
3.3.1.10.3.1 | FOXJ3, isoform 1 | T18319 | |||||||||||
3.3.1.10.3.2 | FOXJ3, isoform 2 | T18320 | |||||||||||
3.3.1.11 | Subfamily: FOXK | TTGTTTAC | |||||||||||
3.3.1.11.1 | FOXK1 | T04216 | |||||||||||
3.3.1.11.2 | FOXK2 | T19940 | F | ||||||||||
3.3.1.11.2.1 | FOXK2, isoform 1 (FOXK2a) | T19939 | |||||||||||
3.3.1.11.2.2 | FOXK2, isoform 2 (FOXK2b) | T19941 | |||||||||||
3.3.1.12 | Subfamily: FOXL | TGTTTATGT | |||||||||||
3.3.1.12.1 | FOXL1 (Fkh-L11, FREAC7) | T02417 | |||||||||||
3.3.1.12.2 | FOXL2 | T09367 | |||||||||||
3.3.1.13 | Subfamily: FOXM | CTGTTTAT | |||||||||||
3.3.1.13.1 | FOXM1 (Fkh-L11, FREAC7) | T02515 | |||||||||||
3.3.1.14 | Subfamily: FOXN | ||||||||||||
3.3.1.14.1 | FOXN1 (Whn) | T01835 | F | ||||||||||
3.3.1.14.2 | FOXN2 (HTLF) | T04205 | |||||||||||
3.3.1.14.3 | FOXN3 (CHES1) | T18939 | |||||||||||
3.3.1.14.4 | FOXN4 | T09463 | |||||||||||
3.3.1.15 | Subfamily: FOXO | TTGTTTAC | |||||||||||
3.3.1.15.1 | FOXO1 (FKHR) | T04203 | |||||||||||
3.3.1.15.2 | FOXO3 (FKHR-L1) | T04178 | |||||||||||
3.3.1.15.3 | FOXO4 | T04176 | |||||||||||
3.3.1.15.4 | FOXO6 | T19943 | |||||||||||
3.3.1.16 | Subfamily: FOXP | TTGTTTCA | |||||||||||
3.3.1.16.1 | FOXP1 | T04815 | |||||||||||
3.3.1.16.1.1 | FOXP1, isoform 1 (A) | T02289 | |||||||||||
3.3.1.16.1.2 | FOXP1, isoform 2 (B) | T04812 | |||||||||||
3.3.1.16.1.3 | FOXP1, isoform 3 (C) | T04813 | |||||||||||
3.3.1.16.1.4 | FOXP1, isoform 4 (D) | T05943 | |||||||||||
3.3.1.16.2 | FOXP2 | T04814 | |||||||||||
3.3.1.16.2.1 | FOXP2, isoform 1 | T14710 | |||||||||||
3.3.1.16.2.2 | FOXP2, isoform 2 | T26126 | |||||||||||
3.3.1.16.3 | FOXP3 | T04279 | |||||||||||
3.3.1.16.4 | FOXP4 (FKHLA) | T11049 | |||||||||||
3.3.1.16.4.1 | FOXP4, isoform 1 | T05924 | |||||||||||
3.3.1.16.4.2 | FOXP4, isoform 2 | T18944 | |||||||||||
3.3.1.16.4.3 | FOXP4, isoform 3 | T18945 | |||||||||||
3.3.1.17 | Subfamily: FOXQ | ||||||||||||
3.3.1.17.1 | FOXQ1 (HFH-1) | T05952 | |||||||||||
3.3.1.18 | Subfamily: FOXR | ||||||||||||
3.3.1.18.1 | FOXR1 | T19947 | |||||||||||
3.3.1.18.1.1 | FOXR1, isoform 1 | T19946 | |||||||||||
3.3.1.18.1.2 | FOXR1, isoform 2 | T19948 | |||||||||||
3.3.1.18.2 | FOXR2 | T19952 | |||||||||||
3.3.1.19 | Subfamily: FOXS | ||||||||||||
3.3.1.19.1 | FOXS1 (Fkh-L18, FREAC10) | T02440 | |||||||||||
3.3.2 | Family: E2F-related factors | ||||||||||||
3.3.2.1 | Subfamily: E2F | ||||||||||||
3.3.2.1.1 | E2F-1 | T01543 | |||||||||||
3.3.2.1.2 | E2F-2 | T03526 | |||||||||||
3.3.2.1.3 | E2F-3 | T09191 | |||||||||||
3.3.2.1.4 | E2F-4 | T16329 | |||||||||||
3.3.2.1.5 | E2F-5 | T02948 | F | ||||||||||
3.3.2.1.6 | E2F-6 | T03250 | |||||||||||
3.3.2.1.7 | E2F-7 | T06112 | |||||||||||
3.3.2.1.7.1 | E2F-7, isoform 1 | T15104 | |||||||||||
3.3.2.1.7.2 | E2F-7, isoform 2 | T26851 | |||||||||||
3.3.2.1.8 | E2F-8 | T | |||||||||||
3.3.2.2 | Subfamily: Dp-1 | ||||||||||||
3.3.2.2.1 | Dp-1 (DRTF-1) | T01549 | |||||||||||
3.3.2.2.2 | Dp-2 (Dp-3) | T04103 | |||||||||||
3.3.2.2.2.1 | Dp-2α, isoform 1 | ||||||||||||
3.3.2.2.2.2 | Dp-2β, isoform 2 | ||||||||||||
3.3.2.2.2.3 | Dp-2γ, isoform 3 | ||||||||||||
3.3.2.2.2.4 | Dp-2δ, isoform 4 | ||||||||||||
3.3.3 | Family: RFX-related factors | ||||||||||||
3.3.3.0.1 | RFX1 (EF-C) | T00231 | |||||||||||
3.3.3.0.2 | RFX2 | T01669 | |||||||||||
3.3.3.0.2.1 | RFX2, isoform 1 | T25991 | |||||||||||
3.3.3.0.2.2 | RFX2, isoform 2 | T15278 | |||||||||||
3.3.3.0.3 | RFX3 | T01671 | |||||||||||
3.3.3.0.3.1 | RFX3, isoform 1 | T22177 | |||||||||||
3.3.3.0.3.2 | RFX3, isoform 2 | T26276 | |||||||||||
3.3.3.0.4 | RFX4 | T19210 | |||||||||||
3.3.3.0.4.1 | RFX4, isoform 1 | T19208 | |||||||||||
3.3.3.0.4.2 | RFX4, isoform 2 | T19209 | |||||||||||
3.3.3.0.4.3 | RFX4, isoform 3 | T26277 | |||||||||||
3.3.3.0.4.4 | RFX4, isoform 4 | T19207 | |||||||||||
3.3.3.0.5 | RFX5 | T05440 | |||||||||||
3.3.3.0.6 | RFX6 (RFXDC-1) | T | |||||||||||
3.3.3.0.6.1 | RFX6, isoform 1 | T | |||||||||||
3.3.3.0.6.2 | RFX6, isoform 2 | T | |||||||||||
3.3.3.0.6.3 | RFX6, isoform 3 | T | |||||||||||
3.3.3.0.7 | RFX7 (RFXDC-2) | T16909 | |||||||||||
3.3.3.0.8 | RFX8 | T | |||||||||||
3.4 | Class: Heat shock factors | ||||||||||||
3.4.1 | Family: HSF factors | TTCCAGAAGCTTC | |||||||||||
3.4.1.0.1 | HSF1 (HSTF1) | T00384 | |||||||||||
3.4.1.0.1.1 | HSF1, isoform 1 | T05813 | |||||||||||
3.4.1.0.1.2 | HSF1, isoform 2 | T01525 | |||||||||||
3.4.1.0.2 | HSF2 (HSTF2) | T00972 | |||||||||||
3.4.1.0.2.1 | HSF2, isoform α | T25984 | |||||||||||
3.4.1.0.2.2 | HSF2, isoform β | T08289 | |||||||||||
3.4.1.0.3 | HSF4 (HSTF4) | T05809 | |||||||||||
3.4.1.0.3.1 | HSF4, isoform A | T05810 | |||||||||||
3.4.1.0.3.1 | HSF4, isoform B | T05811 | |||||||||||
3.4.1.0.4 | HSF5 (HSTF5) | T19994 | F | ||||||||||
3.4.1.0.6 | HSFY1 (HSFY2, HSF2L) | T | |||||||||||
3.4.1.0.7 | HSF3 | T | |||||||||||
3.4.1.0.7.1 | HSF3, isoform 1 (a) | ||||||||||||
3.4.1.0.7.2 | HSF3, isoform 2 (b) | ||||||||||||
3.5 | Class: Tryptophan cluster factors | ||||||||||||
3.5.1 | Family: Myb/SANT domain factors | ||||||||||||
3.5.1.1 | Subfamily: Myb-like factors | CAGTTG | |||||||||||
3.5.1.1.1 | c-Myb | T00138 | |||||||||||
3.5.1.1.2 | A-Myb (Myb-L1) | T22728 | |||||||||||
3.5.1.1.2.1 | A-Myb, isoform 1 (long) | T01584 | |||||||||||
3.5.1.1.2.2 | A-Myb, isoform 2 (short) | T25953 | |||||||||||
3.5.1.1.3 | B-Myb (Myb-L2) | T01587 | |||||||||||
3.5.1.1.4 | CDC5L | T18831 | |||||||||||
3.5.1.1.5 | SNAPc4 (PTFα) | T19242 | |||||||||||
3.5.1.1.5.1 | SNAPc4, isoform 1 | T25992 | |||||||||||
3.5.1.1.5.2 | SNAPc4, isoform 2 | T25993 | |||||||||||
3.5.1.1.5.3 | SNAPc4, isoform 3 | T25994 | |||||||||||
3.5.1.2 | Subfamily: NCoR-like factors | ||||||||||||
3.5.1.2.1 | NCoR1 | T04688 | |||||||||||
3.5.1.2.1.1 | NCoR1, isoform 1 | T08641 | |||||||||||
3.5.1.2.1.2 | NCoR1, isoform 2 | T19110 | |||||||||||
3.5.1.2.2 | NCoR2 | T04690 | |||||||||||
3.5.1.2.2.1 | NCoR2, isoform α | T09272 | |||||||||||
3.5.1.2.2.2 | NCoR2, isoform β | T19114 | |||||||||||
3.5.1.2.3 | RCoR1 | T | F | ||||||||||
3.5.1.2.4 | RCoR2 | T | |||||||||||
3.5.1.2.5 | RCoR3 | T27833 | |||||||||||
3.5.1.2.5.1 | RCoR3, isoform 1 | T27886 | |||||||||||
3.5.1.2.5.2 | RCoR3, isoform 2 | T27386 | |||||||||||
3.5.1.3 | Subfamily: MIER-like factors | ||||||||||||
3.5.1.3.1 | MIER1 | T27845 | |||||||||||
3.5.1.3.1.1 | MIER1, isoform 1 (N4-β) | T27923 | |||||||||||
3.5.1.3.1.2 | MIER1, isoform 2 (N1-β) | T27349 | |||||||||||
3.5.1.3.1.3 | MIER1, isoform 3 (N3-β) | T27348 | |||||||||||
3.5.1.3.1.4 | MIER1, isoform 4 (N2-β) | T27924 | |||||||||||
3.5.1.3.1.5 | MIER1, isoform 5 | T27925 | |||||||||||
3.5.1.3.2 | MIER2 | T20020 | |||||||||||
3.5.1.3.2.1 | MIER2, isoform 1 | T20019 | |||||||||||
3.5.1.3.2.2 | MIER2, isoform 2 | T20021 | |||||||||||
3.5.1.3.2.3 | MIER2, isoform 3 | T20022 | |||||||||||
3.5.1.3.3 | MIER3 | T27846 | |||||||||||
3.5.1.3.3.1 | MIER3, isoform 1 | T27350 | |||||||||||
3.5.1.3.3.2 | MIER3, isoform 2 | T27926 | |||||||||||
3.5.1.3.4 | MTA1 = 2.2.1.2.5 | T27821 | |||||||||||
3.5.1.3.5 | MTA2 (MTA1-L1) = 2.2.1.2.6 | T | |||||||||||
3.5.1.3.6 | MTA3 = 2.2.1.2.7 | T27832 | F | ||||||||||
3.5.1.3.6.1 | MTA3, isoform 1 | T27227 | |||||||||||
3.5.1.3.6.2 | MTA3, isoform 2 | T27228 | |||||||||||
3.5.1.3.7 | RERE (ARG, ARP, ATN1L) = 2.2.1.2.4 | T | |||||||||||
3.5.1.3.8 | DMAP1 | T | |||||||||||
3.5.1.3.8.1 | DMAP1, isoform 1 | T | |||||||||||
3.5.1.3.8.2 | DMAP1, isoform 2 | T | |||||||||||
3.5.1.3.9 | TRERF1 (Rapa, TReP-132) = 2.3.4.20.1 | T16489 | |||||||||||
3.5.1.3.9.1 | TRERF1, isoform 1 | T16488 | |||||||||||
3.5.1.3.9.2 | TRERF1, isoform 2 | T16490 | |||||||||||
3.5.1.3.9.3 | TRERF1, isoform 3 [1] | T16491 | |||||||||||
3.5.1.3.9.4 | TRERF1, isoform 4 | T16492 | |||||||||||
3.5.1.3.10 | ZNF541 = 2.3.4.20.2 | T | |||||||||||
3.5.1.3.10.1 | ZNF541, isoform 1 | T | |||||||||||
3.5.1.3.10.2 | ZNF541, isoform 2 | T | |||||||||||
3.5.1.3.11 | CRAMP1L (HN1L) | T | |||||||||||
3.5.1.3.12 | ELMSAN1 (C14orf43) | T | |||||||||||
3.5.1.4 | Subfamily: DNAJC-like factors | ||||||||||||
3.5.1.4.1 | DNAJC1 | T | |||||||||||
3.5.1.4.2 | DNAJC2 (ZRF1) | T27836 | |||||||||||
3.5.1.5 | Subfamily: SMARCA-like factors | ||||||||||||
3.5.1.5.1 | SMARCA1 (SNF2L) | T20112 | |||||||||||
3.5.1.5.1.1 | SMARCA1, isoform 1 | T20111 | |||||||||||
3.5.1.5.1.2 | SMARCA1, isoform 2 | T20113 | |||||||||||
3.5.1.5.2 | SMARCA5 (SNF2H) | T | |||||||||||
3.5.1.6 | Subfamily: TADA2-like factors | ||||||||||||
3.5.1.6.1 | TAD-2α (TADA2A, ADA2-like) | T19286 | |||||||||||
3.5.1.6.2 | TAD-2β (TADA2B, ADA2-β) | T | |||||||||||
3.5.1.6.3 | SMARCC1 (BAF155) | T | |||||||||||
3.5.1.6.3.1 | SMARCC1, isoform 1 | T | |||||||||||
3.5.1.6.3.2 | SMARCC1, isoform 2 | T | |||||||||||
3.5.1.6.4 | SMARCC2 (BAF170) | T | |||||||||||
3.5.1.6.4.1 | SMARCC2, isoform 1 | T | |||||||||||
3.5.1.6.4.2 | SMARCC2, isoform 2 | T | |||||||||||
3.5.1.7 | Subfamily: DMTF-like factors | CCCGGATGT | |||||||||||
3.5.1.7.1 | DMTF1 | T19913 | |||||||||||
3.5.1.7.1.1 | DMTF1, isoform 1 | T19912 | |||||||||||
3.5.1.7.1.2 | DMTF1, isoform 2 | T19915 | |||||||||||
3.5.1.7.1.3 | DMTF1, isoform 3 | T19916 | |||||||||||
3.5.1.7.1.4 | DMTF1, isoform 4 | T19917 | |||||||||||
3.5.1.7.1.5 | DMTF1, isoform 5 | T19914 | |||||||||||
3.5.2 | Family: Ets-related factors | GGAAG | |||||||||||
3.5.2.1 | Subfamily: Ets-like factors | CCGGAAG | |||||||||||
3.5.2.1.1 | c-Ets-1 | T00111 | |||||||||||
3.5.2.1.2 | c-Ets-2 | T09489 | |||||||||||
3.5.2.1.3 | ETV2 | T15697 | |||||||||||
3.5.2.1.4 | GABPα (E4TF1-60, NRSF-2α) | T01402 | |||||||||||
3.5.2.1.5 | Fli-1 | T01408 | |||||||||||
3.5.2.1.6 | ERG | T17954 | |||||||||||
3.5.2.1.6.1 | ERG, isoform 1 | T17955 | |||||||||||
3.5.2.1.6.2 | ERG, isoform 2 | T17956 | |||||||||||
3.5.2.1.6.3 | ERG, isoform 3 | T17953 | |||||||||||
3.5.2.1.6.4 | ERG, isoform 5 | T17957 | |||||||||||
3.5.2.1.7 | FEV (Pet-1) | T05431 | |||||||||||
3.5.2.1.8 | ETV3 (PE-1) | T18918 | |||||||||||
3.5.2.1.10 | ERF | T16656 | F | ||||||||||
3.5.2.2 | Subfamily: Elk-like factors | CCGGAAG | |||||||||||
3.5.2.2.1 | Elk-1 | T05013 | |||||||||||
3.5.2.2.2 | Elk-3 (SAP-2) | T09982 | |||||||||||
3.5.2.2.3 | Elk-4 (SAP-1) | T06074 | |||||||||||
3.5.2.2.4 | ETV1 | T08214 | |||||||||||
3.5.2.2.5 | ETV4 (E1A-F) | T00684 | |||||||||||
3.5.2.2.5.1 | ETV4, isoform 1 | T09992 | |||||||||||
3.5.2.2.5.2 | ETV4, isoform 2 | T30270 | |||||||||||
3.5.2.2.6 | ETV5 | T08200 | |||||||||||
3.5.2.3 | Subfamily: Elf-1-like factors | CCGGAAAT | |||||||||||
3.5.2.3.1 | Elf-1 | T05012 | |||||||||||
3.5.2.3.2 | Elf-2 (NERF) | T16604 | |||||||||||
3.5.2.3.2.1 | Elf-2, isoform 1 (Elf-2a) | T18898 | |||||||||||
3.5.2.3.2.2 | Elf-2, isoform 2 (Elf-2b) | T18899 | |||||||||||
3.5.2.3.2.3 | Elf-2, isoform 3 | T18900 | |||||||||||
3.5.2.3.2.4 | Elf-2, isoform 4 | T18897 | |||||||||||
3.5.2.3.3 | Elf-4 (ELFR, MEF) | T21528 | |||||||||||
3.5.2.4 | Subfamily: EHF-like factors | CCGGAAGT | |||||||||||
3.5.2.4.1 | EHF (ESE-3) | T17678 | |||||||||||
3.5.2.4.1.1 | EHF, isoform 1 | T17903 | |||||||||||
3.5.2.4.1.2 | EHF, isoform 2 | T26095 | |||||||||||
3.5.2.4.1.3 | EHF, isoform 3 | T26096 | |||||||||||
3.5.2.4.2 | Elf-3 (ESE-1) | T08074 | |||||||||||
3.5.2.4.2.1 | Elf-3, isoform 1 | T25982 | |||||||||||
3.5.2.4.2.2 | Elf-3, isoform 2 | T15555 | |||||||||||
3.5.2.4.3 | Elf-5 (ESE-2) | T15298 | |||||||||||
3.5.2.5 | Subfamily: Spi-like factors | AGAGGAAG | |||||||||||
3.5.2.5.1 | PU.1 (Spi-1) | T00702 | |||||||||||
3.5.2.5.2 | Spi-B | T14146 | |||||||||||
3.5.2.5.2.1 | Spi-B, isoform IA | T19268 | |||||||||||
3.5.2.5.2.2 | Spi-B, isoform IC | T26304 | |||||||||||
3.5.2.5.2.3 | Spi-B, isoform IIA | T19269 | |||||||||||
3.5.2.5.3 | Spi-C | T20136 | |||||||||||
3.5.2.5.3.1 | Spi-C, isoform 1 | T20135 | |||||||||||
3.5.2.5.3.2 | Spi-C, isoform 2 | T20137 | |||||||||||
3.5.2.6 | Subfamily: ETV6-like factors | CCCGGAAGT | |||||||||||
3.5.2.6.1 | ETV6 (Tel-1) | T08872 | |||||||||||
3.5.2.7 | Subfamily: SPDEF-like factors | CCGGATGT | |||||||||||
3.5.2.7.1 | SPDEF (PSE) | T05406 | |||||||||||
3.5.3 | Family: Interferon-regulatory factors | AAGTGAA | |||||||||||
3.5.3.0.1 | IRF-1 | T00422 | |||||||||||
3.5.3.0.2 | IRF-2 | T00425 | |||||||||||
3.5.3.0.3 | IRF-3 | T05128 | |||||||||||
3.5.3.0.4 | IRF-4 (LSIRF, NF-EM5, MUM1, Pip) | T01412 | |||||||||||
3.5.3.0.4.1 | IRF-4, isoform 1 | T09278 | |||||||||||
3.5.3.0.4.2 | IRF-4, isoform 2 | T21769 | |||||||||||
3.5.3.0.5 | IRF-5 | T05103 | |||||||||||
3.5.3.0.6 | IRF-6 | T05119 | |||||||||||
3.5.3.0.7 | IRF-7 | T05144 | |||||||||||
3.5.3.0.8 | IRF-8 (ICSBP1) | T00402 | |||||||||||
3.5.3.0.9 | IRF-9 (ISGF-3γ) | T05096 | |||||||||||
3.6 | Class: TEA domain factors | ||||||||||||
3.6.1 | Family: TEF-1-related factors | CATTCC | |||||||||||
3.6.1.0.1 | TEF-1 (TEAD-1, TCF-13) | T01124 | |||||||||||
3.6.1.0.2 | TEF-3 (TEAD-4, TCF-13L1, Tefr1) | T19305 | |||||||||||
3.6.1.0.2.1 | TEF-3, isoform 1 (TEFR1A, ETFR-2A) | T19303 | |||||||||||
3.6.1.0.2.2 | TEF-3, isoform 2 (TEFR1B, ETFR-2B) | T19304 | |||||||||||
3.6.1.0.3 | TEF-4 (TEAD-2) | T09525 | |||||||||||
3.6.1.0.4 | TEF-5 (TEAD-3, TEAD5) | T19302 | |||||||||||
3.7 | Class: ARID domain factors | |
|||||||||||
3.7.1 | Family: ARID-related factors | ||||||||||||
3.7.1.1 | Subfamily: ARID1 | ||||||||||||
3.7.1.1.1 | ARID1A (BAF250, BAF250A, OSA1, SMARCF1) | T27839 | |||||||||||
3.7.1.1.1.1 | ARID1A, isoform 1 | T27259 | |||||||||||
3.7.1.1.1.2 | ARID1A, isoform 2 | T27260 | |||||||||||
3.7.1.1.1.3 | ARID1A, isoform 3 | T27261 | |||||||||||
3.7.1.1.1.4 | ARID1A, isoform 4 | T27891 | |||||||||||
3.7.1.1.2 | ARID1B (BAF250, BAF250A, OSA1, SMARCF1) | T | F | ||||||||||
3.7.1.2 | Subfamily: ARID2 | ||||||||||||
3.7.1.2.1 | ARID2 (BAF200) | T | |||||||||||
3.7.1.3 | Subfamily: ARID3 | ||||||||||||
3.7.1.3.1 | ARID3A (Bright, DRIL1, DRIL3, DRX, E2FBP1) | T06432 | |||||||||||
3.7.1.3.2 | ARID3B (BDP, DRIL2) | T06433 | |||||||||||
3.7.1.3.2.1 | ARID3B, isoform 1 | T14720 | |||||||||||
3.7.1.3.2.2 | ARID3B, isoform 2 | T26024 | |||||||||||
3.7.1.3.2.3 | ARID3B, isoform 3 | T26025 | |||||||||||
3.7.1.3.3 | ARID3C | T19835 | |||||||||||
3.7.1.4 | Subfamily: ARID4 | ||||||||||||
3.7.1.4.1 | ARID4A (RBBP1, RBP1) | T | |||||||||||
3.7.1.4.2 | ARID4B (BRCAA1, RBBP1L1, RBP1L1, SAP180) | T18778 | |||||||||||
3.7.1.4.2.1 | ARID4B, isoform 1 | T06439 | |||||||||||
3.7.1.4.2.2 | ARID4B, isoform 2 | T18780 | |||||||||||
3.7.1.5 | Subfamily: ARID5 | ||||||||||||
3.7.1.5.1 | ARID5A (MRF1) | T16757 | |||||||||||
3.7.1.5.1.1 | ARID5A, isoform 1 | T16756 | |||||||||||
3.7.1.5.1.2 | ARID5A, isoform 2 | T16758 | |||||||||||
3.7.1.5.1.3 | ARID5A, isoform 3 | T16761 | |||||||||||
3.7.1.5.1.4 | ARID5A, isoform 4 | T16764 | |||||||||||
3.7.1.5.1.5 | ARID5A, isoform 5 | T16765 | |||||||||||
3.7.1.5.2 | ARID5B (DESRT, MRF2) | T11231 | |||||||||||
3.7.1.5.2.1 | ARID5B, isoform 1 | T06464 | |||||||||||
3.7.1.5.2.2 | ARID5B, isoform 2 | T06463 | |||||||||||
3.7.1.5.2.3 | ARID5B, isoform 3 | T26027 | |||||||||||
3.7.1.6 | Subfamily: JARID1 | ||||||||||||
3.7.1.6.1 | JARID1A (KDM5A, RBBP2, RBP2) | T | F | ||||||||||
3.7.1.6.2 | JARID1B (KDM5B, PLU1, RBBP2H1) | T27844 | |||||||||||
3.7.1.6.2.1 | JARID1B, isoform 1 | T27347 | |||||||||||
3.7.1.6.2.2 | JARID1B, isoform 2 | T27922 | |||||||||||
3.7.1.6.3 | JARID1C (KDM5C, DXS1272E, SMCX, XE169) | T | |||||||||||
3.7.1.6.3.1 | JARID1C, isoform 1 | T | |||||||||||
3.7.1.6.3.2 | JARID1C, isoform 2 | T | |||||||||||
3.7.1.6.3.3 | JARID1C, isoform 3 | T | |||||||||||
3.7.1.6.4 | JARID1D (KDM5D, HY, HYA, SMCY) | T | |||||||||||
3.7.1.6.4.1 | JARID1D, isoform 1 | T | |||||||||||
3.7.1.6.4.2 | JARID1D, isoform 2 | T | |||||||||||
3.7.1.6.4.3 | JARID1D, isoform 3 | T | |||||||||||
3.7.1.6.4.4 | JARID1D, isoform 4 | T | |||||||||||
3.7.1.7 | Subfamily: JARID2 | ||||||||||||
3.7.1.7.1 | JARID2 (Jumonji, JMJ) | T | |||||||||||
3.7.1.7.1.1 | JARID2, isoform 1 | T | |||||||||||
3.7.1.7.1.2 | JARID2, isoform 2 | T | |||||||||||
4 | Superclass: Other all-α-helical DNA-binding domains | ||||||||||||
4.1 | Class: High-mobility group (HMG) domain factors | ||||||||||||
4.1.1 | Family: SOX-related factors | ACAA | |||||||||||
4.1.1.1 | Subfamily: Group A | AAACAAA | |||||||||||
4.1.1.1.1 | SRY (TDF) | T00996 | |||||||||||
4.1.1.2 | Subfamily: Group B | AACAAAG | |||||||||||
4.1.1.2.1 | SOX-1 | T06025 | |||||||||||
4.1.1.2.2 | SOX-2 | T01836 | |||||||||||
4.1.1.2.3 | SOX-3 | T06026 | F | ||||||||||
4.1.1.2.4 | SOX-14 (SOX-28) | T16939 | |||||||||||
4.1.1.2.5 | SOX-21 | T16926 | |||||||||||
4.1.1.3 | Subfamily: Group C | AACAAAGG | |||||||||||
4.1.1.3.1 | SOX-4 (IRE-ABP) | T17807 | |||||||||||
4.1.1.3.2 | SOX-11 | T17001 | |||||||||||
4.1.1.3.3 | SOX-12 (SOX-22) | T16937 | |||||||||||
4.1.1.4 | Subfamily: Group D | AACAAT | |||||||||||
4.1.1.4.1 | SOX-5 | T01429 | |||||||||||
4.1.1.4.1.1 | SOX-5A, isoform 1 | ||||||||||||
4.1.1.4.1.2 | SOX-5B, isoform 2 (L-Sox5) | T18021 | |||||||||||
4.1.1.4.1.3 | SOX-5, isoform 3 | T26301 | |||||||||||
4.1.1.4.2 | SOX-6 | T09432 | |||||||||||
4.1.1.4.2.1 | SOX-6, isoform 1 | T02897 | |||||||||||
4.1.1.4.2.2 | SOX-6, isoform 2 | T01844 | |||||||||||
4.1.1.4.3 | SOX-13 | T02420 | |||||||||||
4.1.1.5 | Subfamily: Group E | AAACAAAGG | |||||||||||
4.1.1.5.1 | SOX-8 | T19255 | |||||||||||
4.1.1.5.2 | SOX-9 | T01854 | |||||||||||
4.1.1.5.3 | SOX-10 | T08336 | |||||||||||
4.1.1.6 | Subfamily: Group F | AACAAT | |||||||||||
4.1.1.6.1 | SOX-7 | T06032 | |||||||||||
4.1.1.6.2 | SOX-17 | T06029 | |||||||||||
4.1.1.6.2.1 | SOX-17, isoform 1 | T17872 | |||||||||||
4.1.1.6.2.2 | SOX-17, isoform 2 (T-SOX17) | T19249 | |||||||||||
4.1.1.6.3 | SOX-18 | T01843 | |||||||||||
4.1.1.7 | Subfamily: Group G | ||||||||||||
4.1.1.7.1 | SOX-15 | T02896 | |||||||||||
4.1.1.8 | Subfamily: Group H | GGACAATGG | |||||||||||
4.1.1.8.1 | SOX-30 | T19254 | |||||||||||
4.1.1.9 | Subfamily: Further Sox-related factors | TTCATTCAA | |||||||||||
4.1.1.9.1 | CIC [1] | T19878 | |||||||||||
4.1.1.9.1.1 | CIC, isoform 1 (L) | T26532 | |||||||||||
4.1.1.9.1.2 | CIC, isoform 2 (S) | T19880 | |||||||||||
4.1.1.9.2 | HBP-1 [1] | T16354 | |||||||||||
4.1.1.9.2.1 | HBP-1, isoform 1 | T17384 | |||||||||||
4.1.1.9.2.2 | HBP-1, isoform 2 | T17385 | |||||||||||
4.1.1.9.3 | BBX (HBP-2) [1] | T16783 | |||||||||||
4.1.1.9.3.1 | BBX, isoform 1 | T16781 | |||||||||||
4.1.1.9.3.2 | BBX, isoform 2 | T16786 | |||||||||||
4.1.1.9.3.3 | BBX, isoform 3 | T16787 | |||||||||||
4.1.1.9.3.4 | BBX, isoform 4 | T16789 | |||||||||||
4.1.2 | Family: TOX-related factors | ||||||||||||
4.1.2.0.1 | TOX [1] | T | |||||||||||
4.1.2.0.1.1 | TOX, isoform 1 | T | |||||||||||
4.1.2.0.1.2 | TOX, isoform 2 | T | |||||||||||
4.1.2.0.2 | TOX-2 (GCX-1) [1] | T | |||||||||||
4.1.2.0.3 | TOX-3 (CAGF9) [1] | T | |||||||||||
4.1.2.0.4 | TOX-4 (LCP-1) [1] | T | |||||||||||
4.1.2.0.5 | SMARCE1 [1] | T27820 | |||||||||||
4.1.2.0.6 | HMG20A (HMGX1) [1] | T18998 | |||||||||||
4.1.2.0.6.1 | HMG20A, isoform 1 | T18994 | |||||||||||
4.1.2.0.6.2 | HMG20A, isoform 2 | T18995 | |||||||||||
4.1.2.0.6.3 | HMG20A, isoform 3 | T18996 | |||||||||||
4.1.2.0.6.4 | HMG20A, isoform 4 | T18997 | |||||||||||
4.1.2.0.7 | HMG20B (HMGX2) [1] | T19003 | |||||||||||
4.1.2.0.8 | HMGXB3 (SMF) [1] | T | |||||||||||
4.1.3 | Family: TCF-7-related factors | TTCAAAG | |||||||||||
4.1.3.0.1 | TCF-7 (TCF-1) [1] | T11358 | |||||||||||
4.1.3.0.1.1 | TCF-7, isoform 1 | T01109 | |||||||||||
4.1.3.0.1.2 | TCF-7, isoform 2 | T02945 | |||||||||||
4.1.3.0.2 | TCF-7L1 (TCF-3) [1] | T01111 | |||||||||||
4.1.3.0.3 | TCF-7L2 (TCF-4) [1] | T08958 | F | ||||||||||
4.1.3.0.3.1 | TCF-7L2, isoform 1 | T02915 | |||||||||||
4.1.3.0.3.2 | TCF-7L2, isoform 2 | T02913 | |||||||||||
4.1.3.0.3.3 | TCF-7L2, isoform 3 | T19328 | |||||||||||
4.1.3.0.3.4 | TCF-7L2, isoform 4 | T19325 | |||||||||||
4.1.3.0.3.5 | TCF-7L2, isoform 5 | T19329 | |||||||||||
4.1.3.0.3.6 | TCF-7L2, isoform 6 | T19326 | |||||||||||
4.1.3.0.3.7 | TCF-7L2, isoform 7 | T19330 | |||||||||||
4.1.3.0.3.8 | TCF-7L2, isoform 8 | T19327 | |||||||||||
4.1.3.0.3.9 | TCF-7L2, isoform 9 | T26493 | |||||||||||
4.1.3.0.4 | LEF-1 (TCF-1α) [1] | T09576 | |||||||||||
4.1.3.0.4.1 | LEF-1, isoform 1 | T00930 | |||||||||||
4.1.3.0.4.2 | LEF-1, isoform 2 (LEF-1S) | T01389 | |||||||||||
4.1.3.0.5 | TAF-1 (TAF-2A, TAF(II)250) [1] | T | |||||||||||
4.1.3.0.5.1 | TAF-1, isoform 1 | T | |||||||||||
4.1.3.0.5.2 | TAF-1, isoform 2 | T | |||||||||||
4.1.3.0.5.3 | TAF-1, isoform 3 | T | |||||||||||
4.1.4 | Family: PBRM1-related factors | ||||||||||||
4.1.4.0.1 | PB-1 (PBRM1, BAF180) [1] | T21459 | |||||||||||
4.1.4.0.1.1 | PB-1, isoform 1 | T21458 | |||||||||||
4.1.4.0.1.2 | PB-1, isoform 2 | T21460 | |||||||||||
4.1.4.0.2 | HMGXB4 (HMG2L1) [1] | T | |||||||||||
4.1.5 | Family: WHSC1-related factors | GGCATTGGAAA | |||||||||||
4.1.5.0.1 | WHSC1 (TRX-5) [1] | T19161 | |||||||||||
4.1.5.0.1.1 | WHSC1, isoform 1 | T19160 | |||||||||||
4.1.5.0.1.2 | WHSC1, isoform 2 | T19159 | |||||||||||
4.1.5.0.1.3 | WHSC1, isoform 3 | T19162 | |||||||||||
4.1.5.0.1.4 | WHSC1, isoform 4 (RE-IIBP) | T26863 | |||||||||||
4.1.5.0.2 | SSRP1 [1] | T25655 | |||||||||||
4.1.5.0.2.1 | SSRP1, isoform 1 | T01856 | |||||||||||
4.1.5.0.2.2 | SSRP1, isoform 2 | T26310 | |||||||||||
4.1.6 | Family: UBF-related factors | ||||||||||||
4.1.6.1 | Subfamily: UBF-related factors | ||||||||||||
4.1.6.1.1 | UBF [6] | T00860 | ; | ||||||||||
4.1.6.1.1.1 | UBF1 | T11305 | |||||||||||
4.1.6.1.1.2 | UBF2 | T11304 | |||||||||||
4.1.6.2 | Subfamily: UBF-like proteins | ||||||||||||
4.1.6.2.1 | UBTFL1 [2] | T | |||||||||||
4.1.7 | Family: TFAM | ||||||||||||
4.1.7.0.1 | TFAM (mtTFA, MtTF1, TCF6, TCF6L2) [2] | T14300 | |||||||||||
4.1.7.0.1.1 | TFAM, isoform 1 (mitochondrial) | T14299 | |||||||||||
4.1.7.0.1.2 | TFAM, isoform 2 (nuclear) | T14301 | |||||||||||
4.2 | Class: Heteromeric CCAAT-binding factors | ||||||||||||
4.2.1 | Family: Heteromeric CCAAT-binding factors | CCAAT | |||||||||||
4.2.1.0.1 | NF-YA (CP1A, CBF-B) | T09472 | |||||||||||
4.2.1.0.1.1 | NF-YA, isoform 1 (long) | T00615 | |||||||||||
4.2.1.0.1.2 | NF-YA, isoform 2 (short) | T09471 | |||||||||||
4.2.1.0.2 | NF-YB (CP1B, CBF-A) | T00616 | |||||||||||
4.2.1.0.3 | NF-YC | T02477 | |||||||||||
5 | Superclass: α-Helices exposed by β-structures | ||||||||||||
5.1 | Class: MADS box factors | ||||||||||||
5.1.1 | Family: Regulators of differentiation | CTAAAAATAG | |||||||||||
5.1.1.1 | Subfamily: MEF-2 | CTAAAAATAG | |||||||||||
5.1.1.1.1 | MEF-2A | T15781 | |||||||||||
5.1.1.1.1.1 | MEF-2A, isoform 1 (MEF2) | T00505 | |||||||||||
5.1.1.1.1.2 | MEF-2A, isoform 2 (aMEF2) | T06051 | |||||||||||
5.1.1.1.1.3 | MEF-2A, isoform 3 (RSRFC4) | T11401 | |||||||||||
5.1.1.1.2 | MEF-2B (RSRFR2, xMEF2) | T11282 | |||||||||||
5.1.1.1.2.1 | MEF-2B, isoform 1 | T01785 | |||||||||||
5.1.1.1.2.2 | MEF-2B, isoform 2 | T02501 | |||||||||||
5.1.1.1.2.3 | MEF-2B, isoform 3 | T02502 | |||||||||||
5.1.1.1.2.4 | MEF-2B, isoform 4 | T02503 | |||||||||||
5.1.1.1.3 | MEF-2C | T09547 | |||||||||||
5.1.1.1.3.1 | MEF-2C, isoform 1 | T09397 | |||||||||||
5.1.1.1.3.2 | MEF-2C, isoform 2 | T01769 | |||||||||||
5.1.1.1.3.3 | MEF-2C, isoform 3 | T09399 | |||||||||||
5.1.1.1.3.4 | MEF-2C, isoform 4 | T09400 | |||||||||||
5.1.1.1.3.5 | MEF-2C, isoform 5 | T06566 | |||||||||||
5.1.1.1.4 | MEF-2D | T17720 | |||||||||||
5.1.1.1.4.1 | MEF-2D, isoform 1 (non-muscle) | T02506 | |||||||||||
5.1.1.1.4.2 | MEF-2D, isoform 2 (muscle) | T02505 | |||||||||||
5.1.2 | Family: Responders to external signals (SRF/RLM1) | CCATATATGG | |||||||||||
5.1.2.0.1 | SRF | T05114 | |||||||||||
5.2 | Class: E2-related factors | ||||||||||||
5.2.1 | Family: E2 | ||||||||||||
5.3 | Class: SAND domain factors | ||||||||||||
5.3.1 | Family: AIRE | ATTGGTTATATTGGTTA | |||||||||||
5.3.1.0.1 | AIRE | T05991 | |||||||||||
5.3.1.0.1.1 | AIRE-1, isoform 1a | T11050 | |||||||||||
5.3.1.0.1.2 | AIRE-2, isoform 1b | T18752 | |||||||||||
5.3.1.0.1.3 | AIRE-3, isoform 1c | T18753 | |||||||||||
5.3.1.0.1.4 | AIRE-3, isoform 1d | T18757 | |||||||||||
5.3.1.0.1.5 | AIRE-1, isoform 2a | T18758 | |||||||||||
5.3.1.0.1.6 | AIRE-2, isoform 2b | T18759 | |||||||||||
5.3.1.0.1.7 | AIRE-3, isoform 2c | T18760 | |||||||||||
5.3.1.0.1.8 | AIRE-3, isoform 2d | T18761 | |||||||||||
5.3.1.0.1.9 | AIRE-1, isoform 3a | T18754 | |||||||||||
5.3.1.0.1.10 | AIRE-2, isoform 3b | T18755 | |||||||||||
5.3.1.0.1.11 | AIRE-3, isoform 3c | T18762 | |||||||||||
5.3.1.0.1.12 | AIRE-3, isoform 3d | T18756 | |||||||||||
5.3.2 | Family: DEAF | TTTCCG | |||||||||||
5.3.2.0.1 | DEAF1 | T14829 | |||||||||||
5.3.2.0.1.1 | DEAF1, isoform 1 (DF1) | T14830 | |||||||||||
5.3.2.0.1.2 | DEAF1, isoform 2 (DF1-VAR1) | T26083 | |||||||||||
5.3.3 | Family: GMEB | CTTCTGTATGAGCGCCAGTAT | |||||||||||
5.3.3.1 | Subfamily: GMEB | ||||||||||||
5.3.3.1.1 | GMEB-1 | T05070 | |||||||||||
5.3.3.1.2 | GMEB-2 | T18959 | |||||||||||
5.3.4 | Family: Sp110 | ||||||||||||
5.3.4.0.1 | Sp110 | T20126 | |||||||||||
5.3.5 | Family: Sp140/Sp100 | ||||||||||||
5.3.5.1 | Subfamily: Sp140-like factors | ||||||||||||
5.3.5.1.1 | Sp140 | T | |||||||||||
5.3.5.2 | Subfamily: Sp100 | ||||||||||||
5.3.5.2.1 | Sp100 | T16749 | |||||||||||
5.3.5.2.1.1 | Sp100, isoform 1 | T16748 | |||||||||||
5.3.5.2.1.2 | Sp100, isoform 2 | T16750 | |||||||||||
6 | Superclass: Immunoglobulin fold | ||||||||||||
6.1 | Class: Rel homology region (RHR) factors | ||||||||||||
6.1.1 | Family: NF-kappaB-related factors | ||||||||||||
6.1.1.1 | Subfamily: NF-kappaB p50 subunit-like factors | GGGAATTTCC | |||||||||||
6.1.1.1.1 | NF-κB p105 (NFKB1) | T09437 | |||||||||||
6.1.1.1.1.1 | NF-κB, isoform 1 (p105) | T01924 | |||||||||||
6.1.1.1.1.2 | NF-κB, isoform 1 (p50) | T17574 | |||||||||||
6.1.1.1.1.3 | NF-κB, isoform 2 (p84) | T11413 | |||||||||||
6.1.1.1.1.4 | NF-κB, isoform 3 (p98) | T11415 | |||||||||||
6.1.1.1.1.5 | NF-κB, isoform 4 | T11418 | |||||||||||
6.1.1.1.1.6 | NF-κB, isoform 5 (p70, IκB-γ) | T01940 | |||||||||||
6.1.1.1.1.7 | NF-κB, isoform 6 (p63, IκB-γ-1) | T01941 | |||||||||||
6.1.1.1.1.8 | NF-κB, isoform 7 (p55, IκB-γ-2) | T01942 | |||||||||||
6.1.1.1.2 | NF-κB p100 (NFKB2) | T19129 | |||||||||||
6.1.1.1.2.1 | NF-κB, isoform 1 (p100) | T08984 | |||||||||||
6.1.1.1.2.2 | NF-κB, isoform 1 (p52) | T19130 | |||||||||||
6.1.1.2 | Subfamily: NF-kappaB p65 subunit-like factors | GAAAATTTCC | |||||||||||
6.1.1.2.1 | NF-κB p65 (RelA) | T00595 | |||||||||||
6.1.1.2.1.1 | NF-κB, isoform 1 (p65) | T09106 | |||||||||||
6.1.1.2.1.2 | NF-κB, isoform 3 (p65Δ) | T09631 | |||||||||||
6.1.1.2.2 | RelB (I-Rel) | T01932 | |||||||||||
6.1.1.2.3 | c-Rel | T00169 | |||||||||||
6.1.2 | Family: Ankyrin domain-only factors | ||||||||||||
6.1.2.1 | Subfamily: IκB-related factors | ||||||||||||
6.1.2.1.1 | IκBα | T | |||||||||||
6.1.2.1.2 | IκBβ | T00971 | |||||||||||
6.1.2.1.3 | IκBδ | T | |||||||||||
6.1.2.1.4 | IκBε | T22412 | |||||||||||
6.1.2.1.5 | IκBζ (MAIL) | T | |||||||||||
6.1.2.1.5.1 | IκBζ, isoform 1 (MAIL-L) | T | |||||||||||
6.1.2.1.5.2 | IκBζ, isoform 2 (MAIL-S) | T | |||||||||||
6.1.2.1.5.3 | IκBζ, isoform 3 (D) | T | |||||||||||
6.1.2.1.6 | IκBR (Tonsl) | T | |||||||||||
6.1.2.1.7 | IκBL | T | |||||||||||
6.1.2.1.8 | BCL-3 | T | |||||||||||
6.1.2.2 | Subfamily: RelA-associated inhibitor | ||||||||||||
6.1.2.2.1 | RAI (iASPP) | T27841 | |||||||||||
6.1.3 | Family: NFAT-related factors | ATGGAAA | |||||||||||
6.1.3.0.1 | NFATc1 | T01947 | |||||||||||
6.1.3.0.1.1 | NFATc1, isoform α | T08999 | |||||||||||
6.1.3.0.1.2 | NFATc1, isoform α' | ||||||||||||
6.1.3.0.1.3 | NFATc1, isoform β | T17544 | |||||||||||
6.1.3.0.2 | NFATc2 (NFATp, NFAT1) | T15616 | |||||||||||
6.1.3.0.2.1 | NFATc2, isoform A | T01944 | |||||||||||
6.1.3.0.2.2 | NFATc2, isoform B | T19124 | |||||||||||
6.1.3.0.2.3 | NFATc2, isoform C | T19123 | |||||||||||
6.1.3.0.2.4 | NFATc2, isoform D | T15617 | |||||||||||
6.1.3.0.3 | NFATc3 (NFATx, NFAT4) | T01949 | |||||||||||
6.1.3.0.3.1 | NFATc3, isoform 1 (X1) | ||||||||||||
6.1.3.0.3.2 | NFATc3, isoform 2 (X2) | ||||||||||||
6.1.3.0.3.3 | NFATc3, isoform 3 (ΔX) | ||||||||||||
6.1.3.0.4 | NFATc4 (NFAT3) | T05523 | |||||||||||
6.1.3.0.4.1 | NFATc4, isoform 1 (I-IXL) | T10410 | |||||||||||
6.1.3.0.4.2 | NFATc4, isoform 2 (I-IXi) | T26208 | |||||||||||
6.1.3.0.5 | NFAT5 (TonEBP) | T10408 | |||||||||||
6.1.3.0.5.1 | NFAT5, isoform 1 (C) | T10407 | |||||||||||
6.1.3.0.5.2 | NFAT5, isoform 2 (D) | T30305 | |||||||||||
6.1.3.0.5.3 | NFAT5, isoform 3 (A) | T30306 | |||||||||||
6.1.3.0.5.4 | NFAT5, isoform 4 | T30307 | |||||||||||
6.1.4 | Family: CSL-related factors | CGTGGGAA | |||||||||||
6.1.4.1 | Subfamily: M | CGTGGGAA | |||||||||||
6.1.4.1.1 | RBP-Jκ | T00440 | F | ||||||||||
6.1.4.1.1.1 | RBP-Jκ, isoform 1 | T09441 | |||||||||||
6.1.4.1.1.2 | RBP-Jκ, isoform 2 | T26313 | |||||||||||
6.1.4.1.2 | RBP-JL | T17276 | |||||||||||
6.1.5 | Family: Early B-Cell Factor-related factors | TCCCTAGGGA | |||||||||||
6.1.5.0.1 | EBF1 (COE1) | T09926 | |||||||||||
6.1.5.0.1.1 | EBF1, isoform 1 (long, 8) | T01112 | |||||||||||
6.1.5.0.1.2 | EBF1, isoform 2 (short, O) | T18848 | |||||||||||
6.1.5.0.2 | EBF2 (COE2) | T05006 | |||||||||||
6.1.5.0.3 | EBF3 (COE3) | T05008 | |||||||||||
6.1.5.0.3.1 | EBF3, isoform long (9L) | T14704 | |||||||||||
6.1.5.0.3.2 | EBF3, isoform short (0S) | T15857 | |||||||||||
6.1.5.0.4 | EBF4 (COE4) | T19885 | F | ||||||||||
6.1.5.0.4.1 | EBF4, isoform 1 (4-11) | T19886 | |||||||||||
6.1.5.0.4.2 | EBF4, isoform 2 (4-14) | T19887 | |||||||||||
6.1.5.0.4.3 | EBF4, isoform 3 (4-23) | T19884 | |||||||||||
6.1.5.0.4.4 | EBF4, isoform 4 (4-132) | T19888 | |||||||||||
6.1.5.0.4.5 | EBF4, isoform 5 (4S) | T19889 | |||||||||||
6.2 | Class: STAT domain factors | ||||||||||||
6.2.1 | Family: STAT factors | TTCCCGGAA | |||||||||||
6.2.1.0.1 | STAT1 | T08951 | |||||||||||
6.2.1.0.2 | STAT2 | T11001 | |||||||||||
6.2.1.0.3 | STAT3 | T01574 | |||||||||||
6.2.1.0.3.1 | STAT3, isoform A | T08657 | |||||||||||
6.2.1.0.3.2 | STAT3, isoform B | T08658 | |||||||||||
6.2.1.0.3.3 | STAT3, isoform Del-701 | T19278 | |||||||||||
6.2.1.0.4 | STAT4 | T01576 | |||||||||||
6.2.1.0.5 | STAT5A | T01579 | |||||||||||
6.2.1.0.6 | STAT5B | T00944 | |||||||||||
6.2.1.0.7 | STAT6 | T01581 | |||||||||||
6.3 | Class: p53 domain factors | ||||||||||||
6.3.1 | Family: p53-related factors | GGACATGCCCGGGCATGTCC | |||||||||||
6.3.1.0.1 | p53 | T01806 | |||||||||||
6.3.1.0.2 | p63 | T06293 | |||||||||||
6.3.1.0.2.1 | p63, isoform 1 (p63α) | T06168 | |||||||||||
6.3.1.0.2.2 | p63, isoform 2 (ΔN-p63α) | T06011 | |||||||||||
6.3.1.0.2.3 | p63, isoform 3 (p63β) | T06290 | |||||||||||
6.3.1.0.2.4 | p63, isoform 4 (ΔN-p63β) | T06010 | |||||||||||
6.3.1.0.2.5 | p63, isoform 5 (p63γ) | T06291 | |||||||||||
6.3.1.0.2.6 | p63, isoform 6 (ΔN-p63γ) | T06292 | |||||||||||
6.3.1.0.3 | p73 | T06287 | |||||||||||
6.3.1.0.3.1 | p73, isoform 1 (α) | T06008 | |||||||||||
6.3.1.0.3.2 | p73, isoform 2 (dN-α) | T06288 | |||||||||||
6.3.1.0.3.3 | p73, isoform 3 | T26229 | |||||||||||
6.3.1.0.3.4 | p73, isoform 4 | T26230 | |||||||||||
6.4 | Class: Runt domain factors | ||||||||||||
6.4.1 | Family: Runt-related factors | TGTGGT | |||||||||||
6.4.1.0.1 | Runx2 (PEBP2αA, CBF-α1) | T08443 | F | ||||||||||
6.4.1.0.1.1 | Runx2, isoform 1 | T09535 | |||||||||||
6.4.1.0.1.2 | Runx2, isoform 2 | T02266 | |||||||||||
6.4.1.0.1.3 | Runx2, isoform 3 (PEBP2αA1) | T01062 | |||||||||||
6.4.1.0.1.4 | Runx2, isoform 4 (PEBP2αA2) | T01063 | |||||||||||
6.4.1.0.1.5 | Runx2, isoform 5 (G1) | T02318 | |||||||||||
6.4.1.0.1.6 | Runx2, isoform 6 (G2) | T09536 | |||||||||||
6.4.1.0.1.7 | Runx2, isoform 7 (U1) | T02319 | |||||||||||
6.4.1.0.1.8 | Runx2, isoform 8 (Y1) | T02320 | |||||||||||
6.4.1.0.1.9 | Runx2, isoform 9 (Y2) | T09537 | |||||||||||
6.4.1.0.2 | Runx1 (PEBP2αB, CBF-α2, AML-1) | T06598 | |||||||||||
6.4.1.0.2.1 | Runx1, isoform 1 (AML-1B, PEBP2αB1) | T02235 | |||||||||||
6.4.1.0.2.2 | Runx1, isoform 2 (AML-1A, PEBP2αB2) | T02241 | |||||||||||
6.4.1.0.2.3 | Runx1, isoform 3 | T17394 | |||||||||||
6.4.1.0.2.4 | Runx1, isoform 4 (AML-1C) | T17393 | |||||||||||
6.4.1.0.2.5 | Runx1, isoform 5 | T17386 | |||||||||||
6.4.1.0.3 | Runx3 (PEBP2αC, CBF-α3, AML-2) | T05409 | |||||||||||
6.4.1.0.3.1 | Runx3, isoform 1 (AML-2α) | T19218 | |||||||||||
6.4.1.0.3.2 | Runx3, isoform 2 (AML-2β) | T09273 | |||||||||||
6.5 | Class: T-Box factors | ||||||||||||
6.5.1 | Family: Brachyury-related factors | TCACACCTAGGTGTGAAATT | |||||||||||
6.5.1.0.1 | T (Brachyury) | T01526 | |||||||||||
6.5.1.0.2 | TBX19 | T18412 | |||||||||||
6.5.2 | Family: TBrain-related factors | AGGTGTGAA | |||||||||||
6.5.2.0.1 | TBR-1 | T21429 | |||||||||||
6.5.2.0.2 | TBR-2 (EOMES) | T16915 | F | ||||||||||
6.5.2.0.2.1 | TBR-2, isoform 1 | T16857 | |||||||||||
6.5.2.0.2.2 | TBR-2, isoform 2 | T26098 | |||||||||||
6.5.2.0.3 | TBX21 (T-bet) | T19296 | |||||||||||
6.5.3 | Family: TBX1-related factors | ||||||||||||
6.5.3.0.1 | TBX1 | T04405 | |||||||||||
6.5.3.0.1.1 | TBX1, isoform 1 | T11341 | |||||||||||
6.5.3.0.1.2 | TBX1, isoform 2 | T26329 | |||||||||||
6.5.3.0.2 | TBX10 (TBX7) | T19295 | |||||||||||
6.5.3.0.2.1 | TBX10, isoform 1 | T19294 | |||||||||||
6.5.3.0.2.2 | TBX10, isoform 2 | T19293 | |||||||||||
6.5.3.0.3 | TBX15 (TBX14) | T16162 | |||||||||||
6.5.3.0.4 | TBX18 | T04418 | |||||||||||
6.5.3.0.5 | TBX20 | T04424 | |||||||||||
6.5.3.0.5.1 | TBX20, isoform 1 | T11346 | |||||||||||
6.5.3.0.5.2 | TBX20, isoform 2 | T26330 | |||||||||||
6.5.3.0.6 | TBX22 | T16745 | |||||||||||
6.5.4 | Family: TBX2-related factors | AGGTGTGAG | |||||||||||
6.5.4.0.1 | TBX2 | T04358 | |||||||||||
6.5.4.0.2 | TBX3 | T04359 | |||||||||||
6.5.4.0.2.1 | TBX3, isoform 1 | T11348 | |||||||||||
6.5.4.0.2.2 | TBX3, isoform 2 | T26331 | |||||||||||
6.5.4.0.3 | TBX4 | T04350 | |||||||||||
6.5.4.0.4 | TBX5 | T04347 | |||||||||||
6.5.5 | Family: TBX6-related factors | AATTTCACACCTAGGTGTGAAATT | |||||||||||
6.5.5.0.1 | TBX6 | T04417 | |||||||||||
6.5.5.0.1.1 | TBX6, isoform 1 | T14662 | |||||||||||
6.5.5.0.1.2 | TBX6, isoform 2 | T26490 | |||||||||||
6.5.5.0.2 | MGA (MAD5) = 1.2.6.7.4 | T03940 | |||||||||||
6.5.5.0.2.1 | Mad5, isoform 1 | T14744 | |||||||||||
6.5.5.0.2.2 | Mad5, isoform 2 | T26191 | |||||||||||
6.5.5.0.2.3 | Mad5, isoform 3 | T26192 | |||||||||||
6.5.5.0.2.4 | Mad5, isoform 4 | T26193 | |||||||||||
6.6 | Class: NDT80 domain factors | ||||||||||||
6.6.1 | Family: Myelin gene regulatory factor-related factors | ||||||||||||
6.6.1.0.1 | Myelin gene regulatory factor (Myrf, MRF, C11orf9) | T25539 | |||||||||||
6.6.1.0.1.1 | Myrf, isoform 1 | T25986 | |||||||||||
6.6.1.0.1.2 | Myrf, isoform 2 | T25987 | |||||||||||
6.6.1.0.1.3 | Myrf, isoform 3 | T30300 | |||||||||||
6.6.1.0.1.4 | Myrf, isoform 4 | T30301 | |||||||||||
6.7 | Class: Grainyhead domain factors | ||||||||||||
6.7.1 | Family: Grainyhead-related factors | ||||||||||||
6.7.1.1 | Subfamily: GRH-like proteins | ||||||||||||
6.7.1.1.1 | GRH-L1 (CP2-L2, LBP-32, MGR) | T19962 | F | ||||||||||
6.7.1.1.1.1 | p70 MGR, isoform 1 | T19961 | |||||||||||
6.7.1.1.1.2 | p49 MGR, isoform 2 | T19963 | |||||||||||
6.7.1.1.2 | GRH-L2 (CP2-L3) | T19968 | |||||||||||
6.7.1.1.3 | GRH-L3 (CP2-L4) | T19975 | |||||||||||
6.7.2 | Family: CP2-related factors | GCACAAACCAG | |||||||||||
6.7.2.0.1 | CP2 (LSF, SEF) | T00152 | |||||||||||
6.7.2.0.1.1 | CP2, isoform 1 | T08971 | |||||||||||
6.7.2.0.1.2 | CP2, isoform 2 | T05680 | |||||||||||
6.7.2.0.1.3 | CP2, isoform 3 | T19332 | |||||||||||
6.7.2.0.2 | CP2-L1 (LBP-9, CRTR-1) | T05733 | |||||||||||
6.7.2.0.3 | UBP-1 (LBP-1, SEF, CP2b) | T01597 | |||||||||||
6.7.2.0.3.1 | UBP-1, isoform 1 | T19355 | |||||||||||
6.7.2.0.3.2 | UBP-1, isoform 2 | T08970 | |||||||||||
7 | Superclass: β-Hairpin exposed by an α/β-scaffold | ||||||||||||
7.1 | Class: SMAD/NF-1 DNA-binding domain factors | ||||||||||||
7.1.1 | Family: SMAD factors | GTCTAGAC | |||||||||||
7.1.1.1 | Subfamily: Regulatory Smads (R-Smad) | ||||||||||||
7.1.1.1.1 | SMAD1 | T04254 | |||||||||||
7.1.1.1.2 | SMAD2 | T04273 | |||||||||||
7.1.1.1.2.1 | SMAD2, isoform long | T09086 | |||||||||||
7.1.1.1.2.2 | SMAD2, isoform short | T26297 | |||||||||||
7.1.1.1.3 | SMAD3 | T04210 | |||||||||||
7.1.1.1.4 | SMAD5 | T04213 | |||||||||||
7.1.1.1.5 | SMAD9 (SMAD8) | T04215 | |||||||||||
7.1.1.2 | Subfamily: Co-activating Smads (Co-Smad) | ||||||||||||
7.1.1.2.1 | SMAD4 | T05067 | |||||||||||
7.1.1.3 | Subfamily: Repressor-Smads (I-Smad) | ||||||||||||
7.1.1.3.1 | SMAD6 | T04236 | |||||||||||
7.1.1.3.2 | SMAD7 | T04234 | |||||||||||
7.1.1.3.2.1 | SMAD7, isoform A | T08480 | |||||||||||
7.1.1.3.2.2 | SMAD7, isoform B | T25680 | |||||||||||
7.1.2 | Family: Nuclear factor 1 | TTGGCTATATGCCAA | |||||||||||
7.1.2.0.1 | NF-1A (NF-IA) | T15519 | |||||||||||
7.1.2.0.1.1 | NF-1A, isoform 1 | T26210 | |||||||||||
7.1.2.0.1.2 | NF-1A, isoform 2 | T19125 | |||||||||||
7.1.2.0.1.3 | NF-1A, isoform 3 | T19126 | |||||||||||
7.1.2.0.1.4 | NF-1A, isoform 4 | T26211 | |||||||||||
7.1.2.0.1.5 | NF-1A, isoform 5 | T08177 | |||||||||||
7.1.2.0.1.6 | NF-1A, isoform 6 | T08175 | |||||||||||
7.1.2.0.1.7 | NF-1A, isoform 7 | T08176 | |||||||||||
7.1.2.0.2 | NF-1B | T09201 | |||||||||||
7.1.2.0.2.1 | NF-1B, isoform 1 | T08170 | |||||||||||
7.1.2.0.2.2 | NF-1B, isoform 2 | T01909 | |||||||||||
7.1.2.0.2.3 | NF-1B, isoform 3 | T01910 | |||||||||||
7.1.2.0.3 | NF-1C | T09202 | |||||||||||
7.1.2.0.3.1 | NF-1C, isoform 1 (C1A, C2) | T08183 | |||||||||||
7.1.2.0.3.2 | NF-1C, isoform 2 (C1B) | T08184 | |||||||||||
7.1.2.0.3.3 | NF-1C, isoform 3 (C5) | T08188 | |||||||||||
7.1.2.0.3.4 | NF-1C, isoform 4 (C8) | T08189 | |||||||||||
7.1.2.0.3.5 | NF-1C, isoform 5 (C9) | T08190 | |||||||||||
7.1.2.0.3.6 | NF-1C, isoform 6 (C10) | T08185 | |||||||||||
7.1.2.0.3.7 | NF-1C, isoform 7 (C11) | T08186 | |||||||||||
7.1.2.0.4 | NF-1X | T09203 | |||||||||||
7.1.2.0.4.1 | NF-1X, isoform 1 | T08173 | |||||||||||
7.1.2.0.4.2 | NF-1X, isoform 2 | T08174 | |||||||||||
7.1.2.0.4.3 | NF-1X, isoform 3 | T08194 | |||||||||||
7.2 | Class: GCM domain factors | ||||||||||||
7.2.1 | Family: GCM factors | ||||||||||||
7.2.1.0.1 | GCMa (GCM1) | T02307 | |||||||||||
7.2.1.0.2 | GCMb (GCM2) | T02308 | |||||||||||
8 | Superclass: β-Sheet binding to DNA | ||||||||||||
8.1 | Class: TATA-binding proteins | ||||||||||||
8.1.1 | Family: TBP-related factors | TATAAA) | |||||||||||
8.1.1.0.1 | TBP | T00796 | |||||||||||
8.1.1.0.2 | TBP-L1 (TRF2) | T23344 | |||||||||||
8.1.1.0.3 | TBP-L2 (TRF3) | T20141 | |||||||||||
8.2 | Class: A.T hook factors | ||||||||||||
8.2.1 | Family: HMGA factors | GGAAATT | |||||||||||
8.2.1.0.1 | HMGA1 (HMGI(Y)) | T01852 | |||||||||||
8.2.1.0.1.1 | HMGA1a, isoform HMG-I | T19006 | |||||||||||
8.2.1.0.1.2 | HMGA1b, isoform HMG-Y | T10672 | |||||||||||
8.2.1.0.2 | HMGA2 (HMGI-C) | T01860 | |||||||||||
9 | Superclass: β-Barrel DNA-binding domains | ||||||||||||
9.1 | Class: Cold-shock domain factors | ||||||||||||
9.1.1 | Family: Dbp factors | CCAATCAG | |||||||||||
9.1.1.1 | Subfamily: A (DbpA-like) | ||||||||||||
9.1.1.1.1 | DbpA (YBX3, CSDA) | T11073 | |||||||||||
9.1.1.1.1.1 | DbpA, isoform 1 | ||||||||||||
9.1.1.1.1.2 | DbpA, isoform 2 | T26082 | |||||||||||
9.1.1.2 | Subfamily: B (DbpB/YB-1-like) | ||||||||||||
9.1.1.2.1 | YB-1 (DbpB, YBX1) | T02496 | |||||||||||
9.1.1.3 | Subfamily: C (FRG Y2-like) | ||||||||||||
9.1.1.3.1 | YBX2 (DbpC, MSY2, FRG Y2) | T | |||||||||||
9.1.1.3.1.1 | YBX2, isoform 1 | T | |||||||||||
9.1.1.3.1.2 | YBX2, isoform 2 | T | |||||||||||
0 | Superclass: Yet undefined DNA-binding domains | ||||||||||||
0.1 | Class: AXUD/CSRNP domain factors | ||||||||||||
0.1.1 | Family: CSRNP factors | AGAGTG | |||||||||||
0.1.1.0.1 | CSRNP-1 (AXUD1, TAIP3) | T | |||||||||||
0.1.1.0.2 | CSRNP-2 (TAIP12) | T | |||||||||||
0.1.1.0.3 | CSRNP-3 (TAIP2) | T27840 | F | ||||||||||
0.1.1.0.3.1 | CSRNP-3, isoform 1 | T27918 | |||||||||||
0.1.1.0.3.2 | CSRNP-3, isoform 2 | T27343 | |||||||||||
0.2 | Class: NonO domain factors | ||||||||||||
0.2.1 | Family: NonO-related factors | ||||||||||||
0.2.1.0.1 | NONO (NMT55, p54(nrb), NRB54) | T26600 | |||||||||||
0.2.1.0.1.1 | NONO, isoform 1 | T26833 | |||||||||||
0.2.1.0.1.2 | NONO, isoform 2 | T26845 | |||||||||||
0.2.1.0.2 | SFPQ (PSF) | T | |||||||||||
0.2.1.0.3 | PSPC1 (PSP1, Paraspeckle component 1) | T27851 | |||||||||||
0.2.1.0.3.1 | PSPC1, isoform 1 (PSP1-α) | T27356 | |||||||||||
0.2.1.0.3.2 | PSPC1, isoform 2 (PSP1-β) | T27931 | |||||||||||
0.3 | Class: Leucine-rich repeat flightless-interacting proteins | ||||||||||||
0.3.1 | Family: LRRFIP factors | AGCCCCCGGCG | |||||||||||
0.3.1.0.1 | LRRFIP1 (GCF2, TRIP) | T | |||||||||||
0.3.1.0.1.1 | LRRFIP1, isoform 1 | T | |||||||||||
0.3.1.0.1.2 | LRRFIP1, isoform 2 | T | |||||||||||
0.3.1.0.1.3 | LRRFIP1, isoform 3 | T | |||||||||||
0.3.1.0.2 | LRRFIP2 | T27834 | |||||||||||
0.3.1.0.2.1 | LRRFIP2, isoform 1 | T27888 | |||||||||||
0.3.1.0.2.2 | LRRFIP2, isoform 2 | T27238 | |||||||||||
0.4 | Class: NFX1-type putative zinc finger factors | ||||||||||||
0.4.1 | Family: NFX1 | CCTAGCAACAGATG | |||||||||||
0.4.1.0.1 | NFX1 (NFX2) | T20048 | |||||||||||
0.4.1.0.1.1 | NFX1, isoform 1 (NFX-123) | T20047 | |||||||||||
0.4.1.0.1.2 | NFX1, isoform 2 | T20049 | |||||||||||
0.4.1.0.1.3 | NFX1, isoform 3 (NFX-91) | T20050 | |||||||||||
0.4.1.0.2 | NFXL1 (OZFP) | T | |||||||||||
0.4.1.0.3 | ZNFX1 | T | |||||||||||
0.0 | Class: Uncharacterized | ||||||||||||
0.0.1 | Family: Nuclear localized protein 1 | ||||||||||||
0.0.1.0.1 | NULP1 (TCF25) | T | |||||||||||
0.0.1.0.1.1 | NULP1, isoform 1 | T | |||||||||||
0.0.1.0.1.2 | NULP1, isoform 2 | T | |||||||||||
0.0.1.0.1.3 | NULP1, isoform 3 | T | |||||||||||
0.0.1.0.1.4 | NULP1, isoform 4 | T | |||||||||||
0.0.1.0.1.5 | NULP1, isoform 5 | T | |||||||||||
0.0.2 | Family: PHF5 | ||||||||||||
0.0.2.0.1 | PHF5A (Ini, SF3b14b) | T | |||||||||||
0.0.3 | Family: RFXANK | CAGTTGCCTAGCAACTA | |||||||||||
0.0.3.0.1 | RFXANK (ANKRA1, RFXB, Tvl-1) | T11076 | |||||||||||
0.0.3.0.1.1 | RFXANK, isoform 1 (long) | T05445 | |||||||||||
0.0.3.0.1.2 | RFXANK, isoform 2 (short) | T05446 | |||||||||||
0.0.4 | Family: RFXAP | CAGTTGCCTAGCAACTA | |||||||||||
0.0.4.0.1 | RFXAP | T05447 | |||||||||||
0.0.5 | Family: PUR | TGGCCAGGG | |||||||||||
0.0.5.0.1 | Pur-α (PURA, PUR1) | T05167 | |||||||||||
0.0.5.0.2 | Pur-β (PURB) | T05172 | |||||||||||
0.0.5.0.3 | Pur-γ (PURG) | T27852 | |||||||||||
0.0.5.0.3.1 | Pur-γ, isoform 1 (PURG-A) | T27357 | |||||||||||
0.0.5.0.3.2 | Pur-γ, isoform 2 (PURG-B) | T27358 | |||||||||||
0.0.6 | Family: NRF | CGCATGCGCA | |||||||||||
0.0.6.0.1 | NRF-1 (α-pal) | T05126 | |||||||||||
0.0.6.0.1.1 | NRF-1, isoform 1 (long) | T10598 | |||||||||||
0.0.6.0.1.2 | NRF-1, isoform 2 (short) | T26228 | |||||||||||